Spark性能優化指南——高級篇

數據傾斜調優

調優概述

有的時候,我們可能會遇到大數據計算中一個最棘手的問題——數據傾斜,此時Spark作業的性能會比期望差很多。數據傾斜調優,就是使用各種技術方案解決不同類型的數據傾斜問題,以保證Spark作業的性能。

數據傾斜發生時的現象

  • 絕大多數task執行得都非常快,但個別task執行極慢。比如,總共有1000個task,997個task都在1分鐘之內執行完了,但是剩餘兩三個task卻要一兩個小時。這種情況很常見。
  • 原本能夠正常執行的Spark作業,某天突然報出OOM(內存溢出)異常,觀察異常棧,是我們寫的業務代碼造成的。這種情況比較少見。

數據傾斜發生的原理

數據傾斜的原理很簡單:在進行shuffle的時候,必須將各個節點上相同的key拉取到某個節點上的一個task來進行處理,比如按照key進行 聚合或join等操作。此時如果某個key對應的數據量特別大的話,就會發生數據傾斜。比如大部分key對應10條數據,但是個別key卻對應了100萬 條數據,那麼大部分task可能就只會分配到10條數據,然後1秒鐘就運行完了;但是個別task可能分配到了100萬數據,要運行一兩個小時。因此,整 個Spark作業的運行進度是由運行時間最長的那個task決定的。

因此出現數據傾斜的時候,Spark作業看起來會運行得非常緩慢,甚至可能因爲某個task處理的數據量過大導致內存溢出。

下圖就是一個很清晰的例子:hello這個key,在三個節點上對應了總共7條數據,這些數據都會被拉取到同一個task中進行處理;而world 和you這兩個key分別纔對應1條數據,所以另外兩個task只要分別處理1條數據即可。此時第一個task的運行時間可能是另外兩個task的7倍, 而整個stage的運行速度也由運行最慢的那個task所決定。

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如何定位導致數據傾斜的代碼

數據傾斜只會發生在shuffle過程中。這裏給大家羅列一些常用的並且可能會觸發shuffle操作的算子:distinct、 groupByKey、reduceByKey、aggregateByKey、join、cogroup、repartition等。出現數據傾斜時, 可能就是你的代碼中使用了這些算子中的某一個所導致的。

某個task執行特別慢的情況

首先要看的,就是數據傾斜發生在第幾個stage中。

如果是用yarn-client模式提交,那麼本地是直接可以看到log的,可以在log中找到當前運行到了第幾個stage;如果是用yarn- cluster模式提交,則可以通過Spark Web UI來查看當前運行到了第幾個stage。此外,無論是使用yarn-client模式還是yarn-cluster模式,我們都可以在Spark Web UI上深入看一下當前這個stage各個task分配的數據量,從而進一步確定是不是task分配的數據不均勻導致了數據傾斜。

比如下圖中,倒數第三列顯示了每個task的運行時間。明顯可以看到,有的task運行特別快,只需要幾秒鐘就可以運行完;而有的task運行特別 慢,需要幾分鐘才能運行完,此時單從運行時間上看就已經能夠確定發生數據傾斜了。此外,倒數第一列顯示了每個task處理的數據量,明顯可以看到,運行時 間特別短的task只需要處理幾百KB的數據即可,而運行時間特別長的task需要處理幾千KB的數據,處理的數據量差了10倍。此時更加能夠確定是發生 了數據傾斜。

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知道數據傾斜發生在哪一個stage之後,接着我們就需要根據stage劃分原理,推算出來發生傾斜的那個stage對應代碼中的哪一部分,這部分 代碼中肯定會有一個shuffle類算子。精準推算stage與代碼的對應關係,需要對Spark的源碼有深入的理解,這裏我們可以介紹一個相對簡單實用 的推算方法:只要看到Spark代碼中出現了一個shuffle類算子或者是Spark SQL的SQL語句中出現了會導致shuffle的語句(比如group by語句),那麼就可以判定,以那個地方爲界限劃分出了前後兩個stage。

