1.網絡的延遲
由於mysql主從複製是基於binlog的一種異步複製，通過網絡傳送binlog文件，理所當然網絡延遲是主從不同步的絕大多數的原因，特別是跨機房的數據同步出現這種機率非常的大，所以做讀寫分離，注意從業務層進行前期設計。
2.主從兩臺機器的負載不一致
由於mysql主從複製是主數據庫上面啓動1個io線程，而從上面啓動1個sql線程和1個io線程，當中任何一臺機器的負載很高，忙不過來，導致其中的任何一個線程出現資源不足，都將出現主從不一致的情況。
3.max_allowed_packet設置不一致
主數據庫上面設置的max_allowed_packet比從數據庫大，當一個大的sql語句，能在主數據庫上面執行完畢，從數據庫上面設置過小，無法執行，導致的主從不一致。
4.key自增鍵開始的鍵值跟自增步長設置不一致引起的主從不一致。
5.mysql異常宕機情況下，如果未設置sync_binlog=1或者innodb_flush_log_at_trx_commit=1很有可能出現binlog或者relaylog文件出現損壞，導致主從不一致。
6.mysql本身的bug引起的主從不同步。
7.版本不一致，特別是高版本是主，低版本爲從的情況下，主數據庫上面支持的功能，從數據庫上面不支持該功能。