本文約定tomcatA使用a版本jdk的安裝路徑c:\a ，jre的安裝路徑爲：c:\jreA，tomcat的路徑d:\tomcatA；
tomcatB 使用b版本jdk的安裝路徑c:\b ，jre的安裝路徑爲：c:\jreB，tomcat的路徑 d:\tomcatB；
其他程序使用c版本的jdk的安裝路徑c:\c。
解決過程如下：
1，系統環境變量中JAVA_HOME=c:/c;CLASSPATH和PATH中使用%JAVA_HOME%;（）
2，系統環境變量中JAVA_HOME_1=c:/a;CLASSPATH和PATH中使用%JAVA_HOME_1%;
3,tomcatA的設置：修改tomcatA的service.bat文件與setclasspath.bat中將所有JAVA_HOME都替換成JAVA_HOME_1,JRE_HOME替換爲JRE_HOME_1，並將其路徑設置爲jre的安裝路徑，將所有 CATALINA_HOME都替換成CATALINA_HOME_1;將所有 CATALINA_BASE都替換成CATALINA_BASE_1;
找到set CURRENT_DIR=%這行，在它下面加入
set JAVA_HOME_1=C:\a
set CATALINA_HOME_1=d:\tomcatA
set CATALINA_BASE_1=d:\tomcatA
set JRE_HOME_1=c:\jreA
然後執行service.bat就可以了。啓動測試一下，如果訪問通過。就說明tomcatA沒有問題了，
再來修改
4，系統環境變量中JAVA_HOME_2=c:/b;CLASSPATH和PATH中使用%JAVA_HOME_2%;
修改tomcatB的service.bat文件與setclasspath.bat中將所有JAVA_HOME都替換成JAVA_HOME_2,JRE_HOME替換爲JRE_HOME_2，並將其路徑設置爲jre的安裝路徑;將所有 CATALINA_HOME都替換成CATALINA_HOME_2;將所有 CATALINA_BASE都替換成CATALINA_BASE_2;
找到set CURRENT_DIR=%這行，在它下面加入
set JAVA_HOME_2=C:\b
set CATALINA_HOME_2=d:\tomcatB
set CATALINA_BASE_2=d:\tomcatB
set JRE_HOME_2=c:\jreB
找到下面這兩句
set SERVICE_NAME= //實際名稱
set PR_DISPLAYNAME= //顯示名稱
可以修改下兩個名字，是tomcatA和tomcatB不至於重名，並且能從服務名上明顯分辨出對應的應用來。
然後執行service.bat就可以了。啓動測試一下，如果訪問通過。就說明tomcatB沒有問題了，
至此，問題就解決了，可能中間的過程有多餘的，大家在使用中去發現吧。