FHS 針對目錄樹架構僅定義出三層目錄底下應該放置什麼樣的結構而已，分別是底下這三個目錄的定義：
/（root，根目錄）：與開機系統有關；
/user （unix software resource ）：與軟件安裝/執行有關；
/var （variable）：與系統運作過程有關。
目錄樹 （directory tree）
在linux底下 ，所有的文件與目錄都是又根目錄開始的！那是所有文件與目錄的的源頭。。然後在一個一個分支下來，有點像樹枝狀，因此我們也稱這種目錄配置方式爲：目錄樹
1 目錄樹的其實點爲根目錄 （/ root）；
2每一個目錄不僅能使用本地段的partition 的文件系統，也可使用網絡上的filesystem 。舉例來說
可以利用 network file system （NFS）服務器掛載特定目錄等。
3每一個文件在此目錄中都是獨一無二的。