一、報關流程
(一)進境入區流程
1.加工貿易所需進境料件、轉口貨物、倉儲貨物適用進境備案手續。
2.貨物到達港後，收貨人或其代理人到預錄入點辦理進境貨物備案清單預錄入手續（加工貿易進境料件在加工企業預錄入，倉儲、轉口貨物在倉庫預錄入），預錄入按“進出境備案清單填制規範”填寫。
3.將預錄入數據向海關發送申報，待接到接受申報回執後，打印進境貨物備案清單
4.在備案清單上籤署報送員名字，並加蓋報關章，隨附報送員證、提單（包括小提單）、相關商業單證、運輸單證、原產地證書、《進口信用證、託收承兌/付匯情況表》、審批單證及其他海關認爲必要時需交驗的有關單證和資料到海關裏書面交單申報手續
5.海關接單後，經審覈符合申報條件、手續齊全有效的，予以放行，並在有關單證上加蓋放行章或驗訖章，將蓋單證返還報關員辦理提貨手續
6.貨物須由海關監管車輛從碼頭（機場等）承運至保稅區內
(二)出區出境流程
1.保稅區運往境外的貨物適用出境備案手續
2.發貨人或其代理人到預錄入點辦理出境備案清單預錄入手續，預錄入按“進出境備案清單填制規範”填寫。
3.將預錄入數據向海關發送申報，待收到申報加執後，打印出境貨物備案清單
4.在備案清單上籤署報關員名字，並加蓋報關章，隨附報關員證、相關商業單證、運輸單證、審批單證及其他海關認爲必要時需交驗的有關單證和資料到海關辦理書面申報手續。
5.海關接單後，經審覈符合申報條件、手續齊全有效的。予以放行，並在關單證上加蓋放行章或驗訖章，將蓋章單證返還報關員辦理貨物裝船出運手續。
6.貨物須由海關監管車輛從保稅區承運至碼頭（機場等）。
(三)二線入區流程
1.除加工貿易進境料件、轉口貨物和倉儲貨物外的從境外運入保稅區，或者從保稅區運往非保稅區，或者從境外通過保稅區報關直接運往非保稅區的貨物適用進口報送手續。
2. 收（發）貨人或其他代理人到預錄入點辦理進口報關單預錄入手續，按“報關單填制規範”填寫;
3.將預錄入數據向海關發送申報，待接到接受申報回執後，打印進口報關單;
4. 在報送單上籤署報關員名字，加蓋報關章，隨附報關員證、相關商業單證、運輸單證、審批單證及其他海關認爲必要時需交驗的有關單證和資料到海關辦理書面交單申報手續;
5.海關接單後，經審覈符合申報條件、手續齊全有效的，予以放行，並在相關單證上加蓋放行章或驗訖章，將蓋章單證返還報關員輸提貨手續;
6.入區貨物須由海關監管車輛從碼頭（機場等）承運至保稅區。
(四)二線出區流程
1.從非保稅區運往保稅區的貨物適用出口報送手續
2.貨物先運入保稅區或直接運入碼頭後，發貨人或其代理人到預錄入點辦理出口報關單預錄入手續，預錄入按“報關單填制規範”填寫;
3. 將預錄入數據向海關發送申報，待接到申報回執後，打印出口報關單
4.在報關單上籤署報關員名字，加蓋報關章，隨附報關員證、相關商業單證、運輸單證、審批單證及其他海關認爲必要時需交驗的有關單證和資料到海關辦理書面交單申報手續
5.海關接單後，經審覈符合申報條件、手續齊全有效的，予以放行過機，並在相關單證上加蓋放行章或驗訖章，將蓋章單證返還報關員輸貨物進區手續
二、轉關流程
（一）進口轉關流程描述
直通式進口轉關
1.直通關代理在口岸海關申報轉關
2.口岸海關車輛、關鎖、貨物進監管倉
3.保稅區海關驗覈車輛、關鎖，貨物進監管倉
4.直通關代理到保稅區海關遞交轉關申報單，保稅區海關轉關覈銷
5.轉關崗位完成審覈，在轉關核放單或申報單和車輛載貨登記薄上批註簽章。將一聯轉關核放單或轉關申報單做海關關封，關封密封口蓋章後與監管車輛載貨登記薄一併交給報關員帶到對方海關
6.企業進口報送，報關單後應附相對應的轉關申報單。
提前申報式進口轉關
1.企業在保稅區海關提前轉關報關，按“報關單填制規範”填寫，並填報承運監管車隊。車輛備案代碼
2.企業到口岸海關輸轉關
3.口岸海關車輛施加關鎖，轉關放行
4.保稅區海關驗覈車輛、並鎖，貨物進監管倉
5.企業到保稅區海關遞交進口報關單
6.保稅區海關轉關覈銷，實物放行
（二）出口轉關作業流程描述
1.轉關監管貨物裝車
2.轉關監管車輛查驗加封
3.企業現場遞交報關單和出呂轉關申報單
4.保稅區海關審單放行（報關單和轉關申報單）、轉關崗位完成審覈，在轉關核放單或申報單和監管車輛載貨登記薄上批註簽章。將一聯轉關核放單或轉關申報單做海關關封，關封密封口蓋章後與監管車輛載貨登記薄一併交給報關員帶到對方海關
5.貨物在出境地出運，口岸海關出口覈銷艙單
6.保稅區海關結關