這裏我們就以Spark最基礎的入門程序——單詞計數來舉例,如何用最簡單的方法大致推算出一個stage對應的代碼。如下示例,在整個代碼中,只 有一個reduceByKey是會發生shuffle的算子,因此就可以認爲,以這個算子爲界限,會劃分出前後兩個stage。

  • stage0,主要是執行從textFile到map操作,以及執行shuffle write操作。shuffle write操作,我們可以簡單理解爲對pairs RDD中的數據進行分區操作,每個task處理的數據中,相同的key會寫入同一個磁盤文件內。
  • stage1,主要是執行從reduceByKey到collect操作,stage1的各個task一開始運行,就會首先執行shuffle read操作。執行shuffle read操作的task,會從stage0的各個task所在節點拉取屬於自己處理的那些key,然後對同一個key進行全局性的聚合或join等操作, 在這裏就是對key的value值進行累加。stage1在執行完reduceByKey算子之後,就計算出了最終的wordCounts RDD,然後會執行collect算子,將所有數據拉取到Driver上,供我們遍歷和打印輸出。
 
  1. val conf = new SparkConf()
  2. val sc = new SparkContext(conf)
  3.  
  4. val lines = sc.textFile("hdfs://...")
  5. val words = lines.flatMap(_.split(" "))
  6. val pairs = words.map((_, 1))
  7. val wordCounts = pairs.reduceByKey(_ + _)
  8.  
  9. wordCounts.collect().foreach(println(_))

通過對單詞計數程序的分析,希望能夠讓大家瞭解最基本的stage劃分的原理,以及stage劃分後shuffle操作是如何在兩個stage的邊 界處執行的。然後我們就知道如何快速定位出發生數據傾斜的stage對應代碼的哪一個部分了。比如我們在Spark Web UI或者本地log中發現,stage1的某幾個task執行得特別慢,判定stage1出現了數據傾斜,那麼就可以回到代碼中定位出stage1主要包 括了reduceByKey這個shuffle類算子,此時基本就可以確定是由educeByKey算子導致的數據傾斜問題。比如某個單詞出現了100萬 次,其他單詞纔出現10次,那麼stage1的某個task就要處理100萬數據,整個stage的速度就會被這個task拖慢。

某個task莫名其妙內存溢出的情況

這種情況下去定位出問題的代碼就比較容易了。我們建議直接看yarn-client模式下本地log的異常棧,或者是通過YARN查看yarn- cluster模式下的log中的異常棧。一般來說,通過異常棧信息就可以定位到你的代碼中哪一行發生了內存溢出。然後在那行代碼附近找找,一般也會有 shuffle類算子,此時很可能就是這個算子導致了數據傾斜。

但是大家要注意的是,不能單純靠偶然的內存溢出就判定發生了數據傾斜。因爲自己編寫的代碼的bug,以及偶然出現的數據異常,也可能會導致內存溢 出。因此還是要按照上面所講的方法,通過Spark Web UI查看報錯的那個stage的各個task的運行時間以及分配的數據量,才能確定是否是由於數據傾斜才導致了這次內存溢出。

查看導致數據傾斜的key的數據分佈情況

知道了數據傾斜發生在哪裏之後,通常需要分析一下那個執行了shuffle操作並且導致了數據傾斜的RDD/Hive表,查看一下其中key的分佈 情況。這主要是爲之後選擇哪一種技術方案提供依據。針對不同的key分佈與不同的shuffle算子組合起來的各種情況,可能需要選擇不同的技術方案來解 決。

此時根據你執行操作的情況不同,可以有很多種查看key分佈的方式:

  1. 如果是Spark SQL中的group by、join語句導致的數據傾斜,那麼就查詢一下SQL中使用的表的key分佈情況。
  2. 如果是對Spark RDD執行shuffle算子導致的數據傾斜,那麼可以在Spark作業中加入查看key分佈的代碼,比如RDD.countByKey()。然後對統計 出來的各個key出現的次數,collect/take到客戶端打印一下,就可以看到key的分佈情況。

