原创 論文閱讀筆記:A Three-Stage Deep Learning Model for Accurate Retinal Vessel Segmentation

A Three-Stage Deep Learning Model for Accurate Retinal Vessel Segmentation 摘要 視網膜血管自動分割是眼相關疾病診斷的基礎步驟,其中厚血管和薄血管都是症狀檢

原创 Unet實現眼底圖像血管分割(四)

項目源代碼: configuration.txt #數據路徑 以及 訓練集 測試集的名字 [data paths] path_local = ./DRIVE_datasets_training_testing/ train_i

原创 對眼底圖像血管分割結果求Dice係數

首先將預測的圖片轉換爲二值圖如下:to_binary.py import cv2 import os import numpy as np if __name__ == '__main__': path = 'xxx

原创 論文閱讀筆記:A novel retinal vessel detection approach based on multiple deep convolution neural networks

一種新穎的基於多重深度卷積神經網絡的視網膜血管檢測方法 關鍵詞:視網膜血管分割、多重深卷積神經網絡、圖像分割 摘要 方法:在本文中,我們將檢測任務作爲一個分類問題,並使用基於深度卷積神經網絡的多分類器框架來解決它。 在具有有限圖像

原创 簡明代碼實現Unet眼底圖像血管分割

項目工程文件結構如下: 參考了Retina_Unet項目,決定自己用代碼來實現一遍,數據增強不是像Retina_Unet那樣隨機裁剪,而是將20個訓練數據集按順序裁剪,每張裁剪成48x48大小的144個patch,20張一共裁剪

原创 論文閱讀筆記:LADDERNET: MULTI-PATH NETWORKS BASED ON U-NET FOR MEDICAL IMAGE SEGMENTATION

LadderNet 摘要 U-Net已經在許多醫學圖像分割問題上提供了最先進的性能。對U-Net提出了許多修改,如attention U-Net、residual convolutional U-Net (R2-UNet)和帶有剩

原创 Unet實現眼底圖像血管分割(三)

1、retinaNN_training.py 模型Model的compile方法: model.compile(self, optimizer, loss, metrics=None, loss_weights=None, s

原创 Unet實現細胞分割

目的:實現細胞分割 數據集:isbi挑戰賽的數據,只有30張512x512的image和label 思路: 讀取數據,將數據轉換成 30x512x512x1格式; 由於數據太少,所以進行數據增強;(注意:對訓練數據進行增強的時候

原创 Dense-Unet實現眼底圖像血管分割(VesselNet)

之前用Retina Unet項目實現了眼底圖像血管分割,分割網絡用的是Unet,現在看了DenseNet之後,將之前Unet網絡中的Conv2d替換成下圖的Dense Block之後,效果會有提升。 在DRIVE數據集上的AUC

原创 R2Unet實現眼底圖像血管分割

論文標題:Recurrent Residual Convolutional Neural Network based on U-Net (R2U-Net) for Medical Image Segmentation R2Unet

原创 TensorFlow手寫數字識別(一)

數據集下載鏈接 數據集下載好之後解壓,得到4個壓縮包,在工作文件夾中新建文件:MNIST_data,將上面得到的4個壓縮包直接放在MNIST_data文件夾中即可。 數據集安裝和導入代碼如下(input_data.py): "

原创 論文閱讀筆記:CcNet: A cross-connected convolutional network for segmenting retinal vessels using 多尺度特徵

論文鏈接:CcNet: A cross-connected convolutional network for segmenting retinal vessels using multi-scale features CcNet

原创 Unet實現眼底圖像血管分割(二)

使用了google colaboratory的免費GPU進行訓練,調整了源代碼的各個參數,下面是configuration.txt文件的解析: [data paths] 只有在修改了prepare_datasets_DRIVE.p

原创 Unet實現眼底圖像血管分割(一)

參考鏈接 上面參考鏈接的博主講的很好了,我這裏主要是記錄一下自己復現的過程以及處理各種報錯的問題。 在Rrtina-Unet-master文件夾下新建一個test文件夾(源代碼沒有這個test文件夾會報錯) 將lib文件夾下的三

原创 論文閱讀筆記:Retinal vessel segmentation based on Fully Convolutional Neural Networks

基於全卷積神經網絡的視網膜血管分割 關鍵詞:全卷積神經網絡、平穩小波變換、視網膜眼底圖像、血管分割、深度學習 摘要 本文提出了一種新的方法,將平穩小波變換提供的多尺度分析與多尺度全卷積神經網絡相結合,來處理視網膜血管結構的寬度和方