本文主要包括個節點MPI環境的安裝，各節點無密碼SSH連接，NFS配置。
一、各節點MPI環境的安裝
（可以參考兩個文檔：ftp://ftp.mcs.anl.gov/pub/mpi/mpich2-doc-install.pdf和http://researchweb.iiit.ac.in/~abu_saad/files/Installing_MPI.pdf）
準備工作：centos6.2_x64系統，mpich2-1.4.1p1.tar。
配置三個節點的MPI機羣，三節點分別爲：host1，host2，host3。其中host2爲主控節點。
每個節點都添加相同的用戶名，有利於SSH無密碼訪問，我這裏使用zll。
各節點名字最好有規律一點，修改方法有兩種：
1.用vi打開/etc/sysconfig/network，命令式：vi
/etc/sysconfig/network，然後看到裏面有一個hostname
= ***，把後面的 修改爲你想要的 host
name即可，需重啓。這是修改單節點的名字。
爲了各節點間能夠通過節點名順利訪問各節點，需要將各節點的/etc/hosts文件加入各節點的IP和hostname。如下：
準備好，開始安裝。
1.解壓文件。
其中mpi是安裝mpi環境的目錄。
2.配置MPI
進入解壓後的文件夾，執行配置命令，其中prefix後面跟的是安裝目錄，這個用戶可以自己選擇。最新版本mpich2的進程管理默
認使用hydra，而不是mpd。如果想使用mpd，添加with-pm=mpd選擇mpd。
3.編譯安裝MPI
4.修改環境變量
修改用戶主文件夾(添加用戶zll後，會主動在/home下創建用戶主文件夾/home/zll下的.bash_profile文件，在PATH變量後面 添加自己的MPI路徑，例如我把MPI安裝在我的zll用戶主文件夾mpi路徑下，在PATH最後添加“：/home/zll/mpi/bin"。如下圖
保存退出，並執行以下命令：source .bash_profile測試環境變量設置
如果顯示正確就是安裝完成了。
5.創建文件.mpd.conf
進入用戶主文件夾/home/zll（或者$HOME），#創建文件
#設置權限
在.mpd.conf中添加一行：MPD_SECRETWORD=zll，其中zll可以隨意起，但是三個節點要一致。這主要是使用mpd命令必須加入的，爲了機器件的通信，如下圖：6.修改mpd.hosts文件
在主文件夾編輯mpd.hosts,寫入三個節點的hostname，如下圖7.關閉防火牆
以root賬戶登錄系統，執行service iptables stop關閉防火牆。8.然後運行一下命令
其中第一條命令是啓動一個mpd，mpdtrace -l 查看mpd的主機名和端口號mpdallexit是退出命令。如果正常表示沒有發生錯誤。（注意rhel6.2下面，執行程序前要執行mpdboot啓用一組mpd進程，個數和節點個數一樣：mpdboot -n 3 -f mpd.hosts,不然出錯).9.在其他節點上面執行以上步驟（可以不執行8）.
10.測試
在主控節點上面執行以下命令：在其他節點執行mpd -h {主控節點ip} -p {主控節點顯示的端口號} &在主節點執行mpdtrace -l，可以顯示當前ring中的主機。如果順利，各節點同MPI成功互聯了。
#創建文件
#設置權限
二、無密碼SSH
原理：Master作爲客戶端，要實現無密碼公鑰認證，連接到服務器Salve上時，需要在Master上生成一個密鑰對，包括一個公鑰和一個私鑰，而後將公鑰複製到所有的Salve上。當Master通過SSH鏈接到Salve上時，Salve會生成一個隨機數並用Master的公鑰對隨機數進行加密，併發送給Master。Master收到加密數之後再用私鑰解密，並將解密數回傳給Salve，Salve確認解密數無誤之後就允許Master進行連接了。這就是一個公鑰認證過程，期間不需要手工輸入密碼，重要的過程是將Master上產生的公鑰複製到Salve上。
1.主控節點
在主控節點的主文件目錄下，執行如下命令
一路回車，不輸入其他東西。這時目錄下會生成一個.ssh（注意不要自己建立.ssh這個目錄，否則出問題）的目錄，裏面會生成id_rsa和id_ras.pub兩個文件，進去.ssh執行
2.其他節點
然後在其他節點的主文件目錄下執行以下命令
生成.ssh文件夾，不要自己創建.ssh文件夾。3.複製文件
將主控節點的authorized_keys文件拷貝到其他節點的.ssh目錄下。4.測試
如果沒有問題，現在可以實現主控節點到其他節點無密碼ssh了，執行ssh host1和ssh host3（host2和host3是其他兩個節點）第一次要輸入”yes“，回車，注意不要直接回車。之後連接就直接可以連接了。5.注意問題
使用rsa不是dsa，每個節點的.ssh目錄要使用命令ssh-keygen -t rsa生成，不要自己建。首次連接輸入yes，回車，不要直接回車。如果不成最好重啓一下重試一次。（在rhel6.2上面我就是第一次沒有成功，第二次成功了）。
三、NFS配置
三臺機子是共享主控節點上主文件目錄下的cluster文件夾，其中host2是nfs服務器，下面1-4在host2上面做。記得最好以root權限關閉防火牆或者在防火牆裏面添加規則。
1.配置文件/etc/exports
配置文件/etc/exports，格式爲：共享目錄 可mount主機IP(參數1，參數2，……)
設置cluster的訪問權限爲777.
執行exportfs -r命令。
2.修改/etc/sysconfig/nfs
如果不修改後面會出mount.nfs:
access denied by server while mounting 10.4.14.211:/home/zll/cluster。
在文件/etc/sysconfig/nfs添加一行：RPCNFSDARGS="--no-nfs-version 4".
網上好多解決方法，都不行，最後發現是nfs4的問題，就是nfs版本4有問題，禁止掉就行。
3.開啓相關服務
啓動以上命令的時候最好使用超級用戶權限，否則有時候nfs服務打不開。
注意centos6.2及其以上版本將portmap更換成了rpcbind。
4.設置nfs開機自動啓動
5.nfs客戶端
開啓nfs服務：sudo service nfs start
開機啓動nfs服務：sudo chkconfig nfs on
可以查看可掛載的目錄：showmount -e 10.4.14.211.
掛載：mount -t nfs 10.4.14.211:/home/zll/cluster /home/zll/cluster
開機自動掛載：在文件/etc/fstab最後一行添加：hostname（或者server ip）：/directory 本機掛載目錄 nfs defaults 0 0
例如：host2：/home/zll/cluster /home/zll/cluster nfs defaults 0 0
（如果有問題，可以重啓nfs服務器的nfs一下：sudo service nfs restart).
6.測試
可以在server端的cluster裏面創建一個文件，然後在其他節點的掛載目錄下看看有沒有該文件，如果有表示成功。
以上都是經過本人親自測試過，並且成功的。