原创 R | 繪製箱線圖
箱線圖是能同時反映數據統計量和整體分佈展示圖，Boxplot從下到上展示的是最小值，第一四分位數 (箱子的下邊線)、中位數 (箱子中間的線)、第三四分位數 (箱子上邊線)、最大值。 數據來源 ：CRA_jobs.txt（通過爬蟲獲
2020-02-23 18:12:55
原创 R | scale()函數標準化
標準化 （Standardization） scale函數標準化處理原理是計算每組的平均值和標準差,再將組內各個數值與其平均值的差，與其標準差的比值，作爲該數值在組內的相對數值。(考慮均值和離散程度) 歸一化（Normalizat
2020-02-23 18:12:55
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原创 R | 包記錄
library(rvest) library(magrittr) library(dplyr) library(tidyr) … magrittr包 : 通過管道的方式讓連續複雜數據的處理操作，代碼更短，更容易讀，甚至一行代碼可以
2020-02-23 18:12:55
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原创 R | 爬獵聘網職位酬薪
library(rvest) library(magrittr) library(dplyr) library(tidyr) ### 單頁抓取數據 get_job_on_page <- function(url){ ##1、通
2020-02-23 18:12:55
原创 生信 | cd-hit
下載：http://www.bioinformatics.org/cd-hit/ 背景：生信分析中經常要根據指定條件查找相似序列，比如構建多個樣品間的非冗餘基因集、分析樣品間的相似程度。 cd-hit 去冗餘，也可以叫做相似序列的聚類 工
2020-02-23 18:12:55
原创 生信 | megahit 序列拼接
MEGAHIT MEGAHIT is a single node assembler for large and complex metagenomics NGS reads, such as soil. Compare to SOAPd
2020-02-23 18:12:55
原创 R | F檢驗
F檢驗(方差齊性檢驗): 主要通過比較兩組數據的方差，以確定他們的密度是否有顯著性差異(判斷兩總體方差是否相等，就可以用F檢驗)。 F檢驗的前提： 數據滿足正態分佈，使用Shapiro-Will進行正態分佈檢驗 # 正態分佈檢驗
2020-02-23 18:12:55
原创 R | failed to load cairo DLL
系統 ：mac os 軟件 ：R-studio 報錯信息 ：failed to load cairo DLL 、package or namespace load failed for 'Cairo' 解決方法：Mac OS X 在
2020-02-23 18:12:55
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原创 R數據管理
原文鏈接：https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzA3MTM3NTA5Ng==&mid=2651056179&idx=1&sn=aed8f5cf51cd1d835a56
2019-09-17 03:54:56
原创 R數據處理——data.table
data.table包是一個超高性能數據處理包 附上鍊接以便後續查閱 R數據處理|data.table篇（一） data.table提取等功能總結 data.table計算、分組計算(多列分組計算) data.table的mer
2019-09-16 04:19:57
原创 R數據處理_基礎
強烈推薦公衆號 “表哥有話講” 以下是 “R語言” （來自：https://mp.weixin.qq.com/s/hLF21F29dFIPj-pJabcNWQ）相關的學習知識（受益良多） （R語言）主要的大數據處理包可以分爲 Had
2019-09-06 04:00:05
原创 繪製帶誤差線的bar圖
繪製帶誤差線的bar圖 利用ggplot2 數據格式轉換並做統計計算 繪製圖形 ## 模擬 ## 導入包 library(ggplot2) library(reshape2) library(RColorBrewer) ##
2019-07-30 02:58:57
原创 ANNOVAR的使用
ANNOVAR的使用： https://www.jianshu.com/p/95331e7a98cd Gene-based annotation 顧名思義，Gene-based annotation是根據SNPs以及CNVs的位置
2019-07-30 02:58:57
原创 python源代碼文件加密
python 程序代碼加密 1.python代碼文件進行轉換， cython myscript.py --embed #把python代碼轉換成c代碼 2.生成後綴爲 .c的c語言的源文件， gcc編譯成二進制可執行文件： gcc
2019-07-30 02:58:57
原创 ROC曲線理解以及實踐
概念 ROC曲線，也稱受試者工作特徵曲線，感受性曲線； ROC曲線最初運用於軍事上，當前ROC曲線在醫學領域有着廣泛的使用。醫學上更多稱爲“陽性”（比如敵機）或“陰性”（比如飛鳥），對應着X軸即1-特異性也稱爲假陽性率（誤報率），
2019-07-30 02:58:56