1.傳統的在eclipse平臺下編譯生成apk，這種情況下，需要指定android sdk，通過eclipse編譯生成apk，編譯的apk擁有較低級別的用戶級別權限，可能有些底層操作沒有權限實現，比如部分system調用，訪問系統文件目錄等。如果存在jni調用，則需要創建jni目錄，並在jni目錄裏面創建android.mk，通過ndk編譯生成動態庫.so供上層調用，生成的動態庫必須放在libs/armeabi或者libs/armeabli-v7a目錄下面，在eclipse打包時候才能將.so打包到apk中，安裝此apk，會安裝到/data/app目錄下，同時將apk和so文件寫入/data/相應目錄下，表示安裝成功。
2.如果需要生成apk擁有system權限，則需要在AndroidManifest.xml中指定android.sharedUserId="android.uid.system"裏獲取system權限，同時在生成apk後要進行簽名，簽名命令類似如下格式：
java -jar signapk.jar platform.x509.pem platform.pk8 old.apk new.apk
這樣生成的apk會比1中生成的apk擁有較高級別的權限。platform.x509.pem platform.pk8這兩個文件一般在所在android源碼系統中的build\target\product\security目錄下面,signapk.jar爲一個簽名工具，一般在源碼out/hostlinux-x86/framework/signapk.jar 目錄下面。
3.無論1和2，android應用均只能調用開放的SDK中api或者屬性參數，由於SDK是android framework的一個子集，有大量framework中的api或者屬性並沒有開放給SDK，因此android上層應用無法調用。如果想調用framework中的一些未開放到SDK的api，同時要求apk擁有系統級權限，那麼只能將android應用放到源碼裏進行編譯。我將android應用放到android源碼中的packages/apps/中，通過mmm命令來編譯，這些應用可以調用framework的api並擁有系統級權限，生成的apk在out/target/product/dt307sq/system/app/下，dt307sq是硬件平臺名稱。packages/apps/下有大量系統級應用，這些應用在源碼編譯的時候會隨源碼一起編譯，隨系統一起安裝，安裝在系統/system/app下，這些系統級應用可以作爲我們的參考。對於牽涉到了jni調用的情況，同方法1，必須編譯出.so庫，才能編譯成功。比如源碼裏面有個Bluetooth的例子，其目錄結構爲
Android.mk內容如下：
LOCAL_PATH:= $(call my-dir)
include $(CLEAR_VARS)
LOCAL_MODULE_TAGS := optional
LOCAL_SRC_FILES := \
$(call all-java-files-under, src)
LOCAL_PACKAGE_NAME := Bluetooth
LOCAL_CERTIFICATE := platform
LOCAL_JNI_SHARED_LIBRARIES := libbluetooth_jni
LOCAL_JAVA_LIBRARIES := javax.obex
LOCAL_STATIC_JAVA_LIBRARIES := com.android.vcard
LOCAL_REQUIRED_MODULES := libbluetooth_jni bluetooth.default
LOCAL_PROGUARD_ENABLED := disabled
include $(BUILD_PACKAGE)
include $(call all-makefiles-under,$(LOCAL_PATH))
LOCAL_JNI_SHARED_LIBRARIES
:= libbluetooth_jni表示該apk依賴libbluetooth_jni這個模塊，這個模塊的編譯腳本在jni目錄下：
LOCAL_PATH
:= $(call my-dir)
include $(CLEAR_VARS)
LOCAL_SRC_FILES:= \
com_android_bluetooth_btservice_AdapterService.cpp \
com_android_bluetooth_hfp.cpp \
com_android_bluetooth_a2dp.cpp \
com_android_bluetooth_hid.cpp \
com_android_bluetooth_hdp.cpp \
com_android_bluetooth_pan.cpp
LOCAL_C_INCLUDES += \
$(JNI_H_INCLUDE) \
LOCAL_SHARED_LIBRARIES := \
libandroid_runtime \
libnativehelper \
libcutils \
libutils \
libhardware
#LOCAL_CFLAGS += -O0 -g
LOCAL_MODULE := libbluetooth_jni
LOCAL_MODULE_TAGS := optional
include $(BUILD_SHARED_LIBRARY)
這個生成libbluetooth_jni.so
這樣通過mmm編譯的apk包含進了.so庫。
但有這樣一種情況，.so庫是在外面通過android ndk編譯生成的，沒有在源碼裏面編譯，這個就是第三方庫，那麼如何將.so庫打到apk裏面呢。剛開始，我想到一個辦法。將.so文件放到/lib/armeabi/這個目錄裏面，然後再通過mmm編譯生成apk，但發現apk裏面根本沒有lib這個目錄。後來我又嘗試另外一種方法：
改下android.mk如下：
LOCAL_PATH:= $(call my-dir)
include $(CLEAR_VARS)
LOCAL_STATIC_JAVA_LIBRARIES:= xstream
LOCAL_STATIC_LIBRARIES:= libnative-backendservice-jni
LOCAL_MODULE_TAGS := optional
LOCAL_SRC_FILES += $(call all-java-files-under, src)
LOCAL_SRC_FILES += $(call all-java-files-under,gen)
LOCAL_PACKAGE_NAME := ClientAgent
LOCAL_CERTIFICATE := platform
#LOCAL_PROGUARD_NEALBED: = false
#LOCAL_PROGUARD_FLAG_FILES := proguard.cfg
include $(BUILD_PACKAGE)
include $(CLEAR_VARS)
LOCAL_PREBUILT_STATIC_JAVA_LIBRARIES:=xstream:lib/xstream-1.4.4.jar
include $(BUILD_MULTI_PREBUILT)
include $(CLEAR_VARS)
LOCAL_PREBUILT_LIBS:=libnative-backendservice-jni:lib/armeabi/libnative-backendservice-jni.so
include $(BUILD_MULTI_PREBUILT)
# Use the folloing include to make our test apk.
#include $(call all-makefiles-under,$(LOCAL_PATH))
這種方法通過include $(BUILD_MULTI_PREBUILT)集成第三方庫，但發現這種方法只是在編譯apk的時候，將第三方庫自動拷貝到out/target/product/dt307sq/system/lib下，根本沒有在apk裏面打包第三方.so庫。
最終發現以下辦法能將第三方庫打包到源碼編譯的apk中。
1）.將第三方庫.so放到應用下的lib/armeabi中
2）.通過mmm編譯出apk，這個apk裏面沒有包含lib目錄
3）.通過aapt命令，添加lib/armeabi裏的.so庫，例如：./aapt a ../../../out/target/product/dt307sq/system/app/ClientAgent.apk lib/armeabi/libnative-backendservice-jni.so
aapt命令在源碼out/host/linux-x86/bin下，是很強大的工具，注意一定要帶lib/armeabi/目錄，apk會根據名稱生成對應的目錄
4）.最後簽名，例如：java -jar signapk.jar platform.x509.pem platform.pk8 ../../../out/target/product/dt307sq/system/app/ClientAgent.apk ClientAgentSign.apk
生成的apk，具有系統級權限，在源碼裏編譯生成的，同時需要調用的jni動態庫是在源碼外面通過android ndk編譯生成的。
一般情況下，需要在源碼裏編譯，最好android應用和jni動態庫部分都通過源碼來編譯，這是最好的方法。但是有些情況下，需要調用大量第三方庫，因爲源碼編譯環境下，這些第三方庫不一定能編譯通過，那就只能在外面編譯好了，然後加到源碼編譯生成的apk中。
