一、安裝MRT(MODIS Reprojection Tool)
安裝準備：檢查是否安裝java.exe。Java版本至少爲Java 2 Runtime Environment version 1.5或者是Java 2 SDK version 1.5或者更高的版本。在Windows平臺中可以通過開始/搜索並輸入java.exe來檢查自己的電腦是否安裝有java，也可以不檢查直接重新安裝一份。
解壓安裝包MRT_download_<platform>.zip。包含四個文件：mrt_install.bat，MRT_<platform>.zip，reg_set.exe， 以及unzip.exe。
雙擊mrt_install.bat，並按提示完成安裝。
注：下載地址爲https://lpdaac.usgs.gov/tools/modis_reprojection_tool，要先註冊賬號才能下載，註冊的時候最好用國外郵箱，如雅虎什麼的，反正QQ，163郵箱收不到驗證鏈接。
二、使用MRT(MODIS Reprojection Tool）
(一）GUI界面操作
安裝完成後，打開MRT的安裝路徑文件夾，打開bin文件夾，雙擊ModisTool.bat或者ModisTool.jar即可進 入MRT的GUI界面。
輸入MODIS數據，選擇輸出NDVI和EVI，指定輸出路徑輸出文件格式爲GEOTIFF，採樣方式爲最近鄰，投影類型爲Albers Equal Erea，輸出像元大小爲250m，然後直接點擊run就可以了。其中，投影參數設置見下圖（STDPR1第一條標準緯線25，STDPR2第二條標準緯線爲47，CentMer中央經線爲105，datum基準面WGS84）：
（二）批處理拼接之一年以內的數據
備註：該操作數據及BAT文件須放在一個文件夾下（文件夾起名請用英文，MRT對中文路徑數據會打不開）。
操作步驟:
1.新建一個DATA文件夾，將HDF數據拷到DATA文件夾下;
2.在DATA文件夾下再新建個Result文件夾（存放拼接後數據）;
3.將以下代碼內容粘到一個TXT文件中，更改TXT文件擴展名爲BAT即可，假設你命名該BAT文件名爲MOSAIC.BAT；
4：點擊MOSAIC.BAT，即可進行拼接操作。
注意：第一行代碼裏，把MRTDATADIR替換爲你自己的MRTDATADIR名稱，MRTDATADIR名稱可以在安裝目錄裏，找到ModisTool.bat，然後右鍵選擇編輯中查看；
此外以下代碼未考慮中間天數間斷的情況，比如對MODIS時間分辨率爲16天的數據，在一個應連續的等差數列中間有數據缺失，存在相差32天的情況，可能會報錯，請注意。
set MRTDATADIR=f:\MOD_HDE_SOURCE
set /a DAY=2000049 rem ***開始日期***
set /a DEADLINE=2000353 rem ***結束日期***
:start
if %DAY% leq %DEADLINE% (goto ORDER) else exit
:ORDER
rem **將當天的圖幅數據文件名放在一個TXT文件中**
dir *%DAY%.*.hdf/a/b/s > MOSAICINPUT.TXT
rem **拼接HDF12種數據中的第一種**
d:/software_install/MRT/bin/mrtmosaic.exe -i MOSAICINPUT.TXT -s "1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0" -o MOSAIC_TMP_%DAY%.hdf
rem **將拼接後數據複製到已建Result 文件夾中並刪除當天的數據**
copy MOSAIC_TMP_%DAY%.hdf Result & del MOSAIC_TMP_%DAY%.hdf
del *%DAY%.*.hdf
set /a DAY= %DAY% + 16 rem ***拼接下一個時相的數據***
goto start
（三）批處理拼接之多年的數據
以上代碼只能處理一年之內或者每隔一年的數據，如果要一次性處理多年的數據，則參見以下的代碼
set MRT_DATA_DIR=f:\MOD_HDF_SOURCE
set /a DAY=2015337
set /a DAY1=337
set /a DEADLINE=2016353
:start
if %DAY% leq %DEADLINE% (goto ORDER1) else exit
:ORDER1
if %DAY1% leq 353 (goto ORDER)
:ORDER
dir *%DAY%.*.hdf/a/b/s > MOSAICINPUT.TXT
d:/software_install/MRT/bin/mrtmosaic.exe -i MOSAICINPUT.TXT -s "1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0" -o MOSAIC_TMP_%DAY%.hdf
copy MOSAIC_TMP_%DAY%.hdf Result & del MOSAIC_TMP_%DAY%.hdf
del *%DAY%.*.hdf
set /a DAY1= %DAY1% + 16
set /a DAY= %DAY% + 16
if %DAY1% GTR 357 (goto ORDER2)
pause
goto start
:ORDER2
set /a DAY=%DAY% + 1000 - 368
set /a DAY1=1
pause
goto start
(四）批處理重投影及格式轉換
新建一個文件夾，假設起名爲DATA，把所有要處理的MODIS HDF文件放到該文件夾下；
在GUI界面中，設定一個HDF文件投影參數後，點擊“Save Parameter File…”保存自己設定的參數文件到DATA文件夾下，假設爲test.prm；
在DATA文件夾裏，新建一個記事本文件，將下面的內容粘貼進去，需更改幾處。更改完畢之後，將記事本文件另存爲“.bat”文件，假設爲“modis.bat”；
set MRT_DATA_DIR=f:\MOD13Q1_REPROJECTION
for %%i in (*.hdf) do resample.exe -p albers_equal_area_orchid.prm -i %%i -o %%iout.tif
pause
其中，
第一行代碼裏，把MRT_DATA_DIR替換爲你自己的MRT_DATA_DIR名稱，MRT_DATA_DIR名稱可以在安裝目錄裏，找到ModisTool.bat，然後右鍵選擇編輯中找到；
第二行代碼裏，把test.prm替換爲自己的投影參數文件，如果運行出錯的話，可以把resample替換爲其完整的路徑，如D:\software_install\MRT\bin\resample.exe；
第三行代碼爲運行完成後保留bat運行窗口，如果出現錯誤，可參見bat窗口的提示，將安裝目錄下的datum.txt和spheroid.txt文件複製到DATA文件夾裏;
雙擊modis.bat，便可看到命令窗口的批出理過程，如發生異常，檢查prm的參數是否設置正確（可在GUI中運行看是否報錯）或見上一段的注意事項。
————————————————
版權聲明：本文爲CSDN博主「suiluochenghu」的原創文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版權協議，轉載請附上原文出處鏈接及本聲明。
原文鏈接：https://blog.csdn.net/suiluochenghu/article/details/79648980