1、配置系統管理（Admin Web Application）
大多數商業化的J2EE服務器都提供一個功能強大的管理界面，且大都採用易於理解的Web應用界面。Tomcat按照自己的方式，同樣提供一個成熟的管理工具，並且絲毫不遜於那些商業化的競爭對手。Tomcat的Admin Web Application最初在4.1版本時出現，當時的功能包括管理context、data source、user和group等。當然也可以管理像初始化參數，user、group、role的多種數據庫管理等。在後續的版本中，這些功能將得到很大的擴展，但現有的功能已經非常實用了。Admin Web Application被定義在自動部署文件：CATALINA_BASE/webapps/admin.xml 。（譯者注：CATALINA_BASE即tomcat安裝目錄下的server目錄）
你必須編輯這個文件，以確定Context中的docBase參數是絕對路徑。也就是說，CATALINA
_BASE/webapps/admin.xml的路徑是絕對路徑。作爲另外一種選擇，你也可以刪除這個自動部署文件，而在server.xml文件中建立一個Admin Web Application的context，效果是一樣的。你不能管理Admin Web Application這個應用，換而言之，除了刪除CATALINA_BASE/webapps/admin.xml ，你可能什麼都做不了。
如果你使用UserDatabaseRealm（默認），你將需要添加一個user以及一個role到CATALINA_BASE/conf/tomcat-users.xml文件中。你編輯這個文件，添加一個名叫“admin”的role 到該文件中，如下：
<role name="admin"/>
同樣需要有一個用戶，並且這個用戶的角色是“admin”。象存在的用戶那樣，添加一個用戶（改變密碼使其更加安全）：
<ser name="admin"
password="deep_dark_secret"
roles="admin"/>
你完成這些步驟後，請重新啓動Tomcat，訪問http://localhost:8080/admin，你將看到一個登錄界面。Admin Web Application採用基於容器管理的安全機制，並採用了Jakarta Struts框架。一旦你作爲“admin”角色的用戶登錄管理界面，你將能夠使用這個管理界面配置Tomcat。
2、配置應用管理（Manager Web Application）
Manager Web Application讓你通過一個比Admin Web Application更爲簡單的用戶界面，執行一些簡單的Web應用任務。Manager Web Application被被定義在一個自動部署文件中：
CATALINA_BASE/webapps/manager.xml
你必須編輯這個文件，以確保context的docBase參數是絕對路徑，也就是說CATALINA_HOME/server/webapps/manager的絕對路徑。（譯者注：CATALINA_HOME即tomcat安裝目錄）
如果你使用的是UserDatabaseRealm，那麼你需要添加一個角色和一個用戶到CATALINA_BASE/conf/tomcat-users.xml文件中。接下來，編輯這個文件，添加一個名爲“manager”的角色到該文件中：
<role name=”manager”>
同樣需要有一個角色爲“manager”的用戶。像已經存在的用戶那樣，添加一個新用戶（改變密碼使其更加安全）：
<user name="manager"
password="deep_dark_secret"
roles="manager"/>
然後重新啓動Tomcat，訪問http://localhost/manager/list，將看到一個很樸素的文本型管理界面，或者訪問http://localhost/manager/html/list，將看到一個HMTL的管理界面。不管是哪種方式都說明你的Manager Web Application現在已經啓動了。
Manager application讓你可以在沒有系統管理特權的基礎上，安裝新的Web應用，以用於測試。如果我們有一個新的web應用位於/home/user/hello下在，並且想把它安裝到/hello下，爲了測試這個應用，我們可以這麼做，在第一個文件框中輸入“/hello”（作爲訪問時的path），在第二個文本框中輸入“file:/home/user/hello”（作爲Config URL）。
Manager application還允許你停止、重新啓動、移除以及重新部署一個web應用。停止一個應用使其無法被訪問，當有用戶嘗試訪問這個被停止的應用時，將看到一個503的錯誤??“503 - This application is not currently available”。
移除一個web應用，只是指從Tomcat的運行拷貝中刪除了該應用，如果你重新啓動Tomcat，被刪除的應用將再次出現（也就是說，移除並不是指從硬盤上刪除）。
3、部署一個web應用
有兩個辦法可以在系統中部署web服務。
1. 拷貝你的WAR文件或者你的web應用文件夾（包括該web的所有內容）到$CATALINA_BASE/webapps目錄下。
2. 爲你的web服務建立一個只包括context內容的XML片斷文件，並把該文件放到$CATALINA_BASE/webapps目錄下。這個web應用本身可以存儲在硬盤上的任何地方。
如果你有一個WAR文件，你若想部署它，則只需要把該文件簡單的拷貝到CATALINA_BASE/webapps目錄下即可，文件必須以“.war”作爲擴展名。一旦Tomcat監聽到這個文件，它將（缺省的）解開該文件包作爲一個子目錄，並以WAR文件的文件名作爲子目錄的名字。
