原创 Regulatory elements within the noncoding gene regions
原文：Regulation of eukaryotic gene expression by the untranslated gene regions and other non-coding elements Regulatory
2020-06-14 10:47:31
原创 以慢爲快：跑步 1 關於每天跑步 2 關於每天早起 後記
帶着寬寬堅持跑步40多天了，每個周最多休息一天，而這一天基本是因爲有過其他運動，比如帶他打過羽毛球等。今天下午閒下來，覺得很有必要記錄一下。 初衷 堅持跑步 堅持跑步，堅持早起，還有堅持嚴格ADF飲食是很不容易的事情，都很考驗毅力和自我控
2020-06-14 10:47:31
原创 溶酶體和線粒體共存的所思所得
幾年前，基於蛋白組數據，苦思冥想後提出一個可能的理論： 溶酶體和線粒體可以融合共存。也就是內體溶酶體和自噬體融合後，並未發生傳統的線粒體完全被消化，而是像十幾億年前的原真核細胞吞噬原線粒體一樣，線粒體內膜與溶酶體外膜共存，這無論從能量和節約
2020-06-14 10:47:31
原创 R中paste cat和sink的用法 1 paste的用法 製表符分割 2 cat用法:輸出結果（直接輸出或寫入文件） 注意以下兩個命令的區別 3 sink的用法
1 paste的用法 paste(..., sep=" ", collapse=NULL) 本質是把輸入的term轉變爲string，和as.character意思一樣。然後進行連接。 每個term之間以sep參數分隔開 colla
2020-06-14 10:47:31
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原创 unable to find an inherited method for function ‘select’ for signature ‘"data.frame"’報錯及處理辦法
今天用select函數出現報錯，一開始沒注意報錯信息，因爲我選擇的列名有些複雜，怕是哪裏掉了個空格，就重新換了個方法選列名，還是出錯。 報錯信息如下 > b <- select(a,X.Pathway, Pathway.ID, Genes)
2020-06-14 10:47:31
原创 8 GATK完整流程
總目錄:三陰性乳腺癌全外顯子分析(wes) 建議讀或觀看以下內容 1 深入瞭解snp-calling流程 2 Cloud Computing for Next-Generation Sequencing Data Analysis 3
2019-07-09 21:32:26
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原创 把gitbook發佈在github
前提 1 假如你已經擁有了github賬戶，並定向到你自己的域名（沒有也可以）。 2 電腦（linux，mac，windows都可以）安裝了git，github。 3 已經在本地利用gitbook做好了相應的文件生成靜態文件，假如都放在了
2019-07-08 22:50:20
原创 npm ERR! Unexpected end of JSON input while parsing near '...dBhd3Fu9c9Q5FDXB7FlHN'
解決辦法 npm cache clean --force
2019-07-05 22:29:18
原创 通過簡單數據熟悉Linux下生物信息學各種操作4
原地址 幾點說明 1.非簡單翻譯，所有代碼均可運行，爲了輔助理解，基本每步代碼都有結果，需要比較的進行了整合 2.原文中的軟件都下載最新版本 3.原文中有少量代碼是錯誤的，這裏進行了修正 4.對於需要的一些知識背景，在這裏進行了註釋或鏈接到
2019-07-03 21:14:14
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原创 通過簡單數據熟悉Linux下生物信息學各種操作3
原地址 一共三部分 通過簡單數據熟悉Linux下生物信息學各種操作1 通過簡單數據熟悉Linux下生物信息學各種操作2 通過簡單數據熟悉Linux下生物信息學各種操作3 15awk的簡單使用 15.1提取Ebola的coding feat
2019-07-01 21:55:52
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原创 通過簡單數據熟悉Linux下生物信息學各種操作2
原地址 一共三部分 通過簡單數據熟悉Linux下生物信息學各種操作1 通過簡單數據熟悉Linux下生物信息學各種操作2 通過簡單數據熟悉Linux下生物信息學各種操作3 11安裝使用bwa（mac） 11.1安裝編譯並創建到bin目錄的鏈
2019-07-01 21:55:52
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原创 如何從舒適區到學習區
舒適區，學習區和恐慌區原作者中分別是comfort zone, learning zone和panic zone。 每個人的分區也不一樣 1關於三個區 1.1 the comfort zone 這是大部分人所在的區域（據統計大概80%
2019-06-30 21:26:17
原创 snp calling 幾張圖
Graphical representation of allelic heterogeneity at a locus with common and low frequency/rare variant associatio
2019-06-28 22:44:30
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原创 通過簡單數據熟悉Linux下生物信息學各種操作
原地址 1下載酵母基因組gff格式文件 wget ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/all/GCF/000/146/045/GCF_000146045.2_R64/GCF_000146045.2_R64_
2019-06-23 19:43:38
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