一級結構（初級/基本結構）：氨基酸的排列順序。
分析內容：
蛋白質的氨基酸組成
等電點（PI）
分子量（molecular weight,Mw）
疏水性（hydrophobicity）
1. 分析蛋白質氨基酸組成、PI、Mw（ProtParam）
ExPASy(Expert Protein Analysis System)
http://www.expasy.org
打開ExPASy主頁 → 單擊“Resources A...Z”→選擇ProtParam分析軟件
→ 在ProtParam主頁粘貼序列進行分析→ 蛋白質的PI、Mw、氨基酸組成等
2. 分析蛋白質的疏水性 ---- ProtScale
打開ExPASy主頁 → 單擊“Resources A...Z”→選擇ProtScale分析軟件
→ 在ProtScale主頁粘貼序列、選擇進行方法 → 蛋白質的親水和疏水性分析結果，有文字和圖形兩種顯示方式