踩坑筆記之環境配置——Ubuntu16.04、caffe、pytorch、tensorflow、keras、anaconda、opencv3、matlab

（新版CSDN沒了markdown還有點兒難用不是很習慣。。排版很差將就看啦哈哈哈哈）

強調一下&讓自己記住踩過的屎坑~

• 刷機搭框架遇到問題——sudo下安裝

• caffe編譯出了問題——sudo su進入管理者再安裝

例如：error:could not find/open output/input file :  .build_release/..........諸如此類

另外，在運行caffe相關前需要到安裝根目錄下編譯caffe，依次輸入以下指令：

sudo su
make all -j4
make test -j4
make runtest
make pycaffe

 

• make pycaffe報錯

     如果在編譯make pycaffe這一句報錯，顯示：

make：nothing to be done for ‘pycaffe’

     先嚐試：

$ sudo apt-get install python-numpy

     再make pycaffe，如果還是報錯：fatal error：numpy/arrayobject.h: No such file or directory compilation terminated.

     但是在上一步已經有輸入：

$ sudo apt-get install python-numpy

     應當已經下載了python-numpy的包，懷疑是環境變量的問題，在jupyter下輸入：

import numpy as py
np.get_include()

    得到如下結果：（以及與caffe-master下查看Makefile.config）   

    注意，Makefile.config需要用權限才能修改，在Terminal中進入sudo界面，打開Makefile.config所在位置，依次輸入：

cp Makefile.config.example Makefile.config
gedit Makefile.config 

     把PYTHON_INCLUDE那一句按照jupyter輸出加上local/就可以保存啦。

    然後。。。（我也是很崩潰啊）make pycaffe報了新的錯誤（微笑臉），顯示cannot find -lhdf5_hl/cannot find -lhdf5：

     解決辦法還是回到剛纔的Makefile.config，找到：

# Whatever else you find you need goes here.下面的
INCLUDE_DIRS := $(PYTHON_INCLUDE) /usr/local/include
LIBRARY_DIRS := $(PYTHON_LIB) /usr/local/lib /usr/lib

     將上面這兩句修改爲：

INCLUDE_DIRS :=  $(PYTHON_INCLUDE) /usr/local/include /usr/include/hdf5/serial
LIBRARY_DIRS := $(PYTHON_LIB) /usr/local/lib /usr/lib /usr/lib/x86_64-linux-gnu /usr/lib/x86_64-linux-gnu/hdf5/serial
//這是因爲ubuntu16.04的文件包含位置發生了變化，尤其是需要用到的hdf5的位置，所以需要更改這一路徑

    好的~至此可以順利的make pycaffe啦~

   當然天真的我以爲可以在python中import caffe了，然鵝啊，程序員的世界是沒有這麼簡單的！！接下來進入下一節

 （啊啊啊啊啊這個工作站預裝的還不如以前自己裝啊好多坑啊哭唧唧T T，好多依賴庫也不知道裝沒裝）

 

• 安裝編譯好了caffe，但是無法在python中import

    ImportError：/opt/anaconda2/bin/../lib/libstdc++.so.6: version 'GLIBCXX_3.4.21' not found (requires by /home/caffe-master/python/caffe/_caffe.so)

    接着上面的來，現在報錯提示爲：

     用代碼查看工作站內GLIBCXX的版本：

     （這個地方還有一個小坑坑是libstdc++手動查看的時候只是在/usr/lib/libstdc++.so.6下，但是運行會報錯沒有這個文件，在此文件的properties中查看location是有x86_64-linux-gnu的，微笑臉~）

strings /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libstdc++.so.6 | grep GLIBCXX

     可素！這不就是嗎？？？瞎了我的卡姿蘭狗眼

    好的。。。在我查閱論壇發現很多時候Anaconda安裝都會和Caffe、python2、python3有衝突（例如用jupyter打開new file只有python2格式沒有python3的格式），那就試試把anaconda刪了吧。。。

    在根目錄（和home並列）下找到opt文件夾，刪除整個anaconda2的文件夾，但不能直接刪除，在terminal下輸入：

    

sudo rm -rf anaconda

     （有時候還需要註釋根目錄下.bashrc下包括anaconda2路徑的語句：#export PATH=/home/lq/anaconda3/bin:$PATH，

再在terminal輸入source ~/.bashrc使其立即生效，輸入python查看是否刪除乾淨）

    不吹不黑，刪完之後爽的不行：之前只能在sudo下才能import torch，直接在terminal下無法import torch也直接解決了.

