原创 腦科學讀物閱讀筆記系列 - 拉馬錢德蘭《腦中魅影》- 0.前言

人作爲萬物之靈,區別於其他生物的最不同之處,在於人的思維、意識、語言等等方面,以前人們認爲靈之所在是心臟,可能是由於心臟停止跳動之後人便死了,因此中文造詞中都會將心字旁,樹心旁帶入到表徵心理,心智的詞彙上,這一點中外都是一致的,古希臘哲

原创 腦科學讀物閱讀筆記系列 - 拉馬錢德蘭《腦中魅影》- 3.追蹤幻影

Part 1. 舞動的幻肢 上一章內容我們對作者研究幻肢痛做了回顧,簡單得講大腦之中絕無無用之地,儘管肢體被截斷,但是大腦中負責肢體感應的部分很快會開始執行其他功能,因此會產生截肢依然存在甚至感受到從截肢上傳來的疼痛,這一過程叫做大腦的功

原创 Diffusion MRI的纖維重建算法解析--DTI,ball-and-sticks model,CSD,DSI,QBI,GQI

一. 什麼是纖維重建 對結構MRI影像分析比較瞭解的話一定聽過DTI,即DIffusion Tensor Image,初學時我以爲DTI跟fMRI, T1類似,也是磁共振影像的一種,可以用來表徵大腦內的神經纖維。但是這種認知是錯誤的,實際

原创 腦科學讀物閱讀筆記系列 - 拉馬錢德蘭《腦中魅影》- 2. 幻肢痛

Part 1. 彭菲爾德侏儒--大腦映射圖 我們已經知道,大腦是人體所有活動的中樞器官,我們的日常生活全部由大腦操控,那麼理解大腦如何實現操控,就是腦科學研究的一個重要方面。關於大腦的操控方式有兩種主流的觀點,第一種是整體論,即執行某種功

原创 腦科學讀物閱讀筆記系列 - 拉馬錢德蘭《腦中魅影》- 1.初識大腦

Part 1. 他們是瘋了麼? 一名男子從青春期開始患有顳葉癲癇,此後聲稱自己 “能夠與上帝交談”; 一位運動員在一次事故中失去了一條臂膀,但是他感到自己仍然存在一條“幽靈臂膀”,他可以肆意揮舞這隻隱形的手臂,觸摸東西,甚至當他“握住”一

原创 神器!Stork文獻鳥:你的文獻管家

Stork 文獻鳥是由斯坦福大學成員開發的文獻追蹤的小工具,只需註冊並設置好關鍵詞,就會收到相應的文章。不僅如此,還可以對期刊,影響因子等進行篩選,有的放矢得找到感興趣的內容。     Stork最新推出了翻譯功能,文章標題下方注有翻譯

原创 sMRI剝腦殼--基於FSL_BET

1.終端輸入fsl後打開BET 輸入圖像位置,生成圖像位置,設置圖像密度閾值f(f值越小,切割大腦輪廓設定越大), 選擇bet執行算法,點擊Go運行   2.參數選擇(點擊Advanced options) -f <f> fractio

原创 MRI圖像轉格式

1.數據來源及格式 西門子/GE:DICOM  飛利浦: PAR/REC  根據主流儀器西門子和GE產生的數據格式,因此DICOM格式比較多,本文只作此介紹: 如圖示,原始類型DICOM以及轉格式後的3D,4D文件由頭文件和影像組成,其

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註冊網址 http://www.storkapp.me/?ref=14500 你有過不知如'z何及時獲知最新領域內最h新科研進展的困擾麼?Stork(文獻鳥)可以幫到你。 Stork(文獻鳥)是一款由斯坦福大學成員開發的免費的文獻追蹤的軟

原创 ICA與雙迴歸分析(Dual_Regression)

        簡單來講,雙迴歸分析是ICA的一個延伸分析,旨在將ICA的組成分結果映射回單個樣本中,從而計算其組差異。許多針對大腦的功能影像數據研究的文章採用過這種方法,在此不贅述。下面進入實現部分: 一. 軟件準備 1.Linu

原创 SurfStat Toolbox 使用說明

SurfStat軟件包畫圖使用說明          Nature最近有一篇研究嬰兒時期大腦體積,表面積對幼兒自閉症預測的研究:Early brain development in infants at high risk for a

原创 追蹤文獻好助手!stork文獻鳥使用介紹

註冊網址:http://www.storkapp.me/?ref=14500    作爲一隻科研狗,業界大牛的文章是我的好夥伴,不僅要掌握領域內的研究方向,還要及時追蹤研究課題的新發現。但每天在Pubme

原创 詳解MATLAB之freqz()函數

一 函數調用介紹MATLAB提供了專門用於求離散系統頻響特性的函數freqz(),調用freqz()的格式有以下幾種:(1)[H,w]=freqz(B,A,N);  %N默認值爲512(2)[H,w]=freqz(B,A,N,'whole

原创 FDR校正的程序實現及嚴格程度對比

FDR校正的程序實現及嚴格程度對比 前言         做統計分析就離不開P value<0.05,而寫過科研文章的人也都知道沒有經過FDR校正的P值就像一盤散沙,不用風吹,走兩步自個兒就散了。 那麼FDR校正這個讓人又愛又恨的東

原创 詳解MATLAB之MAX函數

一:MAX函數的幾種形式  (1)max(a)  (2)max(a,b)  (3)max(a,[],dim)  (4)[C,I]=max(a)  (5)[C,I]=max(a,[],dim)  二:舉例介紹用法(1)max(a) 若a爲