原创 Linux - 正規表示法

正規表示法(Regular Expression,RE)是透過一些特殊字符的排列,用以[搜尋/取代/刪除]一列或多列文字字符串,簡單的說,正規表示法就是用在字符串的處理上面的一項“表達式”。如果想要以正規表示法的方式處理字符串,就要使用支持

原创 Day 2 轉錄組分析--需要學會的linux操作

Linux操作系統爲生物信息學的數據處理提供了很好的平臺,因此,掌握一些高效的Linux系統操作技巧能夠讓我們的工作更加便捷。“優秀”的操作習慣就如同一把強有力的工具,panda都一步一步得試着操作了一遍,這是吸取別人優秀操作的機會,一定不

原创 《調音師》:氾濫的貪婪和自私

第一次看《調音師》是法國的小視頻,主人公喬裝爲“盲人調音師”,享受着“盲人”身份帶給他的額外“福利” -- 小費更多了,人們對他更友善了,訂單量也增加了。更讓他洋洋得意的是,他們或她們戒備減少,可以看到日常生活中,人們不爲人知的一面。是的

原创 Linux 之 Bash -- 管線命令

聲明: 我覺得今天的這篇文章就像一篇“工具”文而且很雞肋:歸納一些常用的管線命令和應用參數。適合有操作需求時,來查找能夠幫忙解決問題的指令和參數~ 學習管線命令之前要先了解管道符|,因爲管線命令使用的是|這個界定符號,它和使用;的連續下

原创 Linux 之 Bash -- 數據流重導向

1.數據流重導向 數據流重導向就是將某個指令執行後應該要出現在屏幕上的數據,給他傳輸到其他的地方。(在Linux的文本模式底下很重要) 我們借鳥哥的圖理解一下 :STDIN(Standard input);STDOUT(Standard o

原创 在北京的第365天

今天有點小感慨,起因是朋友圈裏的一則動態:一個剛剛結婚不久的小姐姐從合租屋裏搬出來,換到了寬敞明亮的兩居室,配文“迎接你的到來❤️❤️”。很明顯,小姐姐馬上就要有自己的小寶貝啦。我還記得,2019年春節前,她剛剛升了職,加了薪,和一個看起來

原创 Linux 之 Bash -- Bash Shell 的操作環境

1.路徑與指令搜尋順序 當我們下達一個指令,計算機都是要在內部搜尋這個指令對應的操作,然後再執行的。假如一個指令可以對應很多種操作,那麼計算機該怎麼執行?如果不理解? 那就舉個栗子: 我們都知道系統裏面其實有很多ls 指令,假如我們曾經 a

原创 Day 2 熟練我們的Linux操作

遲到了,Day2拖延了那麼久... Linux操作系統爲生物信息學的數據處理提供了很好的平臺,因此,掌握一些高效的Linux系統操作技巧能夠讓我們的工作更加便捷。“優秀”的操作習慣就如同一把強有力的工具,panda都一步一步得試着操作了一遍

原创 Day 1 認識轉錄組測序

1.轉錄組測序是什麼? 遺傳信息儲存在細胞核DNA,不考慮體系突變的話,理論上講一個生命體的每個細胞內的DNA是完全一致的,正是因爲不同基因的選擇性表達才構成了各種各樣功能不同的組織和器官。看一下中心法則(實線爲主要途徑): 其中的RN

原创 Linux 之 Bash -- 命令別名與歷史命令

1.命令別名 alias 當你的慣用指令特別長的時候,可以通過alias進行簡化(alias顧名思義,就是給你的常用指令起個“綽號”)。 例如我們刪除文件都是用rm指令,萬一不小心手抖刪錯掉,就怕不好撤回,但是 rm -i指令則會在你刪除時

原创 《成爲 -- 米歇爾·奧巴馬自傳》 讀後感

在中信書店,不小心被這本書吸引了,圖書的封面是米歇爾·奧巴馬自信的笑容,放在拿破崙和羅斯福等人的傳記旁邊,隱約中我對這位第一夫人的認識只有她的總統夫人標籤和賢妻慈母形象。貼上總統夫人的標籤之前她經歷過什麼?她是如何和這位黑人丈夫相知相愛的?

原创 Linux 之 Bash -- shell 的變量功能(三)

1. 變量內容的刪除 一般來說,PATH變量都比較長,內容很多,因此變量內容刪除的理解拿它來講比較方便。 這裏的內容都是乾貨 注意格式 ${變量名+指示符號+要刪除的內容} ${}在這種刪除模式裏是必須存在的 指示符號有 #,##,%,%