原创 跟着Nature學作圖:R語言ggplot2分組折線圖完整示例(Extended Fig2)

論文 A saturated map of common genetic variants associated with human height https://www.nature.com/articles/s41586-022-

原创 跟着Nature Biotechnology學作圖:R語言ComplexHeatmap包做熱圖展示TCGA-BRCA數據集概況

論文 Removing unwanted variation from large-scale RNA sequencing data with PRPS https://www.nature.com/articles/s41587-0

原创 數據可視化一些注意事項

鏈接 https://github.com/cxli233/FriendsDontLetFriends 這個好有意思,題目是 Friends Don't Let Friends Make Bad Graphs

原创 R語言if條件判斷的一個小例子

我之前一直以爲R語言的if判斷語句必須和大口號一起寫,如下 for (i in 1:10){ if (i>5){ print(i) } else { print("A") } } 原來不用大括

原创 可以查期刊信息的一個網站

https://academic-accelerator.com/

原创 一個比較好看的r markdown模板

來自於論文 Removing unwanted variation from large-scale RNA sequencing data with PRPS 論文裏提供了很多的數據和代碼 鏈接是 GitHub - RMolania/TC

原创 自動註釋MYB基因家族成員

https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-022-08452-5

原创 生命科學相關專業入門R語言的參考資料推薦

參考資料鏈接 https://github.com/sib-swiss/first-steps-with-R-training 這個github主頁還有好多生物信息學相關的內容 這個是一個關於生命科學領域的2天R語言入門內容,視頻內容我沒有

原创 按照實際比例畫韋恩圖的R包~eulerr 接下來是調節細節

R語言裏畫韋恩圖長用到的R包有 Venndiagram ggvenn ggVennDiagram 這幾個包有一個缺點就是最終呈現的圖不是按照數據集的實際比例來的。每個部分的圓或者橢圓大小都一樣。如果想要按照數據集的實際比例來,之前我嘗試

原创 推薦一個有意思的R語言作圖配色包

對應的github主頁是 https://github.com/BlakeRMills/MetBrewer/tree/main 歡迎大家關注我的公衆號 小明的數據分析筆記本 小明的數據分析筆記本 公衆號 主要分享:1、R語言和pyt

原创 跟着JoVE學作圖:R語言ggplot2做簇狀柱形圖並添加顯著性標記的完整示例

昨天的推文發出後,好多人留言問如何添加顯著性標記,今天的推文介紹下如何在簇狀柱形圖的基礎上添加顯著性標記 添加顯著性標記用到的是ggsignif包中的geom_signif()函數 在昨天推文的基礎上,如果是利用帶重複的原始數據作圖,然

原创 跟着Molecular Systems Biology學作圖:R語言ggplot2多圖拼接工具patchwork

論文 A genome-scale TF-DNA interaction network of transcriptional regulation of Arabidopsis primary and specialized metab

原创 R語言ggplot2做簇狀柱形圖並添加誤差線的一個完整示例

本文是回到B站關注者的提問,他的問題如下 原始數據存儲在一個excel文件裏,這個excel文件裏有三個子表格,每一個子表格的數據如下: 總的數據格式 現在的需要是做如下的圖 接下來就介紹如何利用原始數據到最終的圖的ggplot2的

原创 數據可視化有意思的小例子:使用R語言探索下庫裏常規賽的數據

數據集來自於kaggle https://www.kaggle.com/mujinjo/stephen-curry-stats-20092021-in-nba 數據集裏收集了NBA勇士隊當家球星庫裏09-21賽季常規賽的數據,總共是761場

原创 R語言ggplot2做漂亮的抖動散點圖的一個實例

在網上偶然間發現的一個R語言ggplot2做數據可視化的實例,提供數據和代碼,今天的推文把代碼拆解一下 實例數據下載鏈接 https://www.kaggle.com/berkeleyearth/climate-change-earth-s