Singularity入門之亂七八糟

配置文件路徑

• singularity.conf: /etc/singularity/singularity.conf (CentOS7)
• cgroups.toml: /etc/singularity/cgroups/cgroups.toml

指定用戶運行

Singularity 運行容器的時候默認會使用當前用戶來運行容器，但是對於有些由於安全問題必須使用root來運行的容器，默認就是root了，對於這種情況，可以通過 --security 來指定用戶來運行容器。

$ sudo singularity exec --security uid:1000 centos.simg id
uid=1000(admin) gid=0(root) groups=0(root)

Singularity 的 instance 是按用戶分開的

首先使用普通用戶和root用戶分別創建一個instance，比如：

# 普通用戶啓動
$ singularity instance start centos.simg normal_user_instance
INFO:    instance started successfully

# root用戶啓動
$ sudo singularity instance start centos.simg root_user_instance
INFO:    instance started successfully

下面用普通用戶和root用戶分別查詢instance，比如：

# 普通用戶查詢
$ singularity instance list
INSTANCE NAME    PID      IMAGE
normal_user_instance 22911    /home/data/singularity-study/centos.simg

# root用戶查詢
$ sudo singularity instance list
INSTANCE NAME    PID      IMAGE
root_user_instance 22997    /home/data/singularity-study/centos.simg

網絡端口映射

Singularity 可以通過使用 --network-args 選項來指定容器到宿主節的端口映射，但是 --network-args 選項必須和 --net 一起使用。

這裏我們啓動一個容器來運行 nginx 服務，如下：

$ singularity pull docker://nginx

$ sudo singularity run --writable-tmpfs --net --network-args "portmap=8080:80/tcp" nginx_latest.sif

然後另開一個終端來通過訪問宿主機的 8080 端口來測試

$ curl http://localhost:8080
...

路徑綁定

在 Singularity 中，默認在啓動容器的時候會綁定下面這些路徑

• $HOME
• /sys:/sys
• /proc:/proc
• /tmp:/tmp
• /var/tmp:/var/tmp
• /etc/resolv.conf:/etc/resolv.conf
• /etc/passwd:/etc/passwd
• $PWD

我們可以在啓動容器的時候通過 --bind 選項來綁定自己的路徑，比如：

綁定一個目錄

$ singularity shell --bind /opt ubuntu.sif
$ singularity shell --bind /opt:/opt ubuntu.sif

綁定多個目錄

$ singularity shell --bind /opt,/data:/mydata,/mnt:/mymnt ubuntu.sif

也可以通過設置環境變量 SINGULARITY_BIND 來綁定

$ export SINGULARITY_BIND="/opt,/data:/mydata,/mnt:/mymnt"
$ singularity shell ubuntu.sif