STP/RSTP是基於端口的，PVST＋是基於VLAN的，而MSTP就是基於實例的。
所謂實例就是多個VLAN的一個集合，通過多個VLAN捆綁到一個實例中去的方法可以節省通信開銷和資源佔用率。MSTP各個實例拓撲的計算是獨立的，在這些實例上就可以實現負載均衡。在使用的時候可以把多個相同拓撲結構的VLAN映射到一個實例裏，這些VLAN在端口上轉發狀態將取決於對應實例在MSTP裏的狀態。MSTP的實例0具有特殊的作用，稱爲CIST，即公共與內部生成樹，其他的實例稱爲MSTI，即多生成樹實例。
MSTP中的幾個關鍵技術點：
l 端口狀態
STP協議通過在交換機之間傳遞特殊的消息（這個消息稱爲BPDU，橋協議數據單元，又成爲配置消息Configuration Message）,並進行分佈式的計算，來決定一個有環路的網絡中，哪臺交換機的哪個端口應該被阻塞（Discarding），用這種方法來剪切掉環路。稱這種被阻塞的端口爲：其處在DISCARDING狀態，處於DISCARDING狀態的端口不會轉發任只會接收特定的BPDU報文，對於其他的報文一律丟棄。需要注意的是，端口的狀態是一個瞬時值，並非一成不變的.
除了處於DISCARDING狀態的被阻塞的端口以外，還有一種正常轉發數據報文的端口，其狀態稱爲FORWARDING，與不啓動MSTP協議的正常端口沒有什麼分別。
除了FORWARDING、DISCARDING、LEARNING狀態以外，還有一種端口狀態DISABLE，是指物理上LINK DOWN的端口和沒有啓動STP協議的端口。
根橋就是那棵生成樹的總根，整個網絡中有且只有一個根橋。它是整個網絡的邏輯中心，但不一定是物理中心。當MSTP協議開始運行時，就開始了選舉根橋的過程，各交換機之間通過比較各自的橋ID來選舉根橋，最後整個網絡中橋ID最小的交換機成爲根橋。橋ID（類似於OSPF中的Router ID）它由交換機的優先級+MAC地址構成，比較的時候先比較優先級，如果優先級相同則比較MAC，比較的原則都是值較小者優。
l 域與多實例
域就擁有相同域信息的一些相連通的交換機所組成的區域，可以理解爲一個自治系統。MSTP中的實例與VLAN採取“映射”的概念，一個實例可以對應多個VLAN，而一個VLAN只能對應一個實例。幾個交換機處於同一個域內，就是他們的域信息完全一致：包括域名，格式前綴（一般都爲0不會有什麼變化），修訂級別，VLAN和實例之間的映射關係。
在MSTP的生成樹算法中，一個域被當作一臺交換機來處理，這樣計算生成的樹叫做CST（公共生成樹）。每個域內同樣運行MSTP協議，對每一個實例都計算出一棵生成樹，叫做MSTI（多生成樹實例），MSTI是域內纔有的概念。此外域內的實例0是一個特殊的實例，實例0的生成樹和CST一起組成了一個包含全網內所有交換機的樹，叫做CIST（公共內部生成樹）。域和域之間的數據流量通過CIST來實現，域內則根據MSTI來實現，從而實現了RSTP與VLAN的完美結合。
雖然多了域與實例，其實並不複雜，在全局來看，一個域就是一臺交換機，和剛纔介紹的算法沒有什麼本質區別。而在域內，就相當於是一個運行RSTP的小型網絡，只不過根橋被域根橋所取代。域內各MSTI之間各自獨立計算自己的生成樹，互相之間互不干擾。 域也將路徑開銷分爲了內部路徑開銷和外部路徑開銷. 內部路徑開銷也稱IRPC,指本交換機到所在域的域根橋的開銷；外部路徑開銷也稱ERPC，是指從域根到總根的路徑開銷。在MSTP中選舉指定端口和根端口時，比較的先後順序依次爲：根橋ID，外部路徑開銷，
域根ID，內部路徑開銷，指定橋ID，指定端口ID，接收端口ID