原创 GCLGP | 圖卷積高斯過程
作者 | 朱玉磊審稿 | 楊喜喜今天爲大家介紹Felix L. Opolka和Pietro Li`o在ELLIS上的一篇文章，這篇文章是關於圖的鏈接預測的。作者介紹了一種新的在圖節點上運行的圖卷積高斯過程模型，先是通過圖形卷積變換將歐幾
2020-07-03 09:54:28
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原创 MuRP | 雙曲空間下知識圖譜鏈路預測新方法
作者 | 李芬審稿 | 楊喜喜今天給大家介紹收錄在NIPS2019的文章“Multi-relational Poincaré Graph Embeddings”，該文章由愛丁堡大學信息學院和劍橋三星AI中心合作完成。這篇文章提出了一種多
2020-07-03 09:54:28
原创 Nature Cancer | 發現非腫瘤藥物的抗癌潛力
作者 | 金淑婷單位 | 廈門大學今天給大家介紹美國Broad Institute of MIT and Harvard的 Todd R. Golub團隊發表在Nature cancer上的一篇文章：“Discovering the a
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原创 PNA | 使用多聚合器聚合圖信息結構
作者 | 李梓盟審稿 | 陳雨潔今天給大家介紹劍橋大學Pietro Liò團隊發表的一項研究工作“Principal Neighbourhood Aggregation for Graph Nets”。作者針對圖神經網絡（GNNs）的表
2020-07-03 09:54:28
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原创 ICML 2019 | 圖馬爾可夫神經網絡
作者 | 塗心琪審稿人 | 李梓盟今天給大家介紹蒙特利爾算法研究所Yoshua Bengio教授課題組在ICML 2019發表的文章“GMNN:Graph Markov Neural Network”。作者在文章中提出了圖馬爾可夫神經網
2020-07-03 09:54:28
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原创 Genome Research | TransBorrow：通過借用不同拼接工具的拼接結果來引導完成轉錄組拼接...
作者 | 金淑婷單位 | 廈門大學今天給大家介紹的是山東大學（威海）柳軍濤課題組和沙特阿卜杜拉國王科技大學（KAUST）高欣教授課題組（http://sfb.kaust.edu.sa）發表在Genome Research的一篇文章，“T
2020-07-03 09:54:28
原创 ICLR2020 | 圖池化沒有考慮圖結構？一文帶你瞭解最新圖池化STRUCTPOOL
作者 | 程玉審稿 | 俞琳薈今天給大家介紹的是TAMU的Hao Yuan等人的一篇論文，該研究針對目前的大多數圖池化技術忽略了圖結構這一可能會引起重要特徵丟失的信息，巧妙地利用可以捕獲不同節點之間的關係的條件隨機場，並進一步將能量函數
2020-07-03 09:54:28
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原创 元圖：通過元學習進行小樣本的鏈接預測
作者 | 黃偉研究方向 | 元學習，知識圖譜審稿 | 蘇祥今天給大家介紹McGill University和Uber AI一起在 NeurIPS 2020發表的一篇關於元學習的論文。該論文針對目前鏈接預測的方法不能夠在多圖的情況下有效的
2020-06-23 06:36:46
原创 “RDKit | 化學信息學與AI”專欄介紹及專欄內容分類（持續更新......）
“RDKit | 化學信息學與AI”專欄介紹 介紹RDKit相關知識點和運用以及RDKit作爲處理化學、生物、藥學和材料學科中分子數據作爲可輸入機器學習和深度學習模型的重要工具應用。內容涵蓋了基於RDKit的Python3
2020-06-21 07:53:10
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原创 CentOS 7.8下安裝PyRosetta4
PyRosetta是一個Python爲基礎的Rosetta交互套件。其打開了用戶自定義的利用Rosetta採樣方法和能量函數進行自定義建模的方法。 PyRosetta 由Jeffrey J. Gray，Sergey Lyskov和PyR
2020-06-21 07:53:10
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原创 CentOS 7.8下安裝完美安裝配置Rosetta
注意編譯過程中需要海量的內存(>=64GB for -j 24)。 硬件環境 CPU: 50 cores 內存： 80GB 1. 安裝依賴 yum install boost-devel libstdc++ zlib zlib-
2020-06-21 07:08:52
原创 DGL-LifeSci：面向化學和生物領域的 GNN 算法庫
DGL團隊發佈了以生命科學爲重點的軟件包DGL-LifeSci。 嘗試使用新的DGL--LifeSci並建立Attentive FP模型並可視化其預測結果。 基於深度圖學習框架DGL 環境準備 PyTorch：深度學習框架 DGL：基
2020-06-21 07:08:52
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原创 RDKit | RDKit分子結構圖的詳細說明
二維繪製結構式是人類瞭解分子形狀和特性的第一步。 RDKit中有多個繪製引擎，通過使用不同的方法繪製的結構在外觀上有所不同。這次將深入研究RDKit的結構圖，並說明SVG格式的繪製方法，該方法自2015.0
2020-06-21 07:08:52
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原创 CentOS 7.8升級gcc-8.2
檢查環境：安裝gcc、g++ 安裝gcc、g++ yum install gcc yum install gcc-c++ 安裝依賴 yum install libgcc.i686 yum install glibc-devel.i
2020-06-21 07:08:52
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原创 GraLSP | 考慮局部結構模式的GNN
作者 | 塗心琪審稿 | 俞琳薈今天給大家介紹香港科技大學的Yilun Jin等人在AAAI 2020發表的一篇文章“GraLSP:Graph Neural Networks with Local Structural Patterns
2020-06-21 07:08:52