舉例來說,對於上面所說的單詞計數程序,如果確定了是stage1的reduceByKey算子導致了數據傾斜,那麼就應該看看進行 reduceByKey操作的RDD中的key分佈情況,在這個例子中指的就是pairs RDD。如下示例,我們可以先對pairs採樣10%的樣本數據,然後使用countByKey算子統計出每個key出現的次數,最後在客戶端遍歷和打印 樣本數據中各個key的出現次數。

 
  1. val sampledPairs = pairs.sample(false, 0.1)
  2. val sampledWordCounts = sampledPairs.countByKey()
  3. sampledWordCounts.foreach(println(_))

數據傾斜的解決方案

解決方案一:使用Hive ETL預處理數據

方案適用場景:導致數據傾斜的是Hive表。如果該Hive表中的數據本身很不均勻(比如某個key對應了100萬數據,其他key纔對應了10條數據),而且業務場景需要頻繁使用Spark對Hive表執行某個分析操作,那麼比較適合使用這種技術方案。

方案實現思路:此時可以評估一下,是否可以通過Hive來進行數據預處理(即通過Hive ETL預先對數據按照key進行聚合,或者是預先和其他表進行join),然後在Spark作業中針對的數據源就不是原來的Hive表了,而是預處理後的 Hive表。此時由於數據已經預先進行過聚合或join操作了,那麼在Spark作業中也就不需要使用原先的shuffle類算子執行這類操作了。

方案實現原理:這種方案從根源上解決了數據傾斜,因爲徹底避免了在Spark中執行shuffle類算子,那麼 肯定就不會有數據傾斜的問題了。但是這裏也要提醒一下大家,這種方式屬於治標不治本。因爲畢竟數據本身就存在分佈不均勻的問題,所以Hive ETL中進行group by或者join等shuffle操作時,還是會出現數據傾斜,導致Hive ETL的速度很慢。我們只是把數據傾斜的發生提前到了Hive ETL中,避免Spark程序發生數據傾斜而已。

方案優點:實現起來簡單便捷,效果還非常好,完全規避掉了數據傾斜,Spark作業的性能會大幅度提升。

方案缺點:治標不治本,Hive ETL中還是會發生數據傾斜。

方案實踐經驗:在一些Java系統與Spark結合使用的項目中,會出現Java代碼頻繁調用Spark作業的 場景,而且對Spark作業的執行性能要求很高,就比較適合使用這種方案。將數據傾斜提前到上游的Hive ETL,每天僅執行一次,只有那一次是比較慢的,而之後每次Java調用Spark作業時,執行速度都會很快,能夠提供更好的用戶體驗。

項目實踐經驗:在美團·點評的交互式用戶行爲分析系統中使用了這種方案,該系統主要是允許用戶通過Java Web系統提交數據分析統計任務,後端通過Java提交Spark作業進行數據分析統計。要求Spark作業速度必須要快,儘量在10分鐘以內,否則速度 太慢,用戶體驗會很差。所以我們將有些Spark作業的shuffle操作提前到了Hive ETL中,從而讓Spark直接使用預處理的Hive中間表,儘可能地減少Spark的shuffle操作,大幅度提升了性能,將部分作業的性能提升了6 倍以上。

解決方案二:過濾少數導致傾斜的key

方案適用場景:如果發現導致傾斜的key就少數幾個,而且對計算本身的影響並不大的話,那麼很適合使用這種方案。比如99%的key就對應10條數據,但是隻有一個key對應了100萬數據,從而導致了數據傾斜。

方案實現思路:如果我們判斷那少數幾個數據量特別多的key,對作業的執行和計算結果不是特別重要的話,那麼幹 脆就直接過濾掉那少數幾個key。比如,在Spark SQL中可以使用where子句過濾掉這些key或者在Spark Core中對RDD執行filter算子過濾掉這些key。如果需要每次作業執行時,動態判定哪些key的數據量最多然後再進行過濾,那麼可以使用 sample算子對RDD進行採樣,然後計算出每個key的數量,取數據量最多的key過濾掉即可。

