前文已述，在隋朝攻滅南陳一統天下後，曾下令將南京城夷平，這是玄武湖首次遭劫，導致玄武湖就此消失兩百多年。
此後，隋唐時期隨着政治中心的北移，南京地位下降，玄武湖也就此被冷落，直到五代十國時期，南唐政權才使得玄武湖一度復興。
南朝末年至隋朝，戰亂頻頻。由於多年未疏浚，唐朝以後玄武湖逐漸淤淺，等到了北宋時期，"桑泊之淤甚矣"。
《宋史·河渠志》中有載：“城北有後湖，往時歲旱水竭，給爲民田，凡七十六頃，出租錢數百萬，蔭灌之利遂廢”。
可見宋時的玄武湖淤塞面積極廣，部分湖面在乾旱後已經被開闢爲農田，長此下去，玄武湖必然要再度消失。
面對如此局面，該如何解決呢？
