一、安裝順序
我是先安裝anaconda3（python3.6.6），然後安裝cuda9.0+cudnnv7，最後從官網下載caffe(linux版)進行caffe編譯的，最後安裝matlabR2015b
ubuntu16.04截圖快捷鍵：對整個屏幕 Pr Scrn ，對某一個窗口alt+Pr Scrn,對一個區域(自定義的區域)shift+Pr Scrn
二、anaconda3的安裝
這部分以及cuda9.0的安裝網上有很多博客都說的很明白，一般沒有什麼太大問題，安裝完畢記得添加環境變量
1、anaconda3添加環境變量：
終端輸入：sudo gedit ~/.bashrc
export PATH="/home/zyn/anaconda3/bin:$PATH"\
2、卸載之前的cuda9.0
sudo /usr/local/cuda-9.0/bin/uninstall_cuda_9.0.pl
sudo rm -rf /usr/local/cuda-9.0
3、在網上找教程安裝cuda8.0（ubuntu下64位的且是deb版本的，runfile版本的比較難安裝）
三、編譯caffe
首先安裝caffe依賴包，此時不在caffe目錄下，而是在比如zyn@zyn-xps-8700:~$下
1、sudo apt-get install libprotobuf-dev libleveldb-dev libsnappy-dev libhadf5-serial-dev protobuf-compiler
sudo apt-get install --no-install-recommends libboost-all-dev
sudo apt-get install libatlas-base-dev
sudo apt-get install cmake
sudo apt-get libgflags-dev libgoogle-glog-dev liblmdb-dev
sudo apt-get install build_essential
一定要確保上述依賴包全部安裝成功，如若不成功，可先嚐試終端輸入sudo apt-get update以後再次安裝
2、如果需要使用caffe的python接口，則需要安裝/home/zyn/caffe/python下面的requirements.txt裏面要求的所有包
可以安裝依賴sudo apt-get install python-dev python-numpy
sudo apt-get gfortran（這句主要是爲了成功安裝scipy的，否則可能scipy安裝不成功）
sudo apt-get python-scipy
注：上述python依賴我是安裝了的，因爲我們之前已經安裝了anaconda，所以這一步也許可以省略掉，我不是很確定，開始我是沒有安裝這些依賴，後來安裝了下，可以試試先不安裝
在caffe目錄下輸入cd ./python
for req in $(cat requirements.txt); do pip install $req; done
然後就可以看到這個txt裏面列出的包是否已經全部成功安裝。
3、關於opencv的安裝
其實不用專門安裝opencv的，後面需要的caffe接口matlab裏面自帶的有opencv，python裏面也可以通過pip install python-opencv來安裝。在我將要運行的代碼裏面沒有使用opencv
4、配置Makefile.config
在caffe根目錄下輸入：cp Makefile.config.examples Makefile.config
然後修改Makefile.config，caffe根目錄下繼續輸入sudo gedit Makefile.config
在文件中可以通過ctrl+f來查找某一行
去掉USE_CUDNN := 1的註釋，去掉USE_OPENCV:=1的註釋，由於我沒有使用opencv，所以網上說的opencv_version:=3的註釋我沒有去掉。
使用cuda8.0，去掉-gencode arch=compute_20,code=sm_20 \
-gencode arch=compute_20,code=sm_21 \
#MATLAB_DIR := /usr/local改爲你自己的路徑，並去掉註釋：MATLAB_DIR := /home/zyn/MATLAB/R2015b
我在這個編譯裏沒有使用anaconda的python，使用系統自帶的，所以
PYTHON_INCLUDE := /usr/include/python2.7 \
/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/include
【注：如果你們使用anaconda的python,可以將上述註釋掉，然後修改下列代碼就行了(去掉註釋，改成自己的版本)
#ANACONDA_HOME := $(HOME)/anaconda3
#PYTHON_INCLUDE := $(ANACONDA_HOME)/include \
#$(ANACONDA_HOME)/include/python3.6m \
#$(ANACONDA_HOME)/lib/python3.6m/site-packages/numpy/core/include
# PYTHON_LIBRARIES := boost_python3 python3.6m】
取消WITH_PYTHON_LAYER := 1的註釋
INCLUDE_DIRS := $(PYTHON_INCLUDE) /usr/local/include
LIBRARY_DIRS := $(PYTHON_LIB) /usr/local/lib /usr/lib
改爲：
INCLUDE_DIRS := $(PYTHON_INCLUDE) /usr/local/include /usr/include/hdf5/serial
LIBRARY_DIRS := $(PYTHON_LIB) /usr/local/lib /usr/lib /usr/lib/x86_64-linux-gnu /usr/lib/x86_64-linux-gnu/hdf5/serial
5、配置Makefile文件，這個文件在caffe的目錄下，注意不是Makefile.config文件
在181行將LIBRARIES += glog gflags protobuf boost_system boost_filesystem m 修改爲
LIBRARIES += glog gflags protobuf boost_system boost_filesystem m hdf5_serial_hl hdf5_serial
第大概425行將NVCCFLAGS += -ccbin=$(CXX) -Xcompiler -fPIC $(COMMON_FLAGS)
修改爲NVCCFLAGS += -D_FORCE_INLINES -ccbin=$(CXX) -Xcompiler -fPIC $(COMMON_FLAGS)
以上就配置完畢，下面開始編譯
四、caffe編譯
在caffe目錄下進入終端輸入：sudo make all -j8
sudo make test
sudo make runtest -j8
編譯matlab接口：sudo make matcaffe這裏可能會提示你gcc版本不超過×××,不用理會，也不用對gcc進行降級啥的，
然後sudo make mattest -j8
這裏一般會出現錯誤，說什麼無效的mex文件啥的，最後出來個caffe.set_mode_gpu()或者caffe.set_mode_cpu()錯誤啥的，忘記了怎麼修改的，但好像是與.bashrc文件有關
我的bashrc文件如圖所示，當在python下面輸入import caffe不成功的時候在.banshrc文件中輸入
export PYTHONPATH=/home/zyn/caffe/python:$PYTHONPATH(下圖中第124行)
五、在matlab裏面運行caffe程序
可以在命令窗口中輸入 cd path
然後進入.m程序所在的文件夾，執行程序
六、出現的錯誤之一(只截圖這一個)
就在終端中輸入locate libtiff.so.5(這個文件名是可以改變的，就看你哪個出現沒有版本信息了)
然後輸入 cp /usr/lib/x86_64-linux-gnu /home/zyn/anaconda3/bin/libtiff.so.5即可，然後問題就會解決了
