原创 【r<-包|元分析】誰更能從治療中獲益？
metawho是一個非常簡單的R包，實現了deft 元分析方法（見後面參考文獻），相比於之前的元分析方法，deft方法先在研究內進行比較，然後再評估所有研究結論的一致性。該方法被我用於19年發表的文章（見參考文獻）中，不過當時我是基於met
2019-05-16 17:18:41
原创 「golang」Linux echo命令3種實現
1: // Copyright © 2016 Alan A. A. Donovan & Brian W. Kernighan. // License: https://creativecommons.org/licenses/by-nc-s
2019-05-15 17:31:40
原创 【r<-方案】數據框ID拆分
一個樣例數據： > df gene_id gene_symbol gene_class 1 ENSG00000000003.9 TSPAN6 coding 2 ENSG00000000003.
2019-05-12 17:12:50
原创 【r<-數據庫】使用RMySQL簡單操作mysql數據庫
使用 MySQL 數據庫創建一個用於存儲用戶信息的數據表：包含 username, email, password 三個字段，並分別使用 SQL 和 Python/R 客戶端插入、刪除和更新一行數據，密碼使用 SHA256 進行加密 lib
2019-05-12 17:12:50
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原创 【r<-方案】解決繪圖設備輸出空白頁的問題
在調用R設備繪pdf圖時，經常會遇到輸出的第一頁是空白頁，使用onefile=FALSE可以解決該問題。 即： pdf("test.pdf", onefile=FALSE) # 此處繪圖 dev.off() 參考：https://stac
2019-05-07 17:28:21
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原创 【r<-安裝】CentOS從源安裝R3.6
首先切入root賬戶。 安裝R編譯依賴 yum-builddep R 消滅界面configure警告：configure: WARNING: neither inconsolata.sty nor zi4.sty found: PDF v
2019-05-01 01:03:56
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原创 下載GDC hub所有counts數據
使用dplyr篩選，使用UCSCXenaTools下載，就下面幾行代碼~ 想下載其他數據再下面的基礎上改動即可。 library(dplyr) library(UCSCXenaTools) XenaData %>% filter
2019-05-01 01:03:54
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原创 下載dbGap數據
第一次下載，記錄一下。歡迎小夥伴提提建議，有什麼更好更快的下載方式和操作 https://mubu.com/doc/g1l1fROB70
2019-05-01 01:03:54
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原创 【r<-開發】Bioconductor包開發（一）：開發環境準備
選擇R版本 當Bioconductor devel（開發）分支成爲Bioconductor release（發佈）分支時，包作者應針對用戶可用的R版本進行開發。 R每年（通常是4月中旬）在x.y.z版本號中發佈'.y'版本，但Biocond
2019-04-23 17:55:11
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原创 【r<-方案】在MacOS上更新R版本
R現在到3.6版本了，我已經遠遠的out of date，下面可以簡單地解決在MacOS上更新R版本。 install.packages('devtools') #assuming it is not already installed l
2019-04-23 17:55:11
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原创 【r<-開發】Bioconductor包開發（二）：開發指南
https://www.bioconductor.org/developers/package-guidelines/ 介紹 Bioconductor項目推廣高質量，文檔齊全，可互操作的軟件。 本文的指導方針有助於實現這一目標; 它們並不意
2019-04-23 17:55:10
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原创 2019-04-15 理解web開發
如果要學習Web開發，首先要對HTML、CSS和JavaScript作一定的瞭解。HTML定義了頁面的內容，CSS來控制頁面元素的樣式，而JavaScript負責頁面的交互邏輯。
2019-04-16 18:19:47
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原创 【r<-方案|分享】魔性的ggplot2，多個圖例時順序會變？
今天嘗試解決使用ggplot2畫圖時的一個問題，圖例不按規矩出牌。 ggplot2的作者們在測試時發現更新版本也出這問題了，正好可以用於簡單說明。 本來是一個這樣的圖形 新版本變成了 而我是畫兩個相似的圖形時出現這問題，數據結構一樣，然
2019-04-11 18:09:02
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原创 ipv4/6衝突引發的血案：CentOS7使用curl和wget反應都很慢原因及方案
這個問題折騰了一天。起因是想通過實驗室的CentOS服務器下載GEO數據庫數據集，發現一直下載不下來： > gse <- getGEO('GSE10') Error in open.connection(x, "rb") : Time
2019-04-10 18:10:57
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