一、BIOS設置部分
由於各家主板的BIOS不盡相同，但是設置原理都是基本一致的，在此只介紹幾種比較典型的BIOS設置，相信讀者都能夠根據自己主板BIOS的實際情況參考本文解決問題。
1.南橋爲ICH5/ICH5R的主板
先以華碩的P4C800爲例，這款主板芯片組爲i865PE，南橋爲ICH5/ICH5R。進到BIOS後，選擇Main下的IDE Configuration Menu，在Onboard IDE Operate Mode下面可以選擇兩種IDE操作模式：兼容模式和增強模式(Compatible Mode和Enhanced Mode)。其中兼容模式Compatible Mode，可以理解爲把SATA硬盤端口映射到並口IDE通道的相應端口，當你選擇這種模式時在下面的IDE Port Settings中會有三個選項：
Primary P-ATA+S-ATA：並行IDE硬盤佔據IDE0+1的主通道(Primary IDE Channel)，串行SATA硬盤佔據IDE2+3的從通道(Secondary IDE Channel)。也就是說這時主板上的第二個並行IDE接口對應的端口不可用。
Secondary P-ATA+S-ATA：與上面正相反，此時主板第一個並行IDE接口(Primary P-ATA)上對應的端口不可用，因爲給SATA硬盤佔用了。
P-ATA Ports Only：屏蔽了串行SATA硬盤接口，只能使用並行接口設備。
注：前兩種模式中，主板上的SATA1接口自動對應IDE通道中的主盤位置，SATA2接口自動對應IDE通道中的從盤位置。
當選擇模式爲增強模式Enhanced Mode時，其下的端口設置的字樣變爲Enhanced Mode Supports On，其中也有三個選項：
P-ATA+S-ATA：並行和串行硬盤並存模式，此時SATA和PATA通道都相互獨立互不干擾，理論上4個P-ATA和2個S-ATA可同時接6個設備，實際上得根據不同主板而定，有的南橋芯片就只支持4個ATA設備。此時SATA1口硬盤對應Third IDE Master(第三IDE通道主盤)，SATA2口硬盤對應Fourth IDE Master(第四IDE通道主盤)。
S-ATA：串行硬盤增強模式，此時理論上支持4個串行硬盤，但還得看主板的支持情況(如果是ICH5R芯片組如P4P800，想組RAID模式，則必須要選擇此項，並將Configure S-ATA as RAID項設爲Yes，S-ATA BOOTROM項設爲Enable，設置後BIOS自動檢測的時候按“Ctrl+I”進行RAID設置)。
P-ATA：其實還是一種映射模式，SATA硬盤佔據的是第一個IDE通道，SATA1口對應第一個通道的主盤，SATA2口對應第一個通道的從盤。
當你使用的是Win98/Win NT/Win2000/MS-DOS等傳統的操作系統時，由於它們只支持4個IDE設備，所以請選擇兼容模式Compatible Mode，並根據你的實際硬盤數量和位置選擇IDE Port Settings中的對應選項；當你使用的是WinXP/Win2003等新型的操作系統時，可以選擇增強模式Enhanced Mode來支持更多的設備。當然如果你安裝Win98+Win XP雙系統的話，也只好選擇Compatible Mode了。另外，有的主板BIOS有BUG，致使在單個SATA硬盤上安裝Windows 98SE系統時不能正確安裝SATA硬盤(如：華擎P4VT8)，只需要升級BIOS版本到最新版就可以解決了。
注：雖然SATA硬盤本身並沒有主從之分，但是如果使用了端口映射的模式，當你想要並行硬盤和串行硬盤共存時，還是得注意硬盤所佔的位置不要衝突了，而且啓動順序也需要在BIOS中根據實際情況進行相應調整。
下面以GA-8KNXP Ultra爲例，簡要說一下技嘉主板的BIOS中SATA的設置：
這款主板的芯片組是i875P，南橋爲ICH5R，其SATA部分的設置選項在Main主菜單下的Integrated Peripherals(整合周邊設備)裏，其設置功能詳見下表(只列出了有關SATA硬盤設置的部分)：
有關啓動設備的選項在Advanced BIOS Features(進階BIOS功能設定)中，詳見下表：
通過上面的兩個例子可以看出ICH5/ICH5R南橋的主板，都是通過端口映射和獨立SATA通道兩種途徑來設置識別SATA硬盤的。至於應該選擇哪種模式和設置值，請參考上文並根據S-ATA硬盤和P-ATA硬盤的數量，安裝的操作系統以及哪一個作爲系統啓動盤等實際情況來自行設定。
2.南橋爲VIA的VT8237的主板
