妻子懷了別人的孩子，丈夫同意生下來，老丈人卻偷偷地在雞湯裏下了毒。
耳朵是和未婚夫左石到城裏賣土豆的，來了一個大客戶說他是對面餐館的，要40斤土豆。
看左石在忙着招呼顧客，耳朵就背起土豆跟着客人給他送去，穿過一道街，來到一輛昌河車跟前，耳朵還沒反映過來，就被裝進麻袋扔進了車裏。
左石泡好了面等耳朵喫，面都涼了，也不見耳朵回來，他忙去對面餐館問，老闆說他今天並沒有進土豆，看着散落一地的土豆，左石有了一種不祥的預感，他一邊找喊着耳朵的名字一邊尋找，直到天黑了下來，依然沒有耳朵的蹤影。
失魂落魄的左石來到老丈人家中，跟小姨子說了事情的經過，然後兩人去報了警。擔心耳朵回來找不到自己，左石又回到攤位上焦急的等待，一夜未眠的左石並沒有等來耳朵。
已經佈置好的婚房裏，左石看着和未婚妻的合影，不由掉下了痛苦的眼淚，兩人的婚期在即，耳朵卻不在了自己身邊。
一年後，有了耳朵的消息，原來耳朵是被人販子賣了，剛解救回來。派出所裏，耳朵呆呆的坐在那兒，見了左石，她楞了一會兒，然後痛哭失聲，左石抱着她，一番安慰後，帶着她回村。
還沒到村口，耳朵就喊着停車，然後說自己沒有臉回村，不如死掉算了，左石向她保證，以後不管發生什麼，誰也不能把他們分開。
耳朵哭着說對不起左石，她不僅被人糟蹋了，還懷了混蛋的孩子。左石堅定地說：“這一切都不是你的錯，在我心裏，你就是我的媳婦。”
耳朵被左石感動，跟他回了家，村裏人聽說耳朵回來了，都跑來看她，很多人表面上是噓寒問暖的關心，實際是在看熱鬧和笑話。
耳朵的父親問左石下一步準備怎麼辦，左石說這兩天就準備和耳朵結婚。老人嘆口氣說：“你娶也好，不娶也罷，娶了就要好好的對她。”
左石和耳朵商量先把孩子做掉再結婚，左石的爹孃一聽就不樂意了，他們對兒子說：媳婦未過門，就懷了別人的野孩子，你又不是娶不上媳婦，爲何非要娶個不乾不淨的女人？左石則態度堅決，非耳朵不娶。
左石帶着耳朵去到醫院，醫生告訴他們，孩子月份大了，這個時候流產是在拿命賭，耳朵一聽，不願意讓左石爲難，再一次提出分手，左石不答應，說只要耳朵高興，怎麼樣都行。
聽說兩人要把孩子生下來，耳朵的父親第一個不同意，他氣得摔了飯碗，罵左石不是男人，這樣一來，還怎樣在村裏擡起頭來。
左石的父親也被氣的生病住院，面對來看他的兒子，大罵着讓左石滾。左石再次跟父親表明立場，寧願頂着不孝的名聲，也不會和耳朵分開。
左石回到家裏，弟弟正躺在他的婚房裏，弟弟跟左石說：“咱爸說了，你要結婚就去老房子裏結，這間新房子給我來住。”
多年沒有住人的老屋，早已破舊不堪，耳朵不嫌棄，爲有了自己的家而高興，兩人把房子從裏到外收拾一遍，婆婆心疼兒子，悄悄地給左石送來了一千元錢，對於耳朵，她不願多說一句話。
左石和耳朵的婚禮沒有親朋，沒有祝福，兩人做了幾樣菜，放了鞭炮算是結了婚。掀開耳朵蓋頭的那一刻，兩人都落淚了，能娶耳朵進門，一直是左石的心願。在這個大喜的日子裏，他喝着酒，唱着歌，哄得耳朵哈哈大笑。
傍晚的時候，老丈人送來了一碗雞湯，說是給耳朵補補身子。夜裏，耳朵的肚子忽然疼了起來，左石抱着她去醫院，醫生問她喫過什麼東西，兩人明白了，原來事情就出在那一碗雞湯上面，好在搶救及時，胎兒給保住了。憤怒的左石，回去把老丈人狠狠地罵了一通。
兩個月後，耳朵生下了一個男孩，左石精心侍候着，耳朵建議把孩子送人，畢竟是從自己身上掉下的肉，其實她從心裏捨不得孩子。
孩子送走的那天，耳朵趴在窗戶上哭着目送，看到妻子自從孩子離開後，就一副無精打采的樣子，左石很心疼。
一天早上醒來，左石不見了耳朵，他瘋狂地尋找，在一座山上，他看到耳朵呆呆地站在那裏，望着孩子離家的方向。
左石不忍妻子痛苦，就和她商量，真想孩子的話，咱就再要回來，孩子在妹夫的幫忙下要回來了，夫妻倆給他起名字叫男男。
爲了安慰丈夫，耳朵催着左石找村長再辦個準生證，她想快點給左石生一個屬於他自己的親生孩子。
帶着孩子去打疫苗，護士問孩子叫什麼名字，耳朵不知如何回答，左石搶着說：“姓左，叫左男男。”看着從心底裏接受男男的左石，耳朵很欣慰。
妹妹給耳朵送來兩箱東西，兩天後，警察來找來了，打開箱子一看，裏面竟是文物，左石被當做嫌疑人抓了起來。
耳朵焦急地趕往公安局，卻在半路出了車禍，多日昏迷不醒。孩子只好有左石的父母照看，慢慢的，老左不再排斥男男，反而漸漸的喜歡上了這個孩子。
兩個月後，犯人落網，左石回了家，男男會走了，耳朵的腿也能恢復走路了，一家人真正的幸福日子從此開始。
這是電影《丟失的耳朵》的主要故事情節，被拐賣的耳朵是不幸的，她受到親人的冷落和村民們的流言，耳朵又是幸運的，她遇到了深愛她的男人，爲了保護她，自己寧願被人嘲笑。真愛可以超越一切，只有敢於承擔責任的人，才配擁有。