接下來，Tomcat將在內存中建立一個context，就好象你在server.xml文件裏建立一樣。當然，其他必需的內容，將從server.xml中的DefaultContext獲得。
部署web應用的另一種方式是寫一個Context XML片斷文件，然後把該文件拷貝到CATALINA_BASE/webapps目錄下。一個Context片斷並非一個完整的XML文件，而只是一個context元素，以及對該應用的相應描述。
這種片斷文件就像是從server.xml中切取出來的context元素一樣，所以這種片斷被命名爲“context片斷”。
舉個例子，如果我們想部署一個名叫MyWebApp.war的應用，該應用使用realm作爲訪問控制方式，我們可以使用下面這個片斷：
<!--
Context fragment for deploying MyWebApp.war
-->
<Context path="/demo"
docBase="webapps/MyWebApp.war"
debug="0" privileged="true">
<Realm className=
"org.apache.catalina.realm.UserDatabaseRealm"
resourceName="UserDatabase"/>
</Context>
把該片斷命名爲“MyWebApp.xml”，然後拷貝到CATALINA_BASE/webapps目錄下。
這種context片斷提供了一種便利的方法來部署web應用，你不需要編輯server.xml，除非你想改變缺省的部署特性，安裝一個新的web應用時不需要重啓動Tomcat。
4、配置虛擬主機（Virtual Hosts）
關於server.xml中“Host”這個元素，只有在你設置虛擬主機的才需要修改。虛擬主機是一種在一個web服務器上服務多個域名的機制，對每個域名而言，都好象獨享了整個主機。實際上，大多數的小型商務網站都是採用虛擬主機實現的，這主要是因爲虛擬主機能直接連接到Internet並提供相應的帶寬，以保障合理的訪問響應速度，另外虛擬主機還能提供一個穩定的固定IP。
基於名字的虛擬主機可以被建立在任何web服務器上，建立的方法就是通過在域名服務器（DNS）上建立IP地址的別名，並且告訴web服務器把去往不同域名的請求分發到相應的網頁目錄。因爲這篇文章主要是講Tomcat，我們不準備介紹在各種操作系統上設置DNS的方法，如果你在這方面需要幫助，請參考《DNS and Bind》一書，作者是Paul Albitz and Cricket Liu (O'Reilly)。爲了示範方便，我將使用一個靜態的主機文件，因爲這是測試別名最簡單的方法。
在Tomcat中使用虛擬主機，你需要設置DNS或主機數據。爲了測試，爲本地IP設置一個IP別名就足夠了，接下來，你需要在server.xml中添加幾行內容，如下：
<Server port="8005"
shutdown="SHUTDOWN" debug="0">
<Service name="Tomcat-Standalone">
<Connector className=
"org.apache.coyote.tomcat4.CoyoteConnector"
port="8080"
minProcessors="5" maxProcessors="75"
enableLookups="true"
redirectPort="8443"/>
<Connector className=
"org.apache.coyote.tomcat4.CoyoteConnector"
port="8443" minProcessors="5"
maxProcessors="75"
acceptCount="10" debug="0"
scheme="https" secure="true"/>
<Factory className="org.apache.coyote.
tomcat4.CoyoteServerSocketFactory"
clientAuth="false" protocol="TLS" />
</Connector>
<Engine name="Standalone"
defaultHost="localhost" debug="0">
<!-- This Host is the default Host -->
<Host name="localhost"
debug="0" appBase="webapps"
unpackWARs="true" autoDeploy="true">
<Context path="" docBase="ROOT" debug="0"/>
<Context path="/orders"
docBase="/home/ian/orders" debug="0"
reloadable="true" crossContext="true">
</Context>
</Host>
<!-- This Host is the first
"Virtual Host": http://www.example.com/ -->
<Host name="www.example.com"
appBase="/home/example/webapp">
<Context path="" docBase="."/>
</Host>
</Engine>
</Service>
</Server>
Tomcat的server.xml文件，在初始狀態下，只包括一個虛擬主機，但是它容易被擴充到支持多個虛擬主機。在前面的例子中展示的是一個簡單的server.xml版本，其中粗體部分就是用於添加一個虛擬主機。每一個Host元素必須包括一個或多個context元素，所包含的context元素中必須有一個是默認的context，這個默認的context的顯示路徑應該爲空（例如，path=””）。