最近有幸深入了解了一些 Biztalk 2004 和 WebSphere Integration Server Foundation 5.1 的内容，作为两大软件厂商的两大商业流程集成平台，不仿做一下对比。
Biztalk 2004 以下简称为 Biztalk，WebSphere Business Integration Server Foundation 5.1 简称 WBI-SF。
1、对于关键标准的支持
由于 WebServices 技术成为将来 EAI、B2Bi 方案使用的一种主流技术，两个平台在此方面的支持均比较完善，可以在流程中很方便地调用 Web Service。
但对于 Web Service 的一个重要协议：BPEL4WS --- 商业流程执行语言，两者支持的力度则不同。WebSphere 的流程编排（Choreograph）是以 BPEL4WS 为基础，增加了一定扩展。而 Biztalk 则更象是延用了 XLANG 的流程编排（Orchestration），而做了一些扩展以便能够支持 BPEL4WS。
这个也可能与产品的发布日期有关，Biztalk 2004 在研发中的时候，BPEL 1.1 的标准还没未成形，而 WBI-SF 则是在 BPEL 1.1 成为正式标准之后才发布的。
2、应用接口与适配器（Adapter）
Biztalk 似乎在这个方面要具有优势，这可能归功于 Biztalk 产品历史稍长，很早就有 Biztalk Framework、Adapter Framework，加上近几年的不断发展，已经可以支持所有主流数据库、基础架构和产品（如 CORBA、EJB、MQ、EDI）、垂直行业标准（HIPAA,RosettaNet、FIX, SWIFT (Financial)），应用程序（Sibel CRM、SAP、J.D.Edwards、PeopleSoft），数量达到数百个，而 WBI-SF 则除了与自己的产品/技术（如CICS、Lotus等）具有接口外，其它的 Adapter 并不多。
3、开发难易程度
Biztalk 的开发并不是很容易的事情，需要了解端口、管道等诸多易另人混淆的东西，而且基本上是基于 XML 消息的处理，所以在流程的各个部分要经常做消息类型定义，消息转换等。而 WBI-SF 中则更多是使用容易理解的变量的概念，类似于函数中的参数。两者各有优缺点，基于变量（参数）易理解、容易开发，而基于消息较适合于完整的商业文档转换、 交换，并且能证可以保证其中数据的安全性。
在流程活动基本元素（如循环、分支、顺序执行等）方面，Biztalk 支持较为完善，而 WBI-SF 则只是在 BPEL4WS 的基本元素基础上加入了有限扩展，不够丰富。
在文档转换与映射（Maping）方面，Biztalk 提供了完备的设计界面和转换函数，而 WBI-SF 只是提供了基本的映射功能。
4、开发工具支持
Microsoft 使用扩展后的 Visual Stuidio .NET 2003 做为 Biztalk 应用的开发工具，IBM 则紧紧围绕 Ecipse ，提供了一个类似于 WSAD 的 WebSphere Application Developer for Integration Edition（简称 WSAD-IE）来对 WBI-SF 应用开发提供支持。
就个人体会来说，在 WSAD-IE 中开发应用要比 VS.NET 中方便一些，目前在 VS.NET 中开发 Biztalk 应用还是很麻烦，需要安装 Biztalk 开发版，开发工具中不支持调试，只能通过另外的一个工具来跟踪调试。
在 WSAD-IE 中自带有一个 WBI-SF 简化版，所以不用另外安装 WBI-SF ，而且可以直接在开发工具中进行流程调试，如设置断点、单步执行等。
5、性能与效率
从理论上来说，Biztalk 的所有消息都要存储到消息数据库后再进行进一步处理，而 WBI-SF 则将商业流程分为两类：没有人工参与的流程的短流程以及有人工参与的长流程（类似于传统意义上的工作流），对于前者只在内存中进行处理，对于后者，则要存 储到数据库中后再进行处理。
很难说两者那个的效率更好，Biztalk 都存储在数据库中，异步处理，很少会发生资源争用、死锁的情况，而且可靠性很高，而如果在内存中处理，并发量较小的时候可能会较快，但并发量大的时候，很可能会产生资源争用，进而死锁降低系统效率。
就开发工具来说，WSAD-IE 继承了 WSAD 奇慢的速度，在 1G 的 Vmware Virtual Machine 中花了 1 分钟时间才启动完成，编译部署时间也很长，在这方面，其与 Biztalk 和 VS.NET 的速度差异不是一两倍，简直是糟蹋了 Eclipse。
6、人力工作流支持
人力工作流（Human Workflow）主要指商业流程中需要人力参与，如审批、复核等。在 WBI-SF 中对人力工作流有一定的支持，每个活动结点可以设置其类型为 staff activities ，然后可以设置操作用户、权限等，且有内建的、简单的 Web 操作界面来完成在流程上定义的操作。
IBM 对于人力工作流更完整的支持体现在 WebSphere Interchange Server 4 （购自 CrossWorlds ）中，估计这个东西以后会和 WBI-SF 进行整合。
Biztalk 本身的工作流特性较弱，只是提供了一些工作流基础（基础服务和接口等），具体的实现需要较多的二次开发，结合 SharePoint Services 和 InfoPath 等完成。
7、建模工具
Microsoft 提供了一个基于 Visio 的插件，可以由业务人员绘制商业处理流程图，并可以导入到 VS.NET 中直接作为 Biztalk Orchestration 基本框架来使用。
IBM 有一个名为 WebSphere Business Integration Modeler 的单独的建模工具，不知道是否是提供 WBI-SF 来使用的，此建模工具也构建在 Eclipse 的基础上。
8、其它相关信息
虽然大家说 Biztalk 与 Infopath 的关系有如 Outlook 和 Exchange ，但在实际应用中，Infopath 要想利用 Biztalk 的功能，远不如 Outlook 配置一个 Profile 就可以使用 MailBox 和 Public Folder 那样简单。
Biztalk 仍需要在 BPEL4WS、Human Workflow、开发支持等方面继续进步。
IBM 在整合方面的工具很多，如 WebSphere Business Integration（不知道其与 WBI-SF 的关系如何，个人以为 WBI-SF 是 WBI 的升级版本）、WBI MessageBroker、WBI Modeler、WBI Adapter Framework、WebSphere Interchange Server、WebSphere MQ Workflow、MQ Integrator 等，说实话，这么多东西，实在很让人 Confuse ，即然天天对外宣称口号：整合应用（ IBM 开发大会口号），何不把自己的整合产品先好好整合一下？或者至少给用户一个明确的产品发展计划以便于产品或技术选型/决策呀。