Tools4You
是什麼
Tools4You
是一個基於R shiny
的網頁工具,能夠完成常見的統計分析及數據可視化。
Tools4You
的開發初衷
作爲R
語言的重度使用者,自從習慣用R
以後,我就很少用那些破解版的付費軟件,如SPSS
、OriginLab
等。我們課題組相對比較大,總是有同學在找各種軟件的破解包來進行統計分析或者是繪圖。使用盜版(破解)軟件有些不足之處,比如說破解的版本經常無法使用,或者說在投稿的時候因爲破解版軟件影響到文章等。相比之下,R
作爲一個完全開源免費的軟件,在生命科學領域正在大放異彩,囊括了從統計分析到數據可視化的各種功能,不乏CNS
級別的文章都使用R
進行統計和繪圖。但是要從頭學習一個語言是比較困難的,雖然R
的學習曲線相對來說不是很陡峭,但是對於我們農學口的研究生來說,要拿出大把的時間學習R
也是比較困難的。很感謝我的導師,從我本科畢業開始就讓我往生信方向走,從那時候開始學習R
,現在也快兩年半了,算不上精通R
,我認爲我只是熟悉R
。在研三這個特殊的時期,我突然決定以R shiny
爲基礎開發一個網頁版工具,供實驗室的同學使用,如果能夠幫助到其他學校/研究所的同學,那我將倍感榮幸。
Tools4You
目前預計功能模塊有30個左右,總代碼量達到1.5~2.0W行。由於目前完全是我一個人在開發,臨近畢業需要寫畢業論文+做實驗,所以進度較慢,預計一週能夠更新1-2個功能模塊;一個人開發,免不了代碼不規範、代碼冗餘,暫時的目標是搭建好一個基本的可使用的框架,更多細節留在後面慢慢調試。
目前
Tools4You
託管在阿里雲服務器上,由於服務器內存只有2G,訪問的時候加載時間大概是10秒左右,還請耐心等待。如果遇到報錯或者是有任何的建議意見,歡迎聯繫我們:
訪問Tools4You
瀏覽器訪問網址http://shinyapp.top:3838/Tools4You/,手機端暫不兼容。
訪問連接成功後便是如下界面:
主要分爲3個大的功能模塊:
常用小工具
:分組求均值,數據正態性檢驗,方差齊性檢驗等;統計&分析
:常見的統計分析方法;數據可視化
:生命科學研究中常見的圖形。
點開每個大的功能模塊下會有具體的功能模塊。
t
檢驗
使用流程:
上傳數據
:目前只支持.csv
格式文件的上傳,檢驗先下載示例數據,按照示例數據的格式整理數據,然後上傳分析;選擇統計檢驗的置信度
,通常是0.99或者0.55,默認的是0.99;下方的
單尾/雙尾
和方差相等
通常都是默認值;配對數據
:如果數據是配對的,選擇是
,否則就是默認否
;誤差棒數據
:選擇柱狀圖誤差棒是用標準誤
還是標準差
,默認是標準差
;下載參數設置
:下載統計分析結果的文件格式,默認的是'Excel'文件,圖片下載格式默認的是PDF
,下面是圖片的長度和寬度設置;繪圖參數設置
:座標軸及圖片名稱等,需要注意的是,如果沒有輸入在那個分組上標註顯著性,則默認在兩個柱子上都標註顯著性;將所有參數設置完成後,點擊
點擊提交
即可;如果需要調整某個參數,則在調整完參數後再次點擊
點擊提交
;完成後下載對應的表格結果和圖片即可。
注:展示的圖片長寬和下載的圖片長款是沒有關係的,如果需要更進一步的細節修改,可以使用AI
等軟件進行調整,也可以在後續我們更新相關模塊後進行細調整。
t
檢驗結果解讀
這是t檢驗
的結果,從左到右分別表示:分組名稱、重複數量、和、均值、標準差、標準誤、P 值和顯著性。
這個是導出的繪圖結果,基本能用。