Zotero 5.0 + 堅果雲同步盤 + papership 配置教程

最近需要一個文獻管理工具，然後網上推薦使用Zotero，於是乎裝一下吧。原生的Zotero存儲空間只有300M，那麼就需要第三方代存文件了，使用堅果雲或者百度雲，由於目前百度雲不太支持這種操作了，只能選擇堅果雲了。另外，爲了在IOS端或者IPAD端閱讀文獻，你可能還需要一個papership軟件。所以，這篇博客記錄一下三者聯合安裝的過程，中間可能會需要遇到一些問題，記錄下來填坑指南。

更新2020-04-13 11:50：

1. 我們在第三章的第四小節中然對Location of File位置不進行修改，也就是使用Attach sorted copy of files（原文已經進行修改了）。這樣做的原因就是我們發現如果使用自定義的位置，就會在papeship中出現pdf文件打不開的錯誤。也就是出現第五章的問題二：同步文獻的附件PDF在PaperShip打不開錯誤。如果改成Attach sorted copy of files之後，pdf文件是直接可以讀取的，而不需要手動進行修改了。
2. 如果出現了Zotero沒有幫我們自動改名字，可以通過下面這個步驟進行更改：右擊需要改名字的PDF文件——Manage Attachments——Rename Attachments。或者在標題右側直接進行修改。
   

1. 安裝Zotero

軟件的優點這裏就不介紹了，感興趣的同學可以自己搜一下。這裏主要介紹一下軟件安裝。

首先我們在Zotero|Home上下載：

1. 下載：Zotero 5.0 for Windows和Zotero Connector，因爲我們使用Google瀏覽器，順便把插件也安裝一下。（如果你是火狐瀏覽器或者其他瀏覽器需要在 Zotero connector for other browsers自己安裝一下）

2. 在Zotero官網註冊賬號，記住賬號密碼啥的。

3. 打開Zotero Windows軟件，在： 編輯——首選項——同步——設置，輸入用戶名和密碼 就可以了。
   

2. 安裝堅果雲

這裏使用堅果雲另外一個原因就是支持webDAV功能，該功能一個好處是，在iOS移動端的papership也可以通過webDAV讀取資料庫，這裏我們先按下不表，在後面在慢慢介紹。

1. 在官網下載堅果雲
2. 然後在註冊一個賬號，登錄以後，然後點擊右上角的賬號名稱——賬戶信息——安全選項——第三方應用管理——添加應用密碼。應用名稱我寫的zotero，之後會自己生成一個應用密碼。（這裏的話有三個信息，分別是服務器地址，賬戶，密碼，這些都要記住，不僅僅需要在Zotero軟件中填寫，也需要在後面的papership中填寫。）
   
3. 首先我們在Zotero中填寫這個WebDAV地址。打開zotero,編輯——首選項——同步——文件同步，使用zotero改成WebDAV，然後複製剛纔堅果雲內第三方應用管理的服務器地址、賬戶和密碼，密碼點擊下面zotero對應的”顯示“複製即可。全部填入後點擊下面”Verify Server“按鈕。（這裏，需要注意一下，網上在這裏是否使用WebDav地址有不同的版本，有些說填寫，有些說不填寫。這裏的話我後面和papership進行聯調的時候發現，如果這裏不填寫WebDAV地址的話，會導致之後再IOS端不能不能查看pdf文件，雖然在本地是可以同步的，但是在IOS端好像不能進行同步，所以這裏的話我們還是將這兩個文件同步 √號都打起來。）
   

3. 安裝ZotFile工具

ZotFile工具實現pdf文件與題錄的拆分管理。

參考Zotero配置堅果雲的技巧！和Zotero 5.0使用教程/堅果雲同步盤和Zotero的配置過程詳解 （這裏我們對兩篇博客進行了融合，各取所長。）

1. 首先進入ZotFile的github主頁，將最新版本的zip源碼包下載下來，並解壓。

2. 進入解壓出的文件目錄內，將目錄內的文件重新打成zip包，並將擴展名zip改爲xpi。

3. 進入Zotero插件管理頁面，選擇從文件安裝插件，安裝上面的xpi文件，重啓Zotero即可。

4. 接下來我們還需要進入插件的管理頁面，對Zotfile進行一些設置，工具——zotfile proferences——General Settings，首先將Source Folder for Attaching new Files中的目錄設置爲瀏覽器默認的下載文件目錄（這裏，瀏覽器的下載文件目錄，以gooogle瀏覽器爲例子，你可能需要找到瀏覽器的默認下載路徑，然後改成一致，這一點也是十分重要的。如果不改成一致，後面同步文件起來還是比較麻煩的。）然後我們對Location of File位置也進行修改，使用Custom Location（在Zotero 5.0使用教程/堅果雲同步盤和Zotero的配置過程詳解 中作者使用Attach sorted copy of files，這裏我們還是按照這種方法，要不然在papership中就不能閱讀pdf了，改動起來也是比較麻煩。

