Graphpad prim 和 SPSS 繪製 Bland-Altman 圖

原文地址:http://mp.163.com/v2/article/detail/EMC5UAF70516C2JV.html

 

首先,我們把Prism打開,這裏使用Prism 8進行演示,各版本的界面可能稍有差異,但差別不大。

  打開軟件後,左邊選擇“Column”,數據表裏選擇“Start with sample data to follow a tutorial”,之後下面會出現選擇,找到“Bland-Altman method comparison”。(老版本比如Prism6,“Column”—“use tutorial data”—在下拉菜單中選擇“Bland-Altman method comparison”):

  

  點擊“Create”後出現如下界面,即數據輸入界面,包括軟件提供的演示數據,以及作圖的簡介:

  

  我們將需要檢驗的數據,直接複製粘貼至數據輸入界面:

  

  數據有了,我們找到上面工具欄中“Analyze”進行分析作圖:

  

  在跳出的對話框中,找到“Bland-Altman method comparison”,點擊OK:

  

  之後,系統會讓你進行數據的選擇,“Data sets”我們僅輸入兩組數據,因此默認無需更改。

  計算方式: 第一種就是“差值vs均值”,第二種是“比值vs均值”,這兩種方法我們之前介紹過。另外,Prism還提供了其他方法,如百分比的差異,或者兩種方法反過來比較。

  這裏我們以第一種,也是最常用的一種爲例:

  

  結果有兩大部分,第一部分主要是數據結果,包括差值的均數Bias,標準差,95%置信區間的上限和下限:

  

  第二部分就是圖,下圖是初步生成的B-A圖,我們需要對這個圖進行適當的美化,添加Bias和95%CI的線:

  

  雙擊Y軸,彈出如下對話框,均值線和95%CI的線需要通過添加額外的Y軸的線來完成(Additional ticks and grid lines),點擊下圖“Details”:

  

  

  出現的對話框中,軟件已經提供了我們需要的值,先選擇“Bias”:

  

  這樣框中的Y值就有了,然後我們根據需要,設置一下Bias線的樣式:

  

  點擊OK後“Additional ticks and grid lines”中就有了Bias的線:

  

  

  最後,我們需要的線就有了:

  

  我們還可以根據需要,對圖形進行美化:

  

  這就是“差值vs均值“的Bland-Altman圖的繪製方法,如果需要“比值vs均值”的圖,只需要在選擇計算方式時選擇相應方法即可!

  SPSS實操

  首先將數據準備好: A測量方法和B測量方法,A法與B法的差值 difference ,A與B的平均值 average ,A與B的比值 ratio 

  

  

  首先演示“用差值進行Bland-Altman分析”,散點圖X軸選擇average,Y軸選擇difference:

  

  

  雙擊圖像進行編輯和美化,添加擬合線(Bias線):

  

  添加95%CI的線:

  

  依次輸入95%CI,添加相應的線:

  

  

  線添加好了,之後別忘了美化一下圖形:

  

  圖像美化:

  

  如果是“ 用比值進行Bland-Ahman分析 ”,那麼Y軸選擇ratio:

  

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