原创 跟着Nature Communications學作圖:R語言circlize包做漂亮的弦圖

論文 A latitudinal gradient of deep-sea invasions for marine fishes https://www.nature.com/articles/s41467-023-36501-4 s

原创 跟着Nature Metabolism學作圖:R語言ggplot2一次性展示很多個餅圖

論文 Single-cell profiling of vascular endothelial cells reveals progressive organ-specific vulnerabilities during obesit

原创 跟着Nature Metabolism學作圖:R語言ggplot2各種各樣柱形圖(1)

論文 Single-cell profiling of vascular endothelial cells reveals progressive organ-specific vulnerabilities during obesit

原创 答讀者問:R語言批量做一元線性迴歸的簡單小例子

有人在公衆號的後臺留言問到 他的數據如下, 第一列是自變量,後面每一列是因變量,先算每一列和第一列的迴歸係數,有很多個這樣的文件,如果用R語言批量來做怎們實現 想了一下,應該還挺有用的,我寫了一個循環函數 batch_lm<-functi

原创 跟着Nature Metabolism學作圖:R語言ggplot2分組折線圖添加誤差線

論文 Single-cell profiling of vascular endothelial cells reveals progressive organ-specific vulnerabilities during obesit

原创 跟着Nature Metabolism學作圖:R語言ggplot2水平堆積柱形圖並添加同組連線

論文 Single-cell profiling of vascular endothelial cells reveals progressive organ-specific vulnerabilities during obesit

原创 跟着Nature Metabolism學作圖:R語言ggplot2熱圖組合樹圖和雙層分組標記

論文 Single-cell profiling of vascular endothelial cells reveals progressive organ-specific vulnerabilities during obesit

原创 EDTA註釋重複序列之安裝篇

github主頁 https://github.com/oushujun/EDTA 按照主頁的幫助文檔 我用conda安裝 conda env create -f EDTA.yml 可能是網絡的問題 一直沒有成功 用網絡稍微好一點的服務器

原创 orthofinder鑑定物種間的同源蛋白

github主頁 https://github.com/davidemms/OrthoFinder 我直接使用conda安裝 conda install orthofinder 運行命令 orthofinder -f test_data/

原创 如何快速瞭解自己研究物種的同屬或者同科都有哪些物種做了基因組測序?

如何快速瞭解自己研究物種的同屬或者同科都有哪些物種做了基因組測序? 今天遇到了這個問題,首先想到NCBI數據庫有專門的地方存儲都有哪些物種做了基因組測序 打開NCBI首頁直接點擊Genome 然後點擊Browse by genome

原创 關於R語言做數據可視化的介紹

在twitter上發現的 github 鏈接 https://github.com/tashapiro/anything-is-plotsible ppt https://tashapiro.github.io/anything-is-pl

原创 跟着Nature Metabolism學作圖:R語言ggplot2熱圖和添加分組標記

論文 Single-cell profiling of vascular endothelial cells reveals progressive organ-specific vulnerabilities during obesit

原创 跟着Nature Metabolism學作圖:R語言ggplot2柱形圖和下三角熱圖完整示例

論文 Single-cell profiling of vascular endothelial cells reveals progressive organ-specific vulnerabilities during obesit

原创 安裝基因組註釋流程braker2

github鏈接 https://github.com/Gaius-Augustus/BRAKER 參考鏈接 https://www.jianshu.com/p/e6a5e1f85dda github主頁上的安裝流程看着還挺麻煩的 參考鏈接

原创 手動安裝mummer4遇到的報錯

運行如下命令 ./configure --prefix=/home/myan/biotools/mummer-4.0.0beta 報錯信息 error: Compiler does not support std::this_thread