IIS 6.0 可支持 32 位和 64 位兩種模式。但是，IIS 6.0 不支持在 64 位版本的 Windows 上同時運行這兩種模式。ASP.NET 1.1 只在 32 位模式下運行。而 ASP.NET 2.0 在 32 位或 64 位模式下都可以運行。因此，如果想要同時運行 ASP.NET 1.1 和 ASP.NET 2.0，必須在 32 位模式下運行 IIS。
要在 ASP.NET 的不同版本之間切換，請訪問以下 Microsoft Developer Network (MSDN) 網站以下載並安裝 ASP.NET 1.1 和 ASP.NET 2.0：
http://msdn2.microsoft.com/en-us/netframework/aa731542.aspx (http://msdn2.microsoft.com/en-us/netframework/aa731542.aspx)
例如，如果您正在運行 Microsoft Windows x64 Edition，請下載以下兩種可再發行組件包：
.NET Framework 版本 2.0 可再發行組件包 x64（64 位）
.NET Framework 版本 1.1 可再發行組件包
安裝可再發行組件包後，您就可以在 ASP.NET 的不同版本之間切換了。爲此，應對每個 ASP.NET 版本完成以下操作步驟：
ASP.NET 1.1，32 位版本
要運行 32 位版本的 ASP.NET 1.1，按照以下步驟操作：
單擊“開始”，單擊“運行”，鍵入 cmd，然後單擊“確定”。
鍵入以下命令啓用 32 位模式：
cscript %SYSTEMDRIVE%\inetpub\adminscripts\adsutil.vbs SET W3SVC/AppPools/Enable32bitAppOnWin64 1
鍵入以下命令，安裝 ASP.NET 1.1 版本並在 IIS 根目錄下安裝腳本映射：
%SYSTEMROOT%\Microsoft.NET\Framework\v1.1.4322\aspnet_regiis.exe -i
確保在 Internet 信息服務管理器的 Web 服務擴展列表中，將 ASP.NET 版本 1.1.4322 的狀態設置爲允許。
ASP.NET 2.0，32 位版本
要運行 32 位版本的 ASP.NET 2.0，請按照以下步驟操作：
單擊“開始”，單擊“運行”，鍵入 cmd，然後單擊“確定”。
鍵入以下命令啓用 32 位模式：
cscript %SYSTEMDRIVE%\inetpub\adminscripts\adsutil.vbs SET W3SVC/AppPools/Enable32bitAppOnWin64 1
鍵入以下命令，安裝 ASP.NET 2.0（32 位）版本並在 IIS 根目錄下安裝腳本映射：
%SYSTEMROOT%\Microsoft.NET\Framework\v2.0.40607\aspnet_regiis.exe -i
確保在 Internet 信息服務管理器的 Web 服務擴展列表中，將 ASP.NET 版本 2.0.40607（32 位）的狀態設置爲允許。
ASP.NET 2.0，64 位版本
要運行 64 位版本的 ASP.NET 2.0，請按照以下步驟操作：
單擊“開始”，單擊“運行”，鍵入 cmd，然後單擊“確定”。
鍵入以下命令禁用 32 位模式：
cscript %SYSTEMDRIVE%\inetpub\adminscripts\adsutil.vbs SET W3SVC/AppPools/Enable32bitAppOnWin64 0
鍵入以下命令，安裝 ASP.NET 2.0 版本並在 IIS 根目錄下安裝腳本映射：
%SYSTEMROOT%\Microsoft.NET\Framework64\v2.0.40607\aspnet_regiis.exe -i
確保在 Internet 信息服務管理器的 Web 服務擴展列表中，將 ASP.NET 版本 2.0.40607 的狀態設置爲允許。
注意：ASP.NET 2.0 的內部版本可能隨當前發行的內部版本的變化而變化。這些步驟適用於內部版本 2.0.40607。
以下內容來自：http://support.microsoft.com/?id=895976
在 64 位版本的 Windows Server 2003 已安裝 SP 1 的上, IIS 啓動 32 位輔助進程或 64 位工作進程，根據爲以下元數據庫屬性中的值：
W 3 SVC / AppPool / Enable32bitAppOnWin64
IIS 6.0 啓動 64 位工作進程 Enable32bitAppOnWin64 屬性值爲 0 時或當屬性爲缺少。 如果該 Enable32bitAppOnWin64 屬性是存在屬性，且值是 0 以外，IIS 6.0 將啓動 32 位工作進程。
IIS 6.0 不能確保該配置 ISAPI 篩選器 DLL 和 ISAPI 擴展 DLL 可以實際加載工作進程中。 您必須確保僅 32 位 ISAPI DLL 被配置爲 32 位工作進程中加載或只有 64 位 ISAPI DLL 被配置爲在 64 位工作進程中加載。
如果配置 32 位 ISAPI 篩選器在 64 位工作進程中加載的 DLL 或配置 64 位 ISAPI 篩選器 DLL 加載 32 位工作進程中，與以下內容類似的錯誤消息可能被寫入應用程序日誌：
------------------------------------------
事件類型： 錯誤
事件來源： W3SVC-WP
事件類別： 無
事件 ID： 2268
說明：
無法加載站點 / 服務的所有 ISAPI 篩選器。 因此啓動中止。
數據： 0000: c 1 00 00 00
------------------------------------------
如果您配置 32 位 ISAPI 擴展 DLL 加載 64 位工作進程中，或者如果您配置 64 位 ISAPI 擴展 DLL 加載 32 位工作進程中，也可能會收到 500 錯誤響應的包含以下文本：
------------------------------------------
%1 不是有效的 Win 32 應用程序
------------------------------------------
我們還建議您使用 32 位調試程序來解決 32 位 Web 應用程序。 或者，使用 64 位調試程序解決 64 位 Web 應用程序。 轉儲文件信息可能無法準確如果使用下列方法之一：
您可以使用 64 位調試程序調試一個 32 位進程或應用程序。
您使用 32 位調試器調試 64 位進程或應用程序。
