混淆通過刪除從未用過的代碼和使用晦澀名字重命名類、字段和方法，對代碼進行壓縮，優化和混淆。結果是一個比較小的.apk文件，該文件比較難進行逆向工程。
某些情況下，proguard文件的缺省配置可以滿足需求了。但是，對於混淆器來說，大多數情況做出正確的分析是困難的，並且它或許會刪除在它看來是無用的，但對於程序來說卻確實需要的代碼。
注意：jar包現在基本上是無法混淆的，用工具就可以直接看到你的jar包的源碼。所以這裏的混淆是針對apk混淆
低版本 SDK 下，項目中同時包含 proguard.cfg 和 project.properties 文件，則只需在 project.properties 文件末尾添加 proguard.config=proguard.cfg 再將項目 Export 即可。
高版本 SDK 下，項目中同時包含 proguard-project.txt 和 project.properties 文件，這時需要在 proguard-project.txt 文件中進行如下信息的配置，然後再將項目 Export 即可。
在Android的SDK低版本中，混淆配置文件是proguard.cfg。在新版SDK中（例如4.0以上版本）用的是proguard-project.txt。用法和配置都是一樣的。現在以高版本爲例簡要說明下配置文件：
# This file is automatically generated by Android Tools.
# Do not modify this file -- YOUR CHANGES WILL BE ERASED!
#
# This file must be checked in Version Control Systems.
#
# To customize properties used by the Ant build system edit
# "ant.properties", and override values to adapt the script to your
# project structure.
#
# To enable ProGuard to shrink and obfuscate your code, uncomment this (available properties: sdk.dir, user.home):
#proguard.config=${sdk.dir}/tools/proguard/proguard-android.txt:proguard-project.txt
# Project target.
target=android-19
將proguard-project.txt裏的#proguard.config=${sdk.dir}/tools/proguard/proguard-android.txt:proguard-project.txt前的#去掉。
這樣就開啓了混淆工作。當然如果你的APK簽名導出了的話，Android會默認給你混淆一下。
默認的混淆配置文件是這樣的：
# To enable ProGuard in your project, edit project.properties
# to define the proguard.config property as described in that file.
#
# Add project specific ProGuard rules here.
# By default, the flags in this file are appended to flags specified
# in ${sdk.dir}/tools/proguard/proguard-android.txt
# You can edit the include path and order by changing the ProGuard
# include property in project.properties.
#
# For more details, see
# http://developer.android.com/guide/developing/tools/proguard.html
# Add any project specific keep options here:
# If your project uses WebView with JS, uncomment the following
# and specify the fully qualified class name to the JavaScript interface
# class:
#-keepclassmembers class fqcn.of.javascript.interface.for.webview {
# public *;
#}
#代表已經註釋掉了這一樣，去掉#號就是取消註釋這一行。
-keep這個參數是表示哪些類不被混淆
下面大概說下配置含義：（部分前綴dont代表don’t）
-optimizationpasses 5 設置混淆的壓縮比率 0 ~ 7 # 指定代碼的壓縮級別
-dontwarn 包名.** --------告訴ProGuard不要警告找不到包名.**這個包裏面的類的相關引用
-dontusemixedcaseclassnames #是否使用大小寫混合
-dontskipnonpubliclibraryclasses # 是否混淆第三方jar
-dontpreverify # 混淆時是否做預校驗
-verbose # 混淆時是否記錄日誌
-optimizations !code/simplification/arithmetic,!field/*,!class/merging/* # 混淆時所採用的算法
-keep public class * extends android.app.Activity # 保持哪些類不被混淆
-keep public class * extends android.app.Application # 保持哪些類不被混淆
-keep public class * extends android.app.Service # 保持哪些類不被混淆
-keep public class * extends android.content.BroadcastReceiver # 保持哪些類不被混淆
-keep public class * extends android.content.ContentProvider # 保持哪些類不被混淆
-keep public class * extends android.app.backup.BackupAgentHelper # 保持哪些類不被混淆
-keep public class * extends android.preference.Preference # 保持哪些類不被混淆
-keep public class com.android.vending.licensing.ILicensingService # 保持哪些類不被混淆
-keepclasseswithmembernames class * { # 保持 native 方法不被混淆
native <methods>;
}
-keepclasseswithmembers class * { # 保持自定義控件類不被混淆
public <init>(android.content.Context, android.util.AttributeSet);
}
-keepclasseswithmembers class * { # 保持自定義控件類不被混淆
public <init>(android.content.Context, android.util.AttributeSet, int);
}
-keepclassmembers class * extends android.app.Activity { # 保持自定義控件類不被混淆
public void *(android.view.View);
}
-keepclassmembers enum * { # 保持枚舉 enum 類不被混淆
public static **[] values();
public static ** valueOf(java.lang.String);
}
-keep class * implements android.os.Parcelable { # 保持 Parcelable 不被混淆
public static final android.os.Parcelable$Creator *;
}
-keep class MyClass; # 保持自己定義的類不被混淆
-keep class **.R$* { *; }//過濾R文件的混淆 -keep class packagename.** {*;}//過濾第三方包的混淆（其中packagename爲第三方包的包名）
-injars libs\your_library.jar //表示你要混淆的jar文件
-outjars libs\your_library_out.jar //是混淆後的jar文件名