出身
hibernate：出身於.NET（開發平臺），現在已成爲JBoss（類似於Tomcat服務器）的一部分。
mybatis：屬於Apache（開發組織）的子項目。
簡介
hibernate：對數據庫提供了較爲完整的封裝，尤其是實體和表之間的映射，以及SQL的自動生成和執行。我們往往只需要定義實體和表的映射，即可通過hibernate提供的方法完成持久層操作，甚至我們不需要對SQL熟練掌握，hibernate會根據制定的儲存邏輯，自動的生成對應的SQL，並調用JDBC接口加以執行。
mybatis：mybatis的着力點在於實體與表之間的映射，然後通過配置文件，將SQL所需的參數，以及返回的結果映射到指定的實體。
開發速度
hibernate：學習成本大，掌握起來要比mybatis難，不易上手，支持的工具多，更新快，最高版本5.2，開發者無需關注sql語句的使用。
mybatis：學習成本低，掌握相比hibernate簡單，易上手，支持工具少，更新慢，最高版本3.4，開發者必須着力用sql語句。
調優方面
hibernate：1、制定合理緩存策略；2、儘量使用延遲加載；3、採用合理的session管理機制；4、使用批量抓取，設定合理的批處理參數；5、進行實體和表合理的映射。
mybatis：1、session同hibernate的session生命週期一致，同樣需要合理的session管理機制；2、同樣有二級緩存機制，指定合理緩存策略；3、詳細的sql優化設計。
SQL優化方面
hibernate：默認查詢會將所有的字段查詢出來，這一點會消耗性能，也可以自己手寫sql，但是這樣就破壞了hibernate開發的簡潔性。hibernate有自己的日誌統計。
mybatis：由於是手動編寫的sql，所以可以按需求指定查詢字段。mybatis本身不帶日誌統計，使用第三方採集日誌，如：log4j。
擴展性方面
hibernate：與數據庫的關聯只需在xml文件中配置即可，所用的hql語句與具體使用的數據庫無關，移植性很好。
mybatis：項目中所用的sql語句都是依賴所用的數據庫，所以不同的數據庫類型，支持的不是很好。
操作方面
hibernate：開發者不需要理會底層數據庫系統的細節，只需要關注對象的狀態。hibernate對實體關聯（多表查詢）有着良好的機制，對於每一個關聯關係都可以詳細的設置是否延遲加載，並且提供關聯查詢，查詢抓取，子查詢抓取，批量抓取四種模式，他是詳細配置和處理的。
mybatis：開發者需要手動編寫sql語句，需要對sql參數以及結果進行詳細的管理。
緩存機制方面
hibernate：hibernate有一級（session緩存，默認開啓），二級（sessionFactory緩存，又分爲內置緩存和外置緩存，默認關閉），查詢緩存（默認關閉）。
mybatis：mybatis有一級（session緩存，默認開啓），二級緩存（sessionFactory緩存，默認關閉）。和spring集成後一級緩存會失效，二級緩存可能出現髒讀。所以很難用。
相同點：
兩者的二級緩存除了系統默認的配置外，都可以通過自定義或者使用第三方緩存方案。因爲兩者都是用session開啓事物，執行sql，並且生命週期大致相同。
不同點：
hibernate：二級緩存針對的是實體與表之間映射的緩存。如果因爲緩存出現了髒讀，系統會報出錯誤並提示。
mybatis：二級緩存根據配置文件中namespace的命名來進行緩存，不同的namespace可以制定不同的緩存機制。因此用二級緩存容易有髒讀，並且不會提示。
一句話總結
hibernate：強大、方便、高效、複雜、間接、全自動化。
mybatis：小巧、方便、高效、簡單、直接、半自動化。