Java Web開發中，有許多共通的問題，是開發人員在開發過程中一定會遇到的，需要處理的問題：
1. 亂碼問題
爲何會出現亂碼問題？既然有亂碼問題，肯定是由於編碼設置的不一致導致的。在Web開發過程中，涉及以下一些編碼設置，客戶端參數的編碼設置，Web服務器的編碼設置，服務器端應用程序的編碼設置，數據庫的編碼設置等。只要這四處的編碼設置有不相同的，就可能會出現亂碼問題。開發人員在進行開發之前，不防先了解一下這四個編碼在哪裏設置，當前自己的項目設置是怎麼樣的，這樣就可以很好的避免編碼問題。
2. 權限控制
對於一個Java Web系統，不是所有的頁面與功能都允許所有的用戶訪問的，這樣就需要對用戶能訪問哪些頁面進行控制了。一般的Java Web系統，都需要進行權限控制。進行權限控制的方法有很多，以前看到有不少項目直接在程序裏寫權限控制的代碼，這樣的弊端是顯而易見的，太不利於擴展了，只要有任何的修改，都需要改動相當的代碼，一是容易出錯，二是修改的代價大。一個比較好的想法是基於AOP的思想，使用攔截器來進行權限控制，當然前提是系統要配置一定的數據庫結構，如用戶-角色-權限表這樣的表結構。當然，目前有不少的權限控制開源框架如acegi
3. 參數驗證
All Input Is Evil。對於輸入參數的驗證是少不了的。對於參數的驗證，有客戶端驗證與服務器端驗證，一般來說，能夠在客戶端進行驗證的，優先考慮客戶端驗證以減少服務器端壓力。現在有許多的Javascript框架可以很好的完成這一工作。如Jquery Validation插件。
4. 異常處理
應該說對於每個系統來說，異常處理都是很重要的。但在B/S結構的環境中，異常就顯得更爲重要，一個設計良好的異常處理框架可以減少很多的代碼編寫工作。
5. 參數傳遞
在B/S結構，基於HTTP來完成通信，每一次的客戶端與服務器端的交互都是一次參數傳遞的過程。控制參數的傳遞過程就顯得很重要了。要清楚的知道每一次的B/S的交互，需要傳遞哪些參數，哪些參數是合法的，哪些參數是不合法的，是通過GET方式還是通過POST方式，還是通過URL鏈接的方式。
6. Ajax
現在的Java Web系統，不使用Ajax技術是不可能的了。Ajax實在是一項不錯的技術，不刷新頁面而完成與服務器端的通信，它使得基於B/S的結構功能更強大了，許多傳統的Web應用程序所無法完成的功能現在大都可以用B/S架構來實現。對於Ajax現在已經有很多成熟的Javascript框架可以使用。首推jQuery，其提供的Ajax功能簡單而實用。
7. 客戶端Javascript技術
客戶端技術有很多，Javascript應該說是功能最強大、應用最廣泛的一個了。用好Javascript，在系統設計時多考慮客戶端的實現方式，可以很好的輔助進行服務器端的功能設計。優秀的Javascript框架還是推薦jQuery，其功能簡單、實用而強大。
8. 安全認證
Web應用程序的安全機制有二種組件：認證和授權。基於J2EE的Web容器提供三種類型的認證機制：基本認證、基於表單的認證、相互認證。由於能夠對認證用戶界面進行定製，大多數的Web應用程序都使用基於表單的認證。Web容器使用在Web應用程序的部署描述符中定義的安全角色對應用程序的Web資源的訪問進行授權。
9. 系統日誌
日誌，源於log，有航海日誌的意思。指記錄海員記錄每天的行程，生活及發生的事件。在軟件開發領域，用來監控代碼中變量變化，跟蹤代碼運行的軌跡，在開發環境中擔當調試器作用，向控制檯或文件輸出信息。從功能上講，這些可以分爲三類：
一是日誌工具類，它實現了日誌的記錄，格式化和級別的劃分，代表爲logback，simplelog。
二是日誌系統，提供了完整的框架功能並實現了日誌記錄。代表爲jul（jdk提供的日誌框架），log4j（apache開源項目）。
三是抽象整合類，它提供了一組接口，完成日誌功能，通過包裝其他日誌工具或系統來工作jcl（apache開源組件），slf4j。
10. 後臺數據庫