POP3協議允許電子郵件客戶端下載服務器上的郵件，但是在客戶端的操作（如移動郵件、標記已讀等），不會反饋到服務器上，比如通過客戶端收取了郵箱中的3封郵件並移動到其他文件夾，郵箱服務器上的這些郵件是沒有同時被移動的 。
而IMAP提供webmail 與電子郵件客戶端之間的雙向通信，客戶端的操作都會反饋到服務器上，對郵件進行的操作，服務器上的郵件也會做相應的動作。
同時，IMAP像POP3那樣提供了方便的郵件下載服務，讓用戶能進行離線閱讀。IMAP提供的摘要瀏覽功能可以讓你在閱讀完所有的郵件到達時間、主題、發件人、大小等信息後才作出是否下載的決定。此外，IMAP 更好地支持了從多個不同設備中隨時訪問新郵件。
總之，IMAP 整體上爲用戶帶來更爲便捷和可靠的體驗。POP3 更易丟失郵件或多次下載相同的郵件，但 IMAP 通過郵件客戶端與webmail 之間的雙向同步功能很好地避免了這些問題。
注：若在web郵箱中設置了“保存到已發送”，使用客戶端POP服務發信時，已發郵件也會自動同步到網頁端“已發送”文件夾內。