5. 在編輯——首選項——高級——文件和文件夾中。首先設置根目錄爲上面第四步設置的路徑E:\Z - Backup - Zotero（需要保持一致）。然後在數據存儲位置改爲自定義，更改默認存儲位置（減少對C盤的消耗，這個位置是我們pdf所保存的位置，所以我們將默認的C盤改掉）。

6. 設置堅果雲同步，也就是在E盤中Z - Backup - Zotero點擊右鍵-》堅果雲-》同步，這樣就同步好了。（因爲我們已經同步好了，所以就沒有顯示同步這個字眼了。）

4. Zotero和堅果雲的使用

一般寫到這裏，軟件算是基本裝好了。但是如果不說怎麼樣，其實也還算是沒用的，這裏我們就舉一個簡單的例子來演示一下。

1. 在arxiv-sanity官網我們隨便找一篇文章，看到右上角的文件標誌了嗎，那就是Zotetor和Google瀏覽器的插件。
2. 右鍵，save to zotero，然後選擇第一個。
3. 點擊一下，這個時候就會出現如下界面，我們直接選擇一個文件夾保存（這個文件夾創建是在Zotero Windows提前創建的，因爲有同步的功能，所以在瀏覽器插件就會顯示了。）
   
4. 我們在Zotero windows打開就會顯示剛剛下載的文件相關信息了。
   
5. 這個時候還沒有下載PDF文件，我們將文件下載下來，注意不要修改文件路徑，以免找不到文件。（這個文件位置是我們在第三章的第4步驟說明的文件夾路徑，注意一下。）
   
6. 保存完畢之後返回到軟件界面，右擊剛纔下載的文章，選擇Attach New File，剛纔下載好的PDF文件就會自動被放在這個目錄下，並且zotfile自動啓動將文件名改好，整個自動化過程。
   
   
   然後在文件下面就會生成pdf文件，自動命名好了，很方便。然後我們就可以閱讀PDF了。
   
   

5. papership使用

這是一個可以在蘋果手機上可以看到Zotero的，支持WebDav服務。

5.1 軟件安裝

參考zotero的雲服務與移動應用程序

1. 在蘋果系統的程序市場，檢索zotero，就可以找到PaperShip。
2. 點擊Papership圖標，
   2.1 啓動應用後，點擊【Login with Zotero】；
   2.2 用ZOTERO賬號登錄；
   2.3 授權ZOTERO API key for Papership，點擊【Accept Defaults】
   2.4 之後就是Papership從ZOTERO服務器下載各種文獻信息。 Papership會提示是否下載所有文件，如果想下載所有文件，特別是論文的附件（例如PDF格式論文全文），點擊【Download】，否則點擊【Later】，僅下載文獻條目信息。

軟件大概像這樣。

5.2 papership 中WebDav設置

點擊上面圖片中右上角的齒輪標誌，點進去之後zotero file hosting。

輸入堅果雲上得到的WebDav地址。

問題一：然後驗證點擊Verify server，這個時候可能會出現驗證服務器失敗的錯誤。

解決起來也不難。堅果雲 | Papership或Zotero使用webDAV驗證服務器不成功怎麼辦？堅果雲官網（這個可以在堅果雲客戶端上點擊右上角的網址就可以了），登錄堅果雲賬號，在zotero文件夾新建空白的lastsync.txt文件，務必注意的是，必須使用堅果雲自帶的新建文件工具來新建lastsync.txt文件，不能通過手動上傳的方式。如下圖所示：

問題二：同步文獻的附件PDF在PaperShip打不開

也就是我們可以在papership中打開目錄信息，但是打不開pdf文件

解決：Zotero+PaperShip的使用及問題 大家可以參考這個進行修改，結果證明還是可以的。由於電腦端用了rename Attachments，然後把文件刪除，重新用“附加文件副本”在添加一遍即可。雖然這樣下了刪，然後重建添加副件麻煩了一點，但是也保證papership可以正常看到pdf文件啊。

最後我們終於在手機端看到了pdf文件，感動啊。（PS:如果需要對pdf文件進行手機端修改，可能需要花費68~~暫時用不到了）

6. 參考博客

1. 堅果雲 | Papership或Zotero使用webDAV驗證服務器不成功怎麼辦？
2. Zotero配置堅果雲的技巧！
3. Zotero 5.0使用教程/堅果雲同步盤和Zotero的配置過程詳解
4. zotero的雲服務與移動應用程序
5. PaperShip官網
6. 研究僧 - 在 IPAD 上閱讀文獻並與 Zotero 文獻庫同步

更新2020-04-14 12:04：
今天發現Zotero太好用了，尤其是在筆記上面，它是可以直接複製圖片顯示的，感覺太好了。另外，買了一個papership會員，感覺也是很棒的，在papership修改的東西也是可以在電腦端進行顯示的。不錯不錯。

花了一天的時間也算是弄好了，中間幾乎要放棄了，但是最後還是看各種博客解決了，真的不容易啊。後面嘗試一下在Linux和多臺電腦上測試一下，看看能不能同步。後面使用中遇到什麼問題，我在更新了。