原创 Gromacs——蛋白質-配體複合物教程

1.準備 從RCSB網站下載T4溶菌酶pdb文件(代號3HTB),刪除水。或下載已經準備好的pdb文件。 所用的配體爲JZ4,即2-丙基苯酚,但它不能被Gromacs提供的力場識別,所以將分成兩步準備拓撲文件: a.用pdb2gmx準備蛋

原创 Gromacs——水中的溶菌酶教程翻譯

目錄   1.準備pdb文件 2.生成拓撲文件 3.定義盒子並填充溶劑 4.添加離子 5.能量最小化 6.平衡 7.成品模擬  8.分析 1.準備pdb文件 從蛋白質數據庫下載pdb文件1aki.pdb,刪除pdb文件中的水(pdb文件中

原创 Gromacs——泛素結合酶教程翻譯

目錄 1.準備 2.生成拓撲文件 3.真空能量最小化 4.建立盒子(週期邊界條件) 5.添加溶劑 6.添加離子中和電荷 7.溶劑化系統的能量最小化 8.溶劑和H原子位置的馳豫:位置限制性MD 9.無約束MD模擬:使用溫度耦合 10:無約束

原创 Gromacs——溶菌酶教程翻譯

命令基於gromacs4.6, 5以後的版本在命令前加上gmx。 1.從蛋白質數據庫(http://www.pdb.org)獲取pdb文件(Lysozyme, 1LYD.pdb); 2.生成拓撲文件: pdb2gmx -f 1LYD.pd

原创 Excel VBA:調整指定區域的大小——Range.Resize 屬性

Range.Resize 屬性 調整指定區域的大小。返回 Range 對象,該對象代表調整後的區域。 語法 表達式.Resize(RowSize, ColumnSize) 表達式   一個返回 Range 對象的表達式。 參數 名稱 必選

原创 VBA計算字符串長度——Len函數

Len 函數 返回 Long,其中包含字符串內字符的數目,或是存儲一變量所需的字節數。 語法 Len(string | varname) Len 函數的語法有下面這些部分: 部分 說明 string 任何有效的字符串表達式。如果 stri

原创 VBA基礎語法:變量

目錄 聲明變量 Visual Basic 的命名規則 使用 Public 語句 使用 Private 語句 使用 Static 語句 使用 Option Explicit 語句 爲自動化聲明一個對象變量 寫賦值語句 聲明常數 聲明變量 通

原创 VBA FAQ:運行錯誤9,數組下標越界的解決辦法

將數組聲明爲動態數組,使用時重新定義即可: dim dataArray() …… redim dataArray(0 to 2) ……   ref:http://www.ittribalwo.com/article/1507.html

原创 VBA設置字符串格式——Format 函數

Format 函數 返回 Variant (String),其中含有一個表達式,它是根據格式表達式中的指令來格式化的。 語法 Format(expression[, format[, firstdayofweek[, firstweeko

原创 VBA基礎函數:字符串處理關鍵字總結

字符串處理關鍵字總結 作用 關鍵字 比較兩個字符串。 StrComp 變換字符串。 StrConv 大小寫變換。 Format, LCase, UCase 建立重複字符的字符串。 Space, String 計算字符串長度。 Len 設置

原创 VBA:MsgBox函數

MsgBox 函數 在對話框中顯示消息,等待用戶單擊按鈕,並返回一個 Integer 告訴用戶單擊哪一個按鈕。 語法 MsgBox(prompt[, buttons] [, title] [, helpfile, context]) Ms

原创 Excel VBA:設置單元格邊框

Border 對象 代表對象的邊框。 說明 大多數具有邊框的對象(除 Range 和 Style 對象外)都將邊框作爲單一實體處理,而不管邊框有幾個邊。整個邊框必須作爲一個整體單位返回。例如,使用 TrendLine 對象的 Border

原创 VBA基礎語法:數據類型

Boolean 數據類型 Boolean 變量存儲爲 16 位(2 個字節)的數值形式,但只能是 True 或是 False。Boolean 變量的值顯示爲 True 或 False(在使用 Print 的時候),或者 #TRUE# 或

原创 VBA:處理字符串的各種函數

目錄 InStr 函數 InStr 函數示例 Left 函數 Left 函數示例 LTrim、RTrim與 Trim 函數 LTrim,RTrim,及 Trim 函數示例 Mid 函數 Mid 函數示例 Right 函數 Right 函

原创 Excel VBA:設置行高與列寬

Range.RowHeight 屬性 以磅 (磅:指打印的字符的高度的度量單位。1 磅等於 1/72 英寸,或大約等於 1 釐米的 1/28。)爲單位返回或設置指定區域中所有行的行高。如果指定區域中的各行的行高不等,則返回 null。Va