下載序列簡單不過,無非就是聯網NCBI主頁,選擇數據庫後輸入AC號或GI號後直接下載。但是如何大批量下載,而且下載的序列是指定的AC或GI的呢?實現這一目的通常辦法是藉助一些生物軟件的檢索功能,諸如:Bioedit、Geneious、MacVector等。其實,NCBI自帶的Batch Entrez 只需簡單三步即可輕鬆完成這一任務。
【準備工作】
創建一個需要下載序列AC號的列表文件,每行一個獨立的AC號,保存爲文本文件:
【簡要流程】
1、打開網頁,粘貼這個網
址:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/batchentrez?
點擊“瀏覽”按鈕,選擇事先準備帶AC號的文本文件後,點擊“Retrieve”開始檢索,數秒後即可返回檢索的序列記錄;
3、點擊檢索到的序列記錄“Retrieve records for 48 UID(s)”即可,後面就是“Send to” 保存要下載的序列,後面的操作就不在贅述,詳見前面一些相關教程。