方案實現原理:將導致數據傾斜的key給過濾掉之後,這些key就不會參與計算了,自然不可能產生數據傾斜。

方案優點:實現簡單,而且效果也很好,可以完全規避掉數據傾斜。

方案缺點:適用場景不多,大多數情況下,導致傾斜的key還是很多的,並不是只有少數幾個。

方案實踐經驗:在項目中我們也採用過這種方案解決數據傾斜。有一次發現某一天Spark作業在運行的時候突然 OOM了,追查之後發現,是Hive表中的某一個key在那天數據異常,導致數據量暴增。因此就採取每次執行前先進行採樣,計算出樣本中數據量最大的幾個 key之後,直接在程序中將那些key給過濾掉。

解決方案三:提高shuffle操作的並行度

方案適用場景:如果我們必須要對數據傾斜迎難而上,那麼建議優先使用這種方案,因爲這是處理數據傾斜最簡單的一種方案。

方案實現思路:在對RDD執行shuffle算子時,給shuffle算子傳入一個參數,比如 reduceByKey(1000),該參數就設置了這個shuffle算子執行時shuffle read task的數量。對於Spark SQL中的shuffle類語句,比如group by、join等,需要設置一個參數,即spark.sql.shuffle.partitions,該參數代表了shuffle read task的並行度,該值默認是200,對於很多場景來說都有點過小。

方案實現原理:增加shuffle read task的數量,可以讓原本分配給一個task的多個key分配給多個task,從而讓每個task處理比原來更少的數據。舉例來說,如果原本有5個 key,每個key對應10條數據,這5個key都是分配給一個task的,那麼這個task就要處理50條數據。而增加了shuffle read task以後,每個task就分配到一個key,即每個task就處理10條數據,那麼自然每個task的執行時間都會變短了。具體原理如下圖所示。

方案優點:實現起來比較簡單,可以有效緩解和減輕數據傾斜的影響。

方案缺點:只是緩解了數據傾斜而已,沒有徹底根除問題,根據實踐經驗來看,其效果有限。

方案實踐經驗:該方案通常無法徹底解決數據傾斜,因爲如果出現一些極端情況,比如某個key對應的數據量有 100萬,那麼無論你的task數量增加到多少,這個對應着100萬數據的key肯定還是會分配到一個task中去處理,因此註定還是會發生數據傾斜的。 所以這種方案只能說是在發現數據傾斜時嘗試使用的第一種手段,嘗試去用嘴簡單的方法緩解數據傾斜而已,或者是和其他方案結合起來使用。

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解決方案四:兩階段聚合(局部聚合+全局聚合)

方案適用場景:對RDD執行reduceByKey等聚合類shuffle算子或者在Spark SQL中使用group by語句進行分組聚合時,比較適用這種方案。

方案實現思路:這個方案的核心實現思路就是進行兩階段聚合。第一次是局部聚合,先給每個key都打上一個隨機 數,比如10以內的隨機數,此時原先一樣的key就變成不一樣的了,比如(hello, 1) (hello, 1) (hello, 1) (hello, 1),就會變成(1_hello, 1) (1_hello, 1) (2_hello, 1) (2_hello, 1)。接着對打上隨機數後的數據,執行reduceByKey等聚合操作,進行局部聚合,那麼局部聚合結果,就會變成了(1_hello, 2) (2_hello, 2)。然後將各個key的前綴給去掉,就會變成(hello,2)(hello,2),再次進行全局聚合操作,就可以得到最終結果了,比如(hello, 4)。

方案實現原理:將原本相同的key通過附加隨機前綴的方式,變成多個不同的key,就可以讓原本被一個task處理的數據分散到多個task上去做局部聚合,進而解決單個task處理數據量過多的問題。接着去除掉隨機前綴,再次進行全局聚合,就可以得到最終的結果。具體原理見下圖。

方案優點:對於聚合類的shuffle操作導致的數據傾斜,效果是非常不錯的。通常都可以解決掉數據傾斜,或者至少是大幅度緩解數據傾斜,將Spark作業的性能提升數倍以上。

