數據庫索引數據結構

索引的本質

MySQL官方對索引的定義爲:索引(Index)是幫助MySQL高效獲取數據的數據結構。提取句子主幹,就可以得到索引的本質:索引是數據結構。

我們知道,數據庫查詢是數據庫的最主要功能之一。我們都希望查詢數據的速度能儘可能的快,因此數據庫系統的設計者會從查詢算法的角度進行優化。最基本的查詢算法當然是順序查找(linear search),這種複雜度爲O(n)的算法在數據量很大時顯然是糟糕的,好在計算機科學的發展提供了很多更優秀的查找算法,例如二分查找(binary search)、二叉樹查找(binary tree search)等。如果稍微分析一下會發現,每種查找算法都只能應用於特定的數據結構之上,例如二分查找要求被檢索數據有序,而二叉樹查找只能應用於二叉查找樹上,但是數據本身的組織結構不可能完全滿足各種數據結構(例如,理論上不可能同時將兩列都按順序進行組織),所以,在數據之外,數據庫系統還維護着滿足特定查找算法的數據結構,這些數據結構以某種方式引用(指向)數據,這樣就可以在這些數據結構上實現高級查找算法。這種數據結構,就是索引。

看一個例子:

這裏寫圖片描述

B-Tree和B+Tree

目前大部分數據庫系統及文件系統都採用B-Tree或其變種B+Tree作爲索引結構,在本文的下一節會結合存儲器原理及計算機存取原理討論爲什麼B-Tree和B+Tree在被如此廣泛用於索引,這一節先單純從數據結構角度描述它們。

B-Tree

爲了描述B-Tree,首先定義一條數據記錄爲一個二元組[key, data],key爲記錄的鍵值,對於不同數據記錄,key是互不相同的;data爲數據記錄除key外的數據。那麼B-Tree是滿足下列條件的數據結構:

d爲大於1的一個正整數,稱爲B-Tree的度。

h爲一個正整數,稱爲B-Tree的高度。

每個非葉子節點由n-1個key和n個指針組成,其中d<=n<=2d。

每個葉子節點最少包含一個key和兩個指針,最多包含2d-1個key和2d個指針,葉節點的指針均爲null 。

所有葉節點具有相同的深度,等於樹高h。

key和指針互相間隔,節點兩端是指針。

一個節點中的key從左到右非遞減排列。

所有節點組成樹結構。

每個指針要麼爲null,要麼指向另外一個節點。

如果某個指針在節點node最左邊且不爲null,則其指向節點的所有key小於v(key1)v(key1),其中v(key1)v(key1)爲node的第一個key的值。

如果某個指針在節點node最右邊且不爲null,則其指向節點的所有key大於v(keym)v(keym),其中v(keym)v(keym)爲node的最後一個key的值。

如果某個指針在節點node的左右相鄰key分別是keyikeyi和keyi+1keyi+1且不爲null,則其指向節點的所有key小於v(keyi+1)v(keyi+1)且大於v(keyi)v(keyi)。

圖2是一個d=2的B-Tree示意圖。

這裏寫圖片描述

由於B-Tree的特性,在B-Tree中按key檢索數據的算法非常直觀:首先從根節點進行二分查找,如果找到則返回對應節點的data,否則對相應區間的指針指向的節點遞歸進行查找,直到找到節點或找到null指針,前者查找成功,後者查找失敗。B-Tree上查找算法的僞代碼如下:

BTree_Search(node, key) {
    if(node == null) return null;
    foreach(node.key)
    {
        if(node.key[i] == key) return node.data[i];
            if(node.key[i] > key) return BTree_Search(point[i]->node);
    }
    return BTree_Search(point[i+1]->node);
}
data = BTree_Search(root, my_key);

關於B-Tree有一系列有趣的性質,例如一個度爲d的B-Tree,設其索引N個key,則其樹高h的上限爲logd((N+1)/2)logd((N+1)/2),檢索一個key,其查找節點個數的漸進複雜度爲O(logdN)O(logdN)。從這點可以看出,B-Tree是一個非常有效率的索引數據結構。
另外,由於插入刪除新的數據記錄會破壞B-Tree的性質,因此在插入刪除時,需要對樹進行一個分裂、合併、轉移等操作以保持B-Tree性質,本文不打算完整討論B-Tree這些內容,因爲已經有許多資料詳細說明了B-Tree的數學性質及插入刪除算法,有興趣的朋友可以在本文末的參考文獻一欄找到相應的資料進行閱讀。

B+Tree

B-Tree有許多變種,其中最常見的是B+Tree,例如MySQL就普遍使用B+Tree實現其索引結構。

與B-Tree相比,B+Tree有以下不同點:

每個節點的指針上限爲2d而不是2d+1。

內節點不存儲data,只存儲key;葉子節點不存儲指針。

圖3是一個簡單的B+Tree示意。

這裏寫圖片描述

由於並不是所有節點都具有相同的域,因此B+Tree中葉節點和內節點一般大小不同。這點與B-Tree不同,雖然B-Tree中不同節點存放的key和指針可能數量不一致,但是每個節點的域和上限是一致的,所以在實現中B-Tree往往對每個節點申請同等大小的空間。

