原创 「r<-工具」在 Hiplot 中使用 Sigflow
介紹 突變模式（印記）分析（mutational signature analysis）目前已經成爲變異檢測後一個重要分析流程，它能夠揭示癌症組織樣本受哪些內外界因素的影響以及其貢獻大小。 Sigflow 是基於突變模式分析 R 包 sig
2020-09-21 03:50:02
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原创 「r<-教程」R Docker 教程
原英文網址：http://ropenscilabs.github.io/r-docker-tutorial 這是專門爲具有 R 和 RStudio 知識的朋友設計的 Docker 教程。該介紹旨在幫助需要 Docker 進行項目的人們。我們
2020-08-27 15:09:58
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原创 「r<-包」使用 tinyscholar 展示個人谷歌學術檔案
谷歌學術是目前感覺最好的學術搜索引擎，谷歌學術檔案提供了學者的個人學術信息，不過通常情況我們無法查看和使用這個信息。Y 叔寫的 scholar 包雖然提供了齊全的功能，但由於網絡限制在國內基本無法使用。 如果我想要簡單地獲取和展示我的個人學
2020-08-17 15:14:51
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原创 「r<-配置」Rprofile：R 全局設置
與文章 【r<-安裝|方案】Windows R安裝與配置 相關。 存儲在 ~/.Rprofile 中的內容是一個 R 腳本，它會在 R 啓動時自動運行，所以可以作爲全局的配置使用。 根據我的 R 使用經驗，結合 Y 叔和 Yihui 提供的
2020-08-13 17:07:58
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原创 PicGo + Gitee 構建免費雲圖牀
PicGo 下載鏈接：https://github.com/Molunerfinn/PicGo/releases/ 開源開發不易，不妨對倉庫點個 Star，致謝下作者們。 根據自己的系統版本進行下載。 下載後傻瓜式安裝，完成後打開軟
2020-08-11 15:09:42
原创 「r<-教程」R Docker 教程（未完）
原英文網址：http://ropenscilabs.github.io/r-docker-tutorial 這是專門爲具有 R 和 RStudio 知識的朋友設計的 Docker 教程。該介紹旨在幫助需要 Docker 進行項目的人們。我們
2020-07-25 13:59:41
原创 「r」Obtain RNAseq Values for a Specific Gene in Xena Database
寫這篇文檔的原因是有使用者問我如何獲取單個基因的表達值，這個操作我其實在很久之前的生存分析示例文檔中介紹過，但用戶有所疑惑，說明我寫的不清楚或者無法找到，所以針對性就這類問題進行介紹。 Hi Shixiang, How can I use
2020-07-23 13:59:08
原创 「r<-工具」UCSCXenaShiny：基於 R 的 Xena 數據庫交互應用
一句話簡介：一個可以用於探索、下載和簡單分析 UCSC Xena data hubs 上所有數據集的 R Shiny 交互式應用。 項目地址：https://github.com/openbiox/UCSCXenaShiny 可以單獨作
2020-07-22 13:59:02
原创 使用 GitHub README profile 展示更多信息
近期，GitHub 上線了 GitHub README profile 的功能，於是我的首頁多了一些 GitHub 的代碼信息。 創建 README profile 非常簡單： 創建一個倉庫，倉庫的名字與你 GitHub 的 usern
2020-07-16 15:49:33
原创 將 origin 倉庫由 Gitee 改爲 GitHub
#!/usr/bin/env bash # Author: Shixiang Wang # LICENSE MIT@2020 echo "This program reset the origin repository from git
2020-07-16 15:49:33
原创 自動鏡像你的 GitHub 倉庫
GitHub 倉庫下載本來就慢，再加上偶爾來的宕機讓我有了些危機意識。 要是真的倉庫數據因爲宕機發生了數據丟失？ 要是 GitHub 全站被禁止訪問了？（本身 gists 和 raw.github 域名目前在國內是不可以訪問的） 做個
2020-07-14 15:19:48
原创 結合 sed 與 mv 批量修改文件名
使用 wget 下載數據後發現文件名全帶了鏈接的 query 符號： $ ls download?fn=%2FPCAWG%2Fclinical_and_histology%2Fpcawg_donor_clinical_August2016_
2020-07-13 13:58:19
原创 Lisp: MacOS Common Lisp 安裝與環境配置
使用 Lisp 的目的並不是想要掌握一門新的語言，也不是爲了學習 Emacs，純粹是一些經典計算機圖書涉及的介紹都使用的 Lisp，它是一門非常好用於研究編程語言的語言，學習的目的是想更多瞭解一些關於計算機、編程的根本原理和問題。 本文介紹
2020-07-13 13:58:19
原创 「r<-統計分析」層次聚類與非層次聚類 層次聚類 (HC) 2- 聚類方法選擇 非層次聚類 (NHC)
原文鏈接：https://www.rpubs.com/dvallslanaquera/clustering 層次聚類 (HC) 在這個分析中，我們將看到如何創建層次聚類模型。目的是探索數據庫中是否存在相似性組，並查看它們的行爲。 例如，我們
2020-07-04 15:55:48
原创 「r<-workshop」第六期：R 包開發
【點擊查看小抄】 這裏彙總的信息和視頻解讀推薦每個想要進階和學習 R 包開發的讀者看一看，是我兩年開發經驗的一個總結。R 包的開發目前是前所未有的簡單，但大部分 R 用戶不瞭解，無從下手，希望這篇文章可以爲大家減少一些攔路虎（下方有二維碼可
2020-06-28 20:27:19