原创 【Python/圖像處理】繪製二值圖輪廓的N種方法

2D圖像繪製輪廓 1.cv2.findcontours() 2.skimage.measure.find_contours() 3.cv2.Canny()   3D圖像繪製表面 1. 拆分成若干張2D圖像, 使用2D方法 2. skima

原创 【醫學影像】如何無信息損失的讀取、處理和保存nii文件(python,nibabel)

最近工作中需要解決一個問題: 讀取nii格式的醫學圖像,更改內部的矩陣,重新保存成nii數據 但是Nifti數據本身是除了 矩陣信息(也就是圖像信息之外),還有和物理座標相關的 仿射矩陣 以及 Header頭文件 信息,但是nibabel

原创 【Ubuntu】【Python】shell cp和shutil.copy 用時小測試

新接手的代碼有很多是用python來調用shell代碼,看起來易讀性比較差,還需要考慮參數、命令所在的環境位置等因素,考慮用python的模塊來取代一部分shell命令,用最簡單的copy測試了一下 任務:複製同一個文件test.sh到本

原创 【FreeSurfer】mgz和nii.gz數據類型轉換

使用freesurfer進行醫學圖像類型轉換   在使用freesurfer進行配準的過程中,需要數據格式爲mgz,此時可以使用freesurfer內部命令進行數據類型轉換 #Shell 代碼 # mri_convert <ouput

原创 【ABee讀論文】場景分割的雙重注意力網絡

【論文題目】 Dual Attention Network for Scene Segmentation 場景分割的雙重注意力網絡  【期刊】 CVPR2019 【摘要】 本文提出了一種基於自注意機制的場景分割方法。  

原创 【Ubuntu】 各種軟件教程存檔

目錄 Ubuntu18.04下安裝MySQL Ubuntu 18.04 搜狗輸入法安裝   Ubuntu18.04下安裝MySQL 重點: 1.安裝Mysql sudo apt install mysql-server 2.檢查是否安裝

原创 如何酷炫的在Linux系統下使用多屏幕

xrandr #查看設置 xrandr --output eDP-1 --auto --primary #把筆記本的屏幕設爲主屏幕 xrandr --output DP-1 --left-of eDP-1 --auto #把分屏1設在

原创 【Abee】吃掉西瓜——西瓜書學習筆記(六)

貝葉斯分類器   目錄 【內容包含 第七章】 貝葉斯決策論(Bayes decision theory) 極大似然估計(Maximum Likelihood Estimation,MLE) 樸素貝葉斯分類器(naive Bayes cla

原创 【Abee】吃掉西瓜——西瓜書學習筆記(五)

支持向量機(Support Vector Machine,SVM) 【內容包含 第五章】   間隔與支持向量 分類學習的主要思想是在樣本空間中找到一個劃分超平面,將不同樣本分開。 超平面可以定義爲                    

原创 【Abee】吃掉西瓜——西瓜書學習筆記(四)

神經網絡(neural networks) 【內容包含 第五章】   神經元模型 通過n個其他神經元傳過來的信號,加上權重,當前神經元的閾值進行比較,通過激活函數(activation function)處理,再輸出。 激活函數一般使用S

原创 【Abee】吃掉西瓜——西瓜書學習筆記(二)

線性模型(linear model)   目錄 【內容包含 第三章】 線性迴歸(linear regression) 多元線性迴歸(multivariate linear regression) 對數機率函數(logistic funct

原创 【Abee】吃掉西瓜——西瓜書學習筆記(三)

決策樹(decision tree) 【內容包含 第四章】   基本流程 決策樹(decision tree)基於樹狀結構進行判定,基本流程遵循“分而治之”(divide-and-conquer)策略。 決策樹基本流程 作圖好累(doge

原创 【Abee】吃掉西瓜——西瓜書學習筆記(一)

目錄  【內容包含 第一章、第二章】 沒有免費的午餐(No Free Lunch Theorem) 過擬合(overfitting)與欠擬合(underfitting) 幾種模型驗證方法 模型評估的常見參數 模型性能檢驗   沒有免費的午

原创 箱線圖(Box-plot / Box-whisker Plot)及Python-Matplotlib繪製

箱線圖簡介 主要能夠體現數據的分佈,離散程度,及異常點 Box -whisker Plot  IQR (Interquartile range): ( IQR = Q3 - Q1 ) Q1:第一四分數 Q3:第三四分數 MEDIAN:中位

原创 虛擬機Linux下安裝VMware Tools教程 (小白向)

昨天剛開始接觸Linux,學習用VMware虛擬機安裝ubuntu系統,發現在虛擬機中無法全屏,需要下載VMware Tools,官網教程 不太新手友好,就卡了一段時間,不過最後還是解決了~ 1.虛擬機安裝Ubuntu系統 下