一般來說,B+Tree比B-Tree更適合實現外存儲索引結構,具體原因與外存儲器原理及計算機存取原理有關,將在下面討論。

帶有順序訪問指針的B+Tree

一般在數據庫系統或文件系統中使用的B+Tree結構都在經典B+Tree的基礎上進行了優化,增加了順序訪問指針。

這裏寫圖片描述

如圖4所示,在B+Tree的每個葉子節點增加一個指向相鄰葉子節點的指針,就形成了帶有順序訪問指針的B+Tree。做這個優化的目的是爲了提高區間訪問的性能,例如圖4中如果要查詢key爲從18到49的所有數據記錄,當找到18後,只需順着節點和指針順序遍歷就可以一次性訪問到所有數據節點,極大提到了區間查詢效率。

這一節對B-Tree和B+Tree進行了一個簡單的介紹,下一節結合存儲器存取原理介紹爲什麼目前B+Tree是數據庫系統實現索引的首選數據結構。

爲什麼使用B-Tree(B+Tree)

上文說過,紅黑樹等數據結構也可以用來實現索引,但是文件系統及數據庫系統普遍採用B-/+Tree作爲索引結構,這一節將結合計算機組成原理相關知識討論B-/+Tree作爲索引的理論基礎。

一般來說,索引本身也很大,不可能全部存儲在內存中,因此索引往往以索引文件的形式存儲的磁盤上。這樣的話,索引查找過程中就要產生磁盤I/O消耗,相對於內存存取,I/O存取的消耗要高几個數量級,所以評價一個數據結構作爲索引的優劣最重要的指標就是在查找過程中磁盤I/O操作次數的漸進複雜度。換句話說,索引的結構組織要儘量減少查找過程中磁盤I/O的存取次數。下面先介紹內存和磁盤存取原理,然後再結合這些原理分析B-/+Tree作爲索引的效率。

主存存取原理

目前計算機使用的主存基本都是隨機讀寫存儲器(RAM),現代RAM的結構和存取原理比較複雜,這裏本文拋卻具體差別,抽象出一個十分簡單的存取模型來說明RAM的工作原理。

從抽象角度看,主存是一系列的存儲單元組成的矩陣,每個存儲單元存儲固定大小的數據。每個存儲單元有唯一的地址,現代主存的編址規則比較複雜,這裏將其簡化成一個二維地址:通過一個行地址和一個列地址可以唯一定位到一個存儲單元。圖5展示了一個4 x 4的主存模型。

主存的存取過程如下:

當系統需要讀取主存時,則將地址信號放到地址總線上傳給主存,主存讀到地址信號後,解析信號並定位到指定存儲單元,然後將此存儲單元數據放到數據總線上,供其它部件讀取。

寫主存的過程類似,系統將要寫入單元地址和數據分別放在地址總線和數據總線上,主存讀取兩個總線的內容,做相應的寫操作。

這裏可以看出,主存存取的時間僅與存取次數呈線性關係,因爲不存在機械操作,兩次存取的數據的“距離”不會對時間有任何影響,例如,先取A0再取A1和先取A0再取D3的時間消耗是一樣的。

磁盤存取原理

上文說過,索引一般以文件形式存儲在磁盤上,索引檢索需要磁盤I/O操作。與主存不同,磁盤I/O存在機械運動耗費,因此磁盤I/O的時間消耗是巨大的。

一個磁盤由大小相同且同軸的圓形盤片組成,磁盤可以轉動(各個磁盤必須同步轉動)。在磁盤的一側有磁頭支架,磁頭支架固定了一組磁頭,每個磁頭負責存取一個磁盤的內容。磁頭不能轉動,但是可以沿磁盤半徑方向運動(實際是斜切向運動),每個磁頭同一時刻也必須是同軸的,即從正上方向下看,所有磁頭任何時候都是重疊的(不過目前已經有多磁頭獨立技術,可不受此限制)。

盤片被劃分成一系列同心環,圓心是盤片中心,每個同心環叫做一個磁道,所有半徑相同的磁道組成一個柱面。磁道被沿半徑線劃分成一個個小的段,每個段叫做一個扇區,每個扇區是磁盤的最小存儲單元。爲了簡單起見,我們下面假設磁盤只有一個盤片和一個磁頭。

當需要從磁盤讀取數據時,系統會將數據邏輯地址傳給磁盤,磁盤的控制電路按照尋址邏輯將邏輯地址翻譯成物理地址,即確定要讀的數據在哪個磁道,哪個扇區。爲了讀取這個扇區的數據,需要將磁頭放到這個扇區上方,爲了實現這一點,磁頭需要移動對準相應磁道,這個過程叫做尋道,所耗費時間叫做尋道時間,然後磁盤旋轉將目標扇區旋轉到磁頭下,這個過程耗費的時間叫做旋轉時間。

