蛋白PDB文件格式

列 

數據類型

字段名稱 

定義描述

1 - 6 

Record name

"DBREF "


8 - 11

IDcode 

idCode 

記錄的ID

13 

Character

chainID 

鏈的標識符

15 - 18 

Integer 

seqBegin 

PDB序列片段的起始序列號

19 

AChar 

insertBegin

PDB序列片段的起始插入代碼

21 - 24 

Integer 

seqEnd

PDB序列片段的終止序列號

25 

AChar 

insertEnd 

PDB序列片段的終止插入代碼

27 - 32 

LString

database

序列數據庫名稱如PDBSWS,當一個相應的序列數據庫記錄還未識別時即存放PDB

34 - 41 

LString

dbAccession 

序列數據庫的訪問號碼,如對於GenBank來說即是NCBI gi

43 - 54 

LString

dbIdCode 

序列數據庫的識別密碼,對GB來說即是訪問號碼

56 - 60 

Integer 

dbseqBegin 

數據庫片段的起始序列號

61 

AChar 

idbnsBeg 

涉及到PDB的話,存放片段起始殘基的插入代碼

63 - 67

Integer 

dbseqEnd 

數據庫片段的終止序列號

68 

AChar 

dbinsEnd 

涉及到PDB的話,存放片段終止殘基的插入代碼。


原文出自:蛋白質PDB文件說明.doc

英文版:PDB Primary Structure Section

蛋白PDB文件格式

from:Valeri Barsegov Molecular Dynamics Simulations: Lecture 16 & 17

轉自:http://blog.sina.com.cn/s/blog_6264e0aa0102edyr.html

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