原创 基因組選擇軟件市場調研

前言 目前, 基因組選擇進入了一個高速發展的階段, 各種新的算法和模型被提出, 這裏對基因組選擇的軟件進行一個彙總 大綱 1, 調查背景及目的 2, 調查方法介紹 3, 主要軟件彙總 4, 基因組軟件介紹:單機版 5, 基因組軟件介

2019-04-03 23:29:45

原创 R 語言載入包時不顯示包的信息

背景 編寫R腳本時, 載入包時顯示軟件包的信息, 這些信息不想打印出來, 下面是實現方法. 包的信息類似: ── Attaching packages ─────────────────────────────────────── t

2019-04-02 23:23:32

原创 snakemake 學習筆記3

目標 這次, 我要實現這個路程圖. 目標介紹 第一: 生成1.txt , 2.txt, 3.txt 第二: 向每個文件中加入"add a"字符, 命名爲:1_add_a.txt, 2_add_a.txt, 3_add_a.txt

2019-04-02 23:23:22 6

原创 R語言加快運算的幾種方法

背景 提升R代碼運行速度並不需要很高級的優化技術, 例如代碼並行化, 使用數據庫, 使用c++等. 實際上, 通過簡單的操作, 就能夠是R的運算速度顯著的加快, 下面介紹幾種方法. 1, 向量化 R語言允許用戶進行向量化編程, 這樣速

2019-04-02 23:23:22 48

原创 如何優雅的使用markdown寫博客--微博圖牀使用說明

一: 我的理想 我一直有一個理想, 寫博客就舒心的去寫, 然後能夠在知乎, 簡書, csdn, 科學網上任意複製, 這是多麼快意的人生. Markdown的出現, 滿足了我90%的需求, 一個痛點就是圖片的問題, 畢竟花40分鐘寫文章

2019-04-02 23:23:22

原创 從讀書到別人思想的跑馬場

高中時, 酷愛讀書, 蒐集各種名著看, 無心學習, 只想看書. 我的方法很簡單, 高中時, 有介紹語文各個知識的一本厚厚的書籍, 後面有世界名著和中國名著的大體介紹, 我就按照書單, 尋找相關書籍, 一本一本的看. 看了多少我也記不清

2019-03-29 23:34:24

原创 遺傳變異係數怎麼計算

今天有人問我遺傳變異係數怎麼計算, 我第一次聽說, 就搜索了一下, 然後找到了解決方案, 然後寫了一篇博客. 希望可以幫到後來人. 1. 參考文獻 參考文獻1: 結果報表 參考文獻2 結果報表 參考文獻3 結果報表 2.

2019-03-29 23:34:24 4

原创 育種4.0世代的到來個人應該準備什麼

PPT引用 今天看到王冰冰老師在"2019 年國家良種重大科研聯合攻關部署會議"中的報告《國際種業發展態勢》, 裏面闡述了育種4.0世代的到來， 深有感觸，下面是PPT內容，中間加了我的筆記。 鄧飛筆記： 王冰冰老師一直在相關行業，

2019-03-29 23:34:24 13

原创 Julia1.1安裝說明

1. 前言 之前, julia0.6, 然後julia0.7變了很多, 然後julia1.0又變化了很多, 經過了很多從開始到放棄的過程. 現在Julia1.1了, 從新開始學習. 雖然JuliaPro很方便, 但是需要註冊, 還要設

2019-03-20 23:31:55

原创 基因組選擇中構建H矩陣需要設置哪些參數?

基因組選擇中, H矩陣的構建比較關鍵, 下面介紹一下, 常用的設置H矩陣參數的方法. 1. 基因組選擇中H矩陣的構建 這裏的1爲非測序個體, 2爲測序個體, A11, A12, A21, A22, 可以由系譜構建的A矩陣, 提取相應

2019-03-20 23:31:55

原创 基因組選擇和SNP分析在ASREML-SA中的實現方法

編者自語: asreml是非常強大的軟件, 由於太強大, 很多人不會使用. 基因組選擇在育種中的應用, 其基礎是常規的系譜動物模型, 動物模型也可以很複雜, 看一下asreml的說明書就知道了, 有300多頁, 據我瞭解, 其厚度可以

2019-03-19 23:35:20

原创 上士聞道

道德經 上士聞道，勤而行之；中士聞道，若存若亡；下士聞道，大笑之。不笑不足以爲道。 孔子云: 朝聞道, 夕死可矣 這個道, 即是真理, 一旦遇到, 就要勤而行之, 這纔是上士應該有的態度. 陽明有言: 知行是一體的, 知而不

2019-03-13 21:52:40

原创 R語言中寫入xlsx的不同sheet表格

參考: R數據寫入Excel不同sheet 測試思路 模擬兩個數據框 新建一個list表 寫入excel中 代碼 aa<-data.frame(1:5,2:6) ab<-data.frame(2:60,13:71) aa ab

2019-03-12 20:56:09 67

原创 snakemake-學習筆記2

參考資料 一個稍微複雜的案例 這是另一個snakemake的案例, 之前介紹過通過簡單的方法, 使用snakemake, 這裏我們用另一個案例, 看看snakemake的用法. 過程介紹 1, 安裝snakemake 2, 新建文件

2019-03-12 20:56:09

原创 Centos 局域網訪問服務器 jupyter notebook 的設置方法

本篇教程，介紹如何設置服務器的Jupyter，並遠程登陸, 就像rstudio-server一樣的。 1, 安裝jupyter notebook 這裏推薦安裝Anaconda wget https://repo.anaconda.co

2019-03-07 13:53:57 7