方案缺點:僅僅適用於聚合類的shuffle操作,適用範圍相對較窄。如果是join類的shuffle操作,還得用其他的解決方案。

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  1. // 第一步,給RDD中的每個key都打上一個隨機前綴。
  2. JavaPairRDD<String, Long> randomPrefixRdd = rdd.mapToPair(
  3. new PairFunction<Tuple2<Long,Long>, String, Long>() {
  4. private static final long serialVersionUID = 1L;
  5. @Override
  6. public Tuple2<String, Long> call(Tuple2<Long, Long> tuple)
  7. throws Exception {
  8. Random random = new Random();
  9. int prefix = random.nextInt(10);
  10. return new Tuple2<String, Long>(prefix + "_" + tuple._1, tuple._2);
  11. }
  12. });
  13.  
  14. // 第二步,對打上隨機前綴的key進行局部聚合。
  15. JavaPairRDD<String, Long> localAggrRdd = randomPrefixRdd.reduceByKey(
  16. new Function2<Long, Long, Long>() {
  17. private static final long serialVersionUID = 1L;
  18. @Override
  19. public Long call(Long v1, Long v2) throws Exception {
  20. return v1 + v2;
  21. }
  22. });
  23.  
  24. // 第三步,去除RDD中每個key的隨機前綴。
  25. JavaPairRDD<Long, Long> removedRandomPrefixRdd = localAggrRdd.mapToPair(
  26. new PairFunction<Tuple2<String,Long>, Long, Long>() {
  27. private static final long serialVersionUID = 1L;
  28. @Override
  29. public Tuple2<Long, Long> call(Tuple2<String, Long> tuple)
  30. throws Exception {
  31. long originalKey = Long.valueOf(tuple._1.split("_")[1]);
  32. return new Tuple2<Long, Long>(originalKey, tuple._2);
  33. }
  34. });
  35.  
  36. // 第四步,對去除了隨機前綴的RDD進行全局聚合。
  37. JavaPairRDD<Long, Long> globalAggrRdd = removedRandomPrefixRdd.reduceByKey(
  38. new Function2<Long, Long, Long>() {
  39. private static final long serialVersionUID = 1L;
  40. @Override
  41. public Long call(Long v1, Long v2) throws Exception {
  42. return v1 + v2;
  43. }
  44. });

解決方案五:將reduce join轉爲map join

方案適用場景:在對RDD使用join類操作,或者是在Spark SQL中使用join語句時,而且join操作中的一個RDD或表的數據量比較小(比如幾百M或者一兩G),比較適用此方案。

方案實現思路:不使用join算子進行連接操作,而使用Broadcast變量與map類算子實現join操 作,進而完全規避掉shuffle類的操作,徹底避免數據傾斜的發生和出現。將較小RDD中的數據直接通過collect算子拉取到Driver端的內存 中來,然後對其創建一個Broadcast變量;接着對另外一個RDD執行map類算子,在算子函數內,從Broadcast變量中獲取較小RDD的全量 數據,與當前RDD的每一條數據按照連接key進行比對,如果連接key相同的話,那麼就將兩個RDD的數據用你需要的方式連接起來。

方案實現原理:普通的join是會走shuffle過程的,而一旦shuffle,就相當於會將相同key的數 據拉取到一個shuffle read task中再進行join,此時就是reduce join。但是如果一個RDD是比較小的,則可以採用廣播小RDD全量數據+map算子來實現與join同樣的效果,也就是map join,此時就不會發生shuffle操作,也就不會發生數據傾斜。具體原理如下圖所示。

方案優點:對join操作導致的數據傾斜,效果非常好,因爲根本就不會發生shuffle,也就根本不會發生數據傾斜。

方案缺點:適用場景較少,因爲這個方案只適用於一個大表和一個小表的情況。畢竟我們需要將小表進行廣播,此時會 比較消耗內存資源,driver和每個Executor內存中都會駐留一份小RDD的全量數據。如果我們廣播出去的RDD數據比較大,比如10G以上,那 麼就可能發生內存溢出了。因此並不適合兩個都是大表的情況。