七、忘記是哪一步出現錯誤了，問題是這麼解決的（錯誤描述大概是找不到libstdc++.so.6,然後把這個文件移除並用/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libstdc++.so.6替換它，之後又出現新的問題，說是什麼invalidate:大寫字母），就用下面的解決辦法，在caffe目錄下執行，注意換成你的matlab路徑
sudo rm -rf /home/zyn/MATLAB/R2015b/sys/os/glnxa64/libstdc++.so.6
sudo ln -s /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libstdc++.so.6.0.21 /home/zyn/MATLAB/R2015b/sys/os/glnxa64/libstdc++.so.6
sudo rm -rf /home/zyn/MATLAB/R2015b/bin/glnxa64/libopencv_core.so.2.4
sudo ln -s /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libopencv_core.so.2.4.9 /home/zyn/MATLAB/R2015b/bin/glnxa64/libopencv_core.so.2.4
sudo rm -rf /home/zyn/MATLAB/R2015b/bin/glnxa64/libopencv_imgproc.so.2.4
sudo ln -s /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libopencv_imgproc.so.2.4.9 /home/zyn/MATLAB/R2015b/bin/glnxa64/libopencv_imgproc.so.2.4
sudo rm -rf /home/zyn/MATLAB/R2015b/bin/glnxa64/libopencv_highgui.so.2.4
sudo ln -s /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libopencv_highgui.so.2.4.9 /home/zyn/MATLAB/R2015b/bin/glnxa64/libopencv_highgui.so.2.4
sudo rm -rf /home/zyn/MATLAB/R2015b/bin/glnxa64/libfreetype.so.6
sudo ln -s /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libfreetype.so.6 /home/zyn/MATLAB/R2015b/bin/glnxa64/libfreetype.so.6
八、啓動matlab時出現一堆類似於警告的東西比如
uname: /home/zyn/MATLAB/R2015b/bin/glnxa64/libtiff.so.5: no version information available (required by /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libopencv_highgui.so.2.4)
sed: /home/zyn/MATLAB/R2015b/bin/glnxa64/libtiff.so.5: no version information available (required by /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libopencv_highgui.so.2.4)
getconf: /home/zyn/MATLAB/R2015b/bin/glnxa64/libtiff.so.5: no version information available (required by /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libopencv_highgui.so.2.4)
awk: /home/zyn/MATLAB/R2015b/bin/glnxa64/libtiff.so.5: no version information available (required by /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libopencv_highgui.so.2.4)
awk: /home/zyn/MATLAB/R2015b/bin/glnxa64/libtiff.so.5: no version information available (required by /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libopencv_highgui.so.2.4)
/home/zyn/MATLAB/R2015b/bin/glnxa64/MATLAB: /home/zyn/MATLAB/R2015b/bin/glnxa64/libtiff.so.5: no version information available (required by /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libopencv_highgui.so.2.4)
sh: /home/zyn/MATLAB/R2015b/bin/glnxa64/libtiff.so.5: no version information available (required by /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libopencv_highgui.so.2.4)
ps: /home/zyn/MATLAB/R2015b/bin/glnxa64/libtiff.so.5: no version information available (required by /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libopencv_highgui.so.2.4)
/bin/sh: /home/zyn/MATLAB/R2015b/bin/glnxa64/libtiff.so.5: no version information available (required by /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libopencv_highgui.so.2.4)
grep: /home/zyn/MATLAB/R2015b/bin/glnxa64/libtiff.so.5: no version information available (required by /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libopencv_highgui.so.2.4)
grep: /home/zyn/MATLAB/R2015b/bin/glnxa64/libtiff.so.5: no version information available (required by /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libopencv_highgui.so.2.4)
grep: /home/zyn/MATLAB/R2015b/bin/glnxa64/libtiff.so.5: no version information available (required by /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libopencv_highgui.so.2.4)
解決方式：在/home/zyn/MATLAB/R2015b下啓動終端輸入sudo ./matlab就可以無警告的打開matlab了。