系統生物和生物學中的數理知識

1.生物系統學的必要性

生物還原論:生物單個細胞組分的信息生成、化學成分和它們的生物功能。

生物整體論:一個系統的性質不簡單地等於組成部分性質的疊加。

 

2.基因迴路

遺傳和細胞間的功能是分層的,並且涉及到很多的層次。

給定DNA序列,我們能用開方讀碼框(ORF)(在mRNA上,沿5'至3'方向,從起始密碼子到終止密碼子之間的一段核苷酸序列,稱爲一個開放讀碼框架,讀碼框架內每3個鹼基組成的三聯體,就是決定一個氨基酸的遺傳密碼)來識別對應的基因,並再利用ORF來分配出對應的基因產物,最終靠這些協調功能組成基因迴路。

DNA序列->基因->基因產物->基因迴路,故:細胞功能依賴於多個基因產物之間的協同作用。也可以理解成細胞的功能比作基因迴路的功能,而生理學功能可以看成是多個基因迴路之間協同作用的結果。

基因迴路:指集合在一起需要執行特定細胞功能的不同的基因產物。

性質:1.比較穩定,

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