相對於ICH5/ICH5R芯片組，VT8237的SATA設置部分就簡單得多了。下面以碩泰克的SL-KT600系列爲例，其SATA部分的設置選項也是在Main主菜單下的Integrated Peripherals(整合周邊設備)裏：
Onboard PATA IDE(主板內建並行IDE口設定)
此項設定允許用戶配置主板內建並行IDE口功能。
Disabled：關閉主板的並行IDE口功能。
Enabled：允許使用並行IDE口功能(預設值)。
Onboard IDES operate mode(主板內建IDE優先設定)
PATA is Pri IDE：PATA口上的設備優先(預設值)。
SATA is Pri IDE：SATA口上的設備優先。
Onboard SATA- IDE(主板內建SATA口功能設定)
Disabled：關閉主板上SATA口。
SATA：主板上SATA口當做一般的SATA口使用。
RAID：主板上SATA口上的硬盤可以建立磁盤陣列(預設值)。
這裏你只需要根據實際情況調整一下串、並行口的優先級就可以正常使用SATA硬盤了。(通過上面的選項能看出，在這裏S-ATA硬盤還是可以理解爲映射到P-ATA端口上來識別的。)
注：RAID的組建還需要在開機時按“Tab”鍵進入VIA科技RAID控制器的BIOS設置畫面另行設置，請參見相關的說明手冊。
二、SATA硬盤的分區
現在一般都是用Win98/Me啓動程序啓動後用FDISK、DM、PQ等工具來對硬盤進行分區的。那麼只要在BIOS中設置正確並能在啓動後識別出SATA硬盤，這時SATA硬盤的分區就和傳統的並口硬盤的分區方法完全一樣了。
如果你用的是Win2000/XP/2003等啓動光盤來啓動並分區的，如果你的SATA硬盤不能識別，那麼需要在屏幕提示“Press F6 if you need to install a third party SCSI or RAID driver...”時按F6，用軟驅加載驅動程序，當硬盤被正確識別後就和傳統的並口硬盤分區方法完全一樣了。
注：有些主板不附帶驅動軟盤(如華擎K7S8XE+，採用SiS748+SiS964芯片組)，並且其驅動程序並不能直接從光盤目錄下拷貝到軟驅，而是要用主板光碟啓動時安裝製作的，請仔細閱讀主板說明手冊。
三、操作系統的安裝
1.Win98/Me
不論你使用的是什麼芯片組，只要在BIOS中設置正確並讓主板識別出S-ATA硬盤，那麼就可以正常地安裝使用了。(注：當然還得注意，Win98/Me等系統最大隻能支持4個設備。)
2.Win2000/XP/2003等NT核心的系統
這裏由於ICH5不需要加載RAID模塊，所以直接安裝就可(其實就是將S-ATA映射到P-ATA端口使用，自然就和並口硬盤一樣了)。而ICH5R南橋控制器則分兩種情況，一種是在BIOS中完全屏蔽了RAID模塊，那麼就和ICH5的情況一樣了，直接安裝即可；二是開啓了RAID(BIOS中默認都是開啓的)，則這時需要在啓動時按F6用軟驅加載驅動。對於VT8237理論上應與ICH5R一樣，其大多數主板說明書上也指明只作爲普通SATA硬盤使用時不需要加載驅動(如碩泰克的SL-KT600-R)，但是實際上不論使不使用RAID功能都需要加載驅動。由於筆者接觸的產品有限，不知是否都是如此，還請讀者自行嘗試。
注：目前除南橋自帶的S-ATA控制器以外，其它的S-ATA控制器基本都需要外加驅動，有些主板除了本身南橋支持S-ATA外，還板載Promise等第三方的S-ATA及RAID控制器，請注意區分。
四、操作系統下驅動的安裝
當安裝完操作系統，還需要進一步安裝對應的驅動程序。
1.ICH5只需要加載Intel提供的INF驅動。
2.ICH5R除了INF驅動，還要加載IAA3.0或以上版本驅動。
3.VT8237需要安裝VIA Hyperion 4-IN-1補丁。如果你還使用有並行硬盤的話，最好慎用VIA獨立發佈的VIA IDE Miniport Driver驅動程序，很可能會使並行硬盤的突發傳輸速率下降，但對串行硬盤性能無甚影響。
注：如果你使用的是第三方SATA控制芯片和RAID模塊，那麼你還需要添加相應的驅動程序。
總結：通過上文可看出，S-ATA硬盤的使用關鍵在於正確設置BIOS中的識別方式，而由於各家主板廠商的BIOS菜單都不相同以及主板手冊的語焉不詳，才造成了S-ATA硬盤在使用中的種種問題。由於研發能力的不同，要想讓主板廠商把這部分統一起來，現階段是不現實的，所以筆者僅希望讀者能夠通過參考本文，根據自己的實際情況來舉一反三地解決問題。
祝願所有使用SATA硬盤的朋友都能夠明明白白地使用好自己的SATA硬盤。
