總結了網上幾位大大的方法，終於調試通過，方法如下：
1，在文件服務器上，創建一個本地帳戶，比如登錄名：upload，密碼：upload，注意在創建的時候選擇“密碼永不過期”，去掉勾選“用戶下次登錄時須更改密碼”的選項；
2，在要共享的文件夾上點右鍵，選擇“屬性”-“安全”，增加upload帳戶可以寫入的權限；
3，在要共享的文件夾上點右鍵，選擇“共享”，共享此文件夾，並在“權限”按鈕點擊後添加帳戶upload可修改；
4.需要在應用程序服務器的站點下任意新建一個虛擬目錄，然後“屬性”--》“連接到另一臺計算機”--》然後在路徑裏輸入“\\文件服務器的IP\共享的文件夾名稱”，確定即可
5，在另外一臺 Web 服務器上，創建登錄名和密碼與上面完全相同的本地帳戶。
6，在web.config裏，啓用模擬：
web.config裏添加的代碼
<identity impersonate="true" userName="upload" password="upload" />
7(可選).web站點的Global.asax文件里加載一句話，讓服務器站點啓動的時候就和文件服務器建立信任連接
System.Diagnostics.Process.Start("cmd.exe", "net use \\\\文件服務器的IP\\共享的文件夾名稱 \"123456\" /user:\"test\"");
最後保存的時候還是按平時保存文件的方式就行。
protected
void Button1_Click(object sender, EventArgs e)
{
string fileName= System.IO.Path.GetFileName(FileUpload1.PostedFile.FileName);
FileUpload1.SaveAs(@"\\192.168.3.1\free\"+ fileName);
}
1.以上步驟中的4，5必須按順序操作，如果後來刪除了虛擬目錄，則需要也刪除5中創建的用戶，然後按照4，5的順序再次創建即可（因爲本人後來直接刪除虛擬目錄並重新創建，而沒有刪除5中的用戶，出現了問題。）
2.在做完以上步驟需要繼續完成下載或打開功能時，如果出現要求輸入用戶名和密碼登錄共享文件夾的情況，而設置文件服務器的本地策略無果的時候，在虛擬目錄中重新創建一個默認站點之外的站點，指向這個共享文件夾即可（注意新建站點的端口是否衝突）。