原创 單細胞新藥研發導論|| 解鎖人體屏障
開刊詞||單細胞新藥研發導論 單細胞新藥研發導論|| 新藥研發管線 單細胞新藥研發導論|| 藥靶發現 將單細胞研究的基本思路與新藥研發的成熟管線結合起來。 藥物的發現、設計、開發和上市是一項極其複雜的科學和社會工程，在得到新化學實體之後
2021-05-09 07:53:30
原创 單細胞新藥研發導論|| 數據之美
將單細胞研究的基本思路與新藥研發的成熟管線結合起來。 製藥行業有着嚴格的監管和實驗審批機制，一直是數據科學深入應用的領域。所有的新藥上市之前，都要經過大量嚴格的臨牀前後試驗以及數據分析。基於有限的實驗數據進行建模和模擬，從藥物動力學、藥
2021-05-09 07:53:30
原创 Seurat Weekly NO.14 || 讀源碼解決實際問題
天子呼來不上船， 自稱臣是菜鳥團。 在這裏，和國際同行一起學習單細胞數據分析。 我今天並沒有敲滿100行代碼，以至於我在寫這篇文章的時候都有點不好意思了。要讀/寫長代碼的想法腦海裏輪迴了很久了，哪來的時間呢？寫吧。 我們爲什麼要學習長代
2021-05-09 07:53:20
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原创 單細胞新藥研發導論||耐藥無
將單細胞研究的基本思路與新藥研發的成熟管線結合起來。 早在1925年，細胞生物學研究的先行者E.B.Wilson便在他不朽的著作《細胞的發育與遺傳》中指出：每一個生物學問題的關鍵最終必然從細胞中去尋求。隨着大量的藥物被開發和服用，特別是
2021-05-09 07:53:20
原创 單細胞新藥研發導論|| 藥靶發現
開刊詞||單細胞新藥研發導論 單細胞新藥研發導論|| 新藥研發管線 將單細胞研究的基本思路與新藥研發的成熟管線結合起來。 人類開展藥物篩選的方法與科學技術的發展密不可分，先後經歷了活體評價（神農嘗百草）、器官/組織篩選，再到現代的分子靶
2021-05-09 07:53:20
原创 單細胞流程與新藥研發管線
開刊詞||單細胞新藥研發導論 將單細胞研究的基本思路與新藥研發的成熟管結合起來。 有明確的靶標 動物模型有效 無遺傳毒性 急慢性毒性實驗清晰可靠 優良的藥效動力學性質 容易製備、成本可行 無藥物相互作用 一般醫生都能使用，而非專科醫生
2021-04-26 04:26:08
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原创 Barcoding || 海量單細胞的關鍵技術
海量單細胞技術涉及到三大底層技術： 微流控技術 Barcode 技術 UMI技術 故事要從第一屆單細胞培訓班開始講起，還記得在講完第一場單細胞技術簡介及應用之後，問大家有沒有什麼問題可以討論。有位老師問：請問什麼叫Barcode？ 我們
2021-04-12 10:09:15
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原创 我們的研發是產品驅動還是市場驅動的？
當我們計劃推出一款新產品的時候，是以市場需求爲驅動力的，還是以產品部門的靈感爲驅動力的？對這個問題的回答，可以把研發策略分爲兩個大類： 產品驅動的環境包括企業首先開發產品，然後爲其尋找市場。基本上，它的運作是基於這樣一種假設：有了好產品，
2021-04-05 03:49:38
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原创 DENDRO:利用scRNA seq進行基因異質性分析和亞克隆檢測
儘管現在scRNA-seq廣泛應用於腫瘤內異質性的研究中，體細胞突變的檢測和從scRNA-seq推斷克隆成信息可能並不準確。這裏，我們提出了DENDRO，這是一種分析scRNA-seq數據的方法，它將單個細胞聚集成遺傳上不同的亞克隆，並重建
2021-03-27 19:28:16
原创 讀《高通量測序技術》
2003年4月人類基因組計劃完成，開啓了一個全新的時代：後基因組時代。也許要過更久的時間，人類才能完全明白這意味着什麼，至少到20年後的今天，科普工作依然在努力地進行。在高通量測序技術（NGS）已經應用於生命科學的方方面面的今天，依然有人在
2021-03-27 19:28:06
原创 開刊詞||單細胞新藥研發導論
人，是萬物的尺度。 自生命科學誕生之日起，就開始支撐生物醫藥的孵育和發展，而生物醫藥也是生命科學的最終出口。海量單細胞技術自2009年發軔以來，使得我們在單細胞水平上解析多細胞生物規律。先是在發育領域，帶給我們應接不暇的發現，如胚胎細胞的轉
2021-03-27 19:28:06
原创 Seurat Weekly NO.12 ||205頁的教程
天子呼來不上船， 自稱臣是菜鳥團。 在這裏，和國際同行一起學習單細胞數據分析。 Seurat V4 的教程頁面做了全面的改進，用pkgdown構建了新的教程體系： 可以說是從其開發團隊獨立出來了，但是他們依然十分熱心地在Github上
2021-03-27 19:28:06
原创 Seurat Weekly NO.13 || 依賴關係與維護
天子呼來不上船， 自稱臣是菜鳥團。 在這裏，和國際同行一起學習單細胞數據分析。 最近在R4上安裝Seurat V4 的時候，有可能會遇到這樣的報錯： Error: package or namespace load failed for
2021-03-27 19:28:06
原创 Seurat Weekly NO.11 ||預告2021 Single Cell Genomics Day
在這裏，和國際同行一起學習單細胞數據分析。 還記得2019年上的第一門比較完整和前沿的課程是Suerat團隊的Single Cell Genomics Day，當時的議題有： Introduction to Deep Learning
2021-03-27 19:28:06
原创 出藥谷記||之上海
走馬揚鞭翻山過河，趕他個天時地利與人和。 1896年，時任兩江總督署理南洋大臣張之洞奏請修建經吳淞至江寧府（今南京）的鐵路線。先期修建淞滬鐵路，於1897年動工，次年完成。到1908年，伴隨着滬寧鐵路全線通車，原上海站正式投用。如今的上
2021-03-27 19:28:06