在使用Innodb引擎時將要面對兩種表空間的管理選擇的問題，Innodb有兩種管理表空間的方法：
1． 共享表空間（也可以拆分成多個小的表空間）
2． 獨立表空間每一個表有一個獨立的表空間。
我個人推薦使用獨立表空間。在性能和運維上獨立表空間比共享的表空間有很多優勢。下面我將分別說明一下兩種表空間管理的特點。
共享表空間：
優點：
可以放表空間分成多個文件存放到各個磁盤上（表空間文件大小不受表大小的限制，如一個表可以分佈在不同步的文件上）。數據和文件放在一起方便管理。
缺點：
所有的數據和索引存放到一個文件中以爲着將有一個很常大的文件，雖然可以把一個大文件分成多個小文件，但是多個表及索引在表空間中混合存儲，這樣對於一個表做了大量刪除操作後表空間中將會有大量的空隙，特別是對於統計分析，日值系統這類應用最不適合用共享表空間。
我們知道共享表空間管理會出現表空間分配後不能回縮的問題，當出現臨時建索引或是創建一個臨時表的操作表空間擴大後，就是刪除相關的表也沒辦法回縮那部分空間了。我們存在磁盤監控時，也許就報警不斷了，但實際上MySQL還可以運行良好。另外，當磁盤上佔用較多時性能也不是太好。
這種情況處理只能是是建一個新的Slave從主庫上Dump出來，然後在Dump到從庫中，動作較大。
對於InnoDB Hot Backup備份的操作（或是直接冷備），每次需要CP的文件比較大。如果現在有180G的表空間，但實際數據只有50多G，那麼我們將面對每次需要拷180G的數據。
這種方式也許mysqldump是一個好的處理方式了。
獨立表空間：
在配置文件（my.cnf）中設置： innodb_file_per_table
優點：
1． 每個表都有自已獨立的表空間。
2． 每個表的數據和索引都會存在自已的表空間中。
3． 可以實現單表在不同的數據庫中移動。
4． 空間可以回收（除drop table操作處，表空不能自已回收）
a) Drop table操作自動回收表空間，如果對於統計分析或是日值表，刪除大量數據後可以通過:alter table TableName engine=innodb;回縮不用的空間。
b) 對於使innodb-plugin的Innodb使用turncate table也會使空間收縮。
c) 對於使用獨立表空間的表，不管怎麼刪除，表空間的碎片不會太嚴重的影響性能，而且還有機會處理。
缺點：
單表增加過大，如超過100個G。
對於單表增長過大的問題，如果使用共享表空間可以把文件分開，但有同樣有一個問題，如果訪問的範圍過大同樣會訪問多個文件，一樣會比較慢。對於獨立表空間也有一個解決辦法是：使用分區表，也可以把那個大的表空間移動到別的空間上然後做一個連接。其實從性能上出發，當一個表超過100個G有可能響應也是較慢了，對於獨立表空間還容易發現問題早做處理。
備份：
InnoDB Hot Backup（冷備）的表空間cp不會面對很多無用的copy了。而且利用innodb hot backup及表空間的管理命令可以實現單現移動。
監控：
可以更好從系統上監控數據的大小，每個表的大小。
另外推薦使用獨立表空間的原因：
從性能上對比共享表空間和獨立表空間：
共享表空間在Insert操作上少有優勢。其它都沒獨立表空間表現好。這裏也有一個TIPS當啓用獨立表空間時，請合理調整一下：innodb_open_files 。
從Linux系統處理上出發：
文件系統fsync一大片更新數據，對系統io衝擊較大。若分隔成多個小數據fsync，能夠減少對讀的影響。同時從mysql代碼，發現mysql保證兩次fsync之間至少有20ms的sleep，這樣的話，若將一次fsync變成多次小數據操作，應該能夠減少慢查詢的比例。所以對於大量更新操作的系統不太適合用共享表空間。