Liunx下HPCC(HPC Challenge)的安裝運行

安裝運行步驟

• 下載安裝mpich

  或者其他MPI實現應該也行，參考網上相關教程，已安裝則可以忽略這一步。

• 下載安裝blas

  wget http://www.netlib.org/blas/blas.tgz
  tar zxvf blas.tgz
  cd BLAS-3.8.0/
  # sudo apt-get install gfortran 如果沒有fortran編譯器需要先安裝一下gfortran
  gfortran -c  -O3 *.f  # 編譯所有的 .f 文件，生成 .o文件
  ar rv libblas.a *.o  # 鏈接所有的 .o文件，生成 .a 文件
  cp libblas.a /home/huangxinxin/hpcc/lib/ # 將.a文件拷到相關目錄下
  

• 下載安裝cblas

  wget http://www.netlib.org/blas/blast-forum/cblas.tgz
  tar zxvf cblas.tgz
  cd CBLAS/
  cp Makefile.LINUX Makefile.in # Linux環境下使用Makefile.LINUX
  cp /home/huangxinxin/hpcc/lib/libblas.a testing/ # 將上個步驟編出來的libblas.a拷到testing目錄下
  make
  cp lib/cblas_LINUX.a /home/huangxinxin/hpcc/lib/libcblas.a # 將編出來的庫文件拷到相關目錄下
  

• hpcc源碼下載

  wget http://icl.cs.utk.edu/projectsfiles/hpcc/download/hpcc-1.5.0.tar.gz
  tar zxvf hpcc-1.5.0.tar.gz
  cd hpcc-1.5.0
  

• Make文件編寫

  cp hpl/setup/Make.Linux_PII_CBLAS hpl/Make.Linux
  

  Make.Linux需要根據自己的環境信息進行修改，主要有以下幾個配置項：

  • MPdir、MPinc、MPlib這幾個和MPI相關的配置項可以註釋掉
  • HPL_LIBS後面加上blas、cblas庫的連接信息:-L/home/huangxinxin/hpcc/lib/ -lcblas -lblas
  • CC配置項將gcc替換成mpicc：CC = /usr/local/bin/mpicc
  • LINKER配置項將g77替換成mpif77，如：LINKER = /usr/local/bin/mpif77

  以下爲Make文件的一個Demo：

  SHELL        = /bin/sh
  CD           = cd
  CP           = cp
  LN_S         = ln -s
  MKDIR        = mkdir
  RM           = /bin/rm -f
  TOUCH        = touch
  ARCH         = $(arch)
  TOPdir       = ../../..
  INCdir       = $(TOPdir)/include
  BINdir       = $(TOPdir)/bin/$(ARCH)
  LIBdir       = $(TOPdir)/lib/$(ARCH)
  HPLlib       = $(LIBdir)/libhpl.a
  F2CDEFS      =
  HPL_INCLUDES = -I$(INCdir) -I$(INCdir)/$(ARCH) $(LAinc) $(MPinc)
  HPL_LIBS     = $(HPLlib) $(LAlib) $(MPlib) -lm -lcblas -lblas
  HPL_OPTS     = -DHPL_CALL_CBLAS
  HPL_DEFS     = $(F2CDEFS) $(HPL_OPTS) $(HPL_INCLUDES)
  CC           = /usr/local/bin/mpicc
  CCNOOPT      = $(HPL_DEFS)
  CCFLAGS      = $(HPL_DEFS) -fomit-frame-pointer -O3 -funroll-loops
  LINKER       = /usr/local/bin/mpif77
  LINKFLAGS    = $(CCFLAGS)
  ARCHIVER     = ar
  ARFLAGS      = r
  RANLIB       = echo
  

• 編譯hpcc

  make arch=Linux  # arch的值爲hpl目錄下Make.Linux的後綴,make操作需要在頂層目錄執行，即hpcc-1.5.0，執行完在該目錄會生成一個名爲hpcc的可執行文件
  

• 運行hpcc

  cp _hpccinf.txt hpccinf.txt # hpccinf.txt中包含了許多運行時的配置項，可以自己研究一下
  mpirun -np 2 ./hpcc # 運行結束後會在當前目錄生成一個hpccoutf.txt的結果文件