   

    繼續開始重新編譯caffe，按上一小節重頭開始，輸入make pycaffe還報了一次沒有numpy，修改Makefile.config就好啦~

    現在試着import torch，顯示

     在終端輸入：（不知道爲啥根目錄下還有一個matplotlib的截圖？不知道怎麼弄的直接刪了）

sudo pip install python-Matplotlib

     撒花QAQ式完畢感謝上帝：
     不負責任的總結！！Conda是大坑大坑大坑

  

   

• 在sudo下安裝了pytorch，進入sudo可以import torch，但是在jupyter導入則報錯無module——ipython

     1.Step 1

       #python

$ sudo python -m pip install ipykernel
$ sudo python -m ipykernel install

       #python3

$ sudo python3 -m pip install jupyterhub notebook ipykernel
$ sudo python3 -m ipykernel install

     2.Step 2
     

$ sudo apt-get install build-essential

     3.Step 3

        #python2

$ sudo pip install jupyter
$ sudo apt-get build-dep python-matplotlib python-tk

        #python3

$ sudo pip3 install jupyter
$ sudo apt-get build-dep python3-matplotlib python3-tk

     4.Test

$ mkdir tf-notebooks
$ cd tf-notebooks
$ jupyter notebook

• Ubuntu16.04下安裝opencv

   貼上教程地址：http://blog.csdn.net/yehuohan/article/details/51327465

• 顯卡崩潰重新安裝驅動

   在開啓工作站的時候有時候出現開機界面分辨率異常，則是顯卡出現崩潰，重裝顯卡驅動：

   1、Ctrl+Alt+F1進入terminal界面

   2、輸入用戶名與密碼，依次輸入：

   

sudo service lightdm stop / sudo stop lightdm   #重啓lightdm
sudo init 3   #進入Ubuntu開機圖片的terminal界面

   3、安裝驅動程序，進入/home/lthpc/software，找到驅動文件所在地址，輸入：

   

sudo ./NVIDIA-Linux-x86_64-384.98.run

   4、sudo reboot 重啓

   5、有可能還會遇到需要exit X service的情況，如果安裝驅動報錯：......you appear to be running an x server plaese exit x 

before installing...... 需要找到進程前x service的ID並關閉：

ps -e | more #加上| more纔可以翻頁
sudo kill ID* #找到xorg對應進程ID

   再完成第3步即可。

 

• Ubuntu界面打開只有壁紙沒有菜單欄等

  首先Ctrl+Alt+F1，輸入命令行試着重啓lightdm：  

sudo service lightdm restart

   還是不行的話則需要重新安裝Unity，依次輸入：

sudo apt-get update
sudo apt-get install --reinstall ubuntu-desktop
sudo apt-get install unity

• 運行keras程序報錯：Your CPU suppotrs instructions that this TensorFlow binary was not compiled to use：SSE4.1 SSE4.2 AVX AVX2 FMA

      stackflow上關於此問題的說明：https://stackoverflow.com/questions/47068709/your-cpu-supports-instructions-that-this-tensorflow-binary-was-not-compiled-to-u

   

      也就是需要給Tensorflow進行自定義構建，在下面這個文檔中可以下載自己需要的類型的whl文件：

       https://translate.googleusercontent.com/translate_c?depth=1&hl=zh-CN&prev=search&rurl=translate.google.com.hk&sl=en&sp=nmt4&u=https://github.com/lakshayg/tensorflow-build&usg=ALkJrhizkozMagIs6hLEU-w2hLIUDM-ebQ

       下載完畢後將此文件放入/tmp下，cd tmp，輸入以下指令：

sudo pip install tensorflow-1.4.0-cp27-cp27mu-linux_x86_64.whl

     再次運行時則不會報錯了。

• Ubuntu16.04下安裝Matlab R2016b

     此鏈接寫得很完整：http://blog.csdn.net/jesse_mx/article/details/53956358

     按上面鏈接的步驟安裝完畢後需要退出掛載並且刪除文件，在Terminal下輸入：

sudo umount /home/<your user name & path>/matlab
sudo umount sudo umount /home/<your user name & path>/matlab  #因爲掛載了兩個文件
sudo rm -r /home/<your user name & path>/matlab

     另外，激活以後發現只能在安裝目錄/bin輸入.matlab才能打開matlab，配置環境變量的軟鏈接，在根目錄下輸入：

sudo gedit .bashrc

     在.bashrc文件最後export加入matlab的path：

export PATH="/usr/local/MATLAB/R2016b/bin:$PATH"

     返回Terminal輸入下面指令，使得環境變量立即更新：

source ~/.bashrc

注意：因爲上面給的鏈接的路徑寫法有空格，linux無法識別，我直接把“Matlab 2016b Linux64 Crack”那個文件夾名字改爲了“Crack”

如果發現激活不成功，報錯：Could not complete activation because the License  File could not be written to the disk. You might not have write  permission on the License File or the folder.

由於無法sudo matlab打開matlab（輸入matlab可以），需要在sudo下來激活，找到./activate_matlab.sh

cd /usr/local/MATLAB?R2016b/bin
sudo ./activate_matlab.sh

此時跳轉到了激活界面，但是是用權限打開的，可以順利加入license文件，激活成功。