局部性原理與磁盤預讀

由於存儲介質的特性,磁盤本身存取就比主存慢很多,再加上機械運動耗費,磁盤的存取速度往往是主存的幾百分分之一,因此爲了提高效率,要儘量減少磁盤I/O。爲了達到這個目的,磁盤往往不是嚴格按需讀取,而是每次都會預讀,即使只需要一個字節,磁盤也會從這個位置開始,順序向後讀取一定長度的數據放入內存。這樣做的理論依據是計算機科學中著名的局部性原理:

當一個數據被用到時,其附近的數據也通常會馬上被使用。

程序運行期間所需要的數據通常比較集中。

由於磁盤順序讀取的效率很高(不需要尋道時間,只需很少的旋轉時間),因此對於具有局部性的程序來說,預讀可以提高I/O效率。

預讀的長度一般爲頁(page)的整倍數。頁是計算機管理存儲器的邏輯塊,硬件及操作系統往往將主存和磁盤存儲區分割爲連續的大小相等的塊,每個存儲塊稱爲一頁(在許多操作系統中,頁得大小通常爲4k),主存和磁盤以頁爲單位交換數據。當程序要讀取的數據不在主存中時,會觸發一個缺頁異常,此時系統會向磁盤發出讀盤信號,磁盤會找到數據的起始位置並向後連續讀取一頁或幾頁載入內存中,然後異常返回,程序繼續運行。

索引實現

在MySQL中,索引屬於存儲引擎級別的概念,不同存儲引擎對索引的實現方式是不同的,本文主要討論MyISAM和InnoDB兩個存儲引擎的索引實現方式。

MyISAM索引實現

MyISAM引擎使用B+Tree作爲索引結構,葉節點的data域存放的是數據記錄的地址。下圖是MyISAM索引的原理圖:

這裏寫圖片描述

這裏設表一共有三列,假設我們以Col1爲主鍵,則圖8是一個MyISAM表的主索引(Primary key)示意。可以看出MyISAM的索引文件僅僅保存數據記錄的地址。在MyISAM中,主索引和輔助索引(Secondary key)在結構上沒有任何區別,只是主索引要求key是唯一的,而輔助索引的key可以重複。如果我們在Col2上建立一個輔助索引,則此索引的結構如下圖所示:

這裏寫圖片描述

同樣也是一顆B+Tree,data域保存數據記錄的地址。因此,MyISAM中索引檢索的算法爲首先按照B+Tree搜索算法搜索索引,如果指定的Key存在,則取出其data域的值,然後以data域的值爲地址,讀取相應數據記錄。

MyISAM的索引方式也叫做“非聚集”的,之所以這麼稱呼是爲了與InnoDB的聚集索引區分。

InnoDB索引實現

雖然InnoDB也使用B+Tree作爲索引結構,但具體實現方式卻與MyISAM截然不同。

第一個重大區別是InnoDB的數據文件本身就是索引文件。從上文知道,MyISAM索引文件和數據文件是分離的,索引文件僅保存數據記錄的地址。而在InnoDB中,表數據文件本身就是按B+Tree組織的一個索引結構,這棵樹的葉節點data域保存了完整的數據記錄。這個索引的key是數據表的主鍵,因此InnoDB表數據文件本身就是主索引。

這裏寫圖片描述

圖10是InnoDB主索引(同時也是數據文件)的示意圖,可以看到葉節點包含了完整的數據記錄。這種索引叫做聚集索引。因爲InnoDB的數據文件本身要按主鍵聚集,所以InnoDB要求表必須有主鍵(MyISAM可以沒有),如果沒有顯式指定,則MySQL系統會自動選擇一個可以唯一標識數據記錄的列作爲主鍵,如果不存在這種列,則MySQL自動爲InnoDB表生成一個隱含字段作爲主鍵,這個字段長度爲6個字節,類型爲長整形。

第二個與MyISAM索引的不同是InnoDB的輔助索引data域存儲相應記錄主鍵的值而不是地址。換句話說,InnoDB的所有輔助索引都引用主鍵作爲data域。例如,圖11爲定義在Col3上的一個輔助索引:

這裏寫圖片描述

這裏以英文字符的ASCII碼作爲比較準則。聚集索引這種實現方式使得按主鍵的搜索十分高效,但是輔助索引搜索需要檢索兩遍索引:首先檢索輔助索引獲得主鍵,然後用主鍵到主索引中檢索獲得記錄。

瞭解不同存儲引擎的索引實現方式對於正確使用和優化索引都非常有幫助,例如知道了InnoDB的索引實現後,就很容易明白爲什麼不建議使用過長的字段作爲主鍵,因爲所有輔助索引都引用主索引,過長的主索引會令輔助索引變得過大。再例如,用非單調的字段作爲主鍵在InnoDB中不是個好主意,因爲InnoDB數據文件本身是一顆B+Tree,非單調的主鍵會造成在插入新記錄時數據文件爲了維持B+Tree的特性而頻繁的分裂調整,十分低效,而使用自增字段作爲主鍵則是一個很好的選擇。

參考:http://blog.codinglabs.org/articles/theory-of-mysql-index.html

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