我是centos系統，是通過下面的方法解決的
編譯MySQL的過程中提示：
/bin/rm: cannot remove `libtoolt': No such file or directory
解決：
1、確認libtool是否已經安裝，如果沒有安裝的話，則先安裝libtool
# yum -y install libtool
2、分別執行以下三條命令：
# autoreconf --force --install
# libtoolize --automake --force
# automake --force --add-missing
再重新編譯安裝，問題解決！
在網上也看到有別的辦法，但是我沒有測試過，例如：
這時直接打開 configure，把 $RM “$cfgfile” 那行刪除掉，重新再運行 ./configure 就可以