關於VASP環境搭建的概念問題

非計算機專業對Linux下軟件編譯缺乏概念，下面簡單梳理下Vasp編譯時的一些概念，幫助理解。

 

 

VASP 是 Fortran 寫的平面波 DFT 程序。雖然不是 free software，但 VASP 的 license 並不貴，計算效率高，而且允許用戶自行修改源碼實現想要的功能；

思考題：

1. 爲什麼Vasp的軟件需要編譯安裝，不能像windows應用程序有安裝包？

如果要編譯安裝，瞭解編譯器基本知識Inter,MS,GNU

GNU是開源免費的

 

編譯安裝工具：

sudo apt-get install make build-essential g++ gfortran

然後安裝 BLAS、LAPACK、SCALAPACK、FFTW3、OpenMPI（這些是科學計算第三方依賴庫）

sudo apt-get install libblas-dev liblapack-dev libscalapack-mpi-dev libfftw3-dev libopenmpi-dev

爲了加速計算，可以安裝 Intel MKL（閉源、學術免費）。首先下載 GnuPG key

cd /tmp
wget https://apt.repos.intel.com/intel-gpg-keys/GPG-PUB-KEY-INTEL-SW-PRODUCTS-2019.PUB
sudo apt-key add GPG-PUB-KEY-INTEL-SW-PRODUCTS-2019.PUB

 

然後把 MKL 加到 apt-get 的列表裏

sudo sh -c 'echo deb https://apt.repos.intel.com/mkl all main > /etc/apt/sources.list.d/intel-mkl.list'sudo apt-get update

最後，安裝 MKL，一路按 Tab 補全，查看選擇最新的版本：

 

sudo apt-get intel-mkl-64bit-2020.4-912

安完之後在 ~/.bashrc 裏設置 MKLROOT 環境變量，可以加入~/.bashrc：

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export MKLROOT=/opt/intel/mklexport PATH=$PATH:/opt/intel/binexport LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/opt/intel/mkl/lib/intel64_linexport LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/opt/intel/mkl/lib/intel64

 

之後再安裝Vasp即可。