絕大多數情況下，使用索引可以提高查詢的速度，但如果SQL語句使用不恰當的話，索引將無法發揮它應有的作用。下面是應該注意的幾個方面。首先，最好是在相同類型的字段間進行比較的操作。在MySQL 3.23版之前，這甚至是一個必須的條件。例如不能將一個建有索引的INT字段和BIGINT字段進行比較；但是作爲特殊的情況，在CHAR類型的字段和VARCHAR類型字段的字段大小相同的時候，可以將它們進行比較。其次，在建有索引的字段上儘量不要使用函數進行操作。
例如，在一個DATE類型的字段上使用YEAE()函數時，將會使索引不能發揮應有的作用。所以，下面的兩個查詢雖然返回的結果一樣，但後者要比前者快得多。
SELECT * FROM order WHERE YEAR(OrderDate)<2001;
SELECT * FROM order WHERE OrderDate<"2001-01-01";
同樣的情形也會發生在對數值型字段進行計算的時候：
SELECT * FROM inventory WHERE Amount/7<24;
SELECT * FROM inventory WHERE Amount<24*7;
上面的兩個查詢也是返回相同的結果，但後面的查詢將比前面的一個快很多。第三，在搜索字符型字段時，我們有時會使用 LIKE 關鍵字和通配符，這種做法雖然簡單，但卻也是以犧牲系統性能爲代價的。例如下面的查詢將會比較表中的每一條記錄。
SELECT * FROM books
WHERE name like "MySQL%"
但是如果換用下面的查詢，返回的結果一樣，但速度就要快上很多：..
SELECT * FROM books
WHERE name>="MySQL"and name<"MySQM"
最後，應該注意避免在查詢中讓MySQL進行自動類型轉換，因爲轉換過程也會使索引變得不起作用。