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  1. // 首先將數據量比較小的RDD的數據,collect到Driver中來。
  2. List<Tuple2<Long, Row>> rdd1Data = rdd1.collect()
  3. // 然後使用Spark的廣播功能,將小RDD的數據轉換成廣播變量,這樣每個Executor就只有一份RDD的數據。
  4. // 可以儘可能節省內存空間,並且減少網絡傳輸性能開銷。
  5. final Broadcast<List<Tuple2<Long, Row>>> rdd1DataBroadcast = sc.broadcast(rdd1Data);
  6.  
  7. // 對另外一個RDD執行map類操作,而不再是join類操作。
  8. JavaPairRDD<String, Tuple2<String, Row>> joinedRdd = rdd2.mapToPair(
  9. new PairFunction<Tuple2<Long,String>, String, Tuple2<String, Row>>() {
  10. private static final long serialVersionUID = 1L;
  11. @Override
  12. public Tuple2<String, Tuple2<String, Row>> call(Tuple2<Long, String> tuple)
  13. throws Exception {
  14. // 在算子函數中,通過廣播變量,獲取到本地Executor中的rdd1數據。
  15. List<Tuple2<Long, Row>> rdd1Data = rdd1DataBroadcast.value();
  16. // 可以將rdd1的數據轉換爲一個Map,便於後面進行join操作。
  17. Map<Long, Row> rdd1DataMap = new HashMap<Long, Row>();
  18. for(Tuple2<Long, Row> data : rdd1Data) {
  19. rdd1DataMap.put(data._1, data._2);
  20. }
  21. // 獲取當前RDD數據的key以及value。
  22. String key = tuple._1;
  23. String value = tuple._2;
  24. // 從rdd1數據Map中,根據key獲取到可以join到的數據。
  25. Row rdd1Value = rdd1DataMap.get(key);
  26. return new Tuple2<String, String>(key, new Tuple2<String, Row>(value, rdd1Value));
  27. }
  28. });
  29.  
  30. // 這裏得提示一下。
  31. // 上面的做法,僅僅適用於rdd1中的key沒有重複,全部是唯一的場景。
  32. // 如果rdd1中有多個相同的key,那麼就得用flatMap類的操作,在進行join的時候不能用map,而是得遍歷rdd1所有數據進行join。
  33. // rdd2中每條數據都可能會返回多條join後的數據。

解決方案六:採樣傾斜key並分拆join操作

方案適用場景:兩個RDD/Hive表進行join的時候,如果數據量都比較大,無法採用“解決方案五”,那麼 此時可以看一下兩個RDD/Hive表中的key分佈情況。如果出現數據傾斜,是因爲其中某一個RDD/Hive表中的少數幾個key的數據量過大,而另 一個RDD/Hive表中的所有key都分佈比較均勻,那麼採用這個解決方案是比較合適的。

方案實現思路:

  • 對包含少數幾個數據量過大的key的那個RDD,通過sample算子採樣出一份樣本來,然後統計一下每個key的數量,計算出來數據量最大的是哪幾個key。
  • 然後將這幾個key對應的數據從原來的RDD中拆分出來,形成一個單獨的RDD,並給每個key都打上n以內的隨機數作爲前綴,而不會導致傾斜的大部分key形成另外一個RDD。
  • 接着將需要join的另一個RDD,也過濾出來那幾個傾斜key對應的數據並形成一個單獨的RDD,將每條數據膨脹成n條數據,這n條數據都按順序附加一個0~n的前綴,不會導致傾斜的大部分key也形成另外一個RDD。
  • 再將附加了隨機前綴的獨立RDD與另一個膨脹n倍的獨立RDD進行join,此時就可以將原先相同的key打散成n份,分散到多個task中去進行join了。
  • 而另外兩個普通的RDD就照常join即可。
  • 最後將兩次join的結果使用union算子合併起來即可,就是最終的join結果。

方案實現原理:對於join導致的數據傾斜,如果只是某幾個key導致了傾斜,可以將少數幾個key分拆成獨立RDD,並附加隨機前綴打散成n份去進行join,此時這幾個key對應的數據就不會集中在少數幾個task上,而是分散到多個task進行join了。具體原理見下圖。

方案優點:對於join導致的數據傾斜,如果只是某幾個key導致了傾斜,採用該方式可以用最有效的方式打散key進行join。而且只需要針對少數傾斜key對應的數據進行擴容n倍,不需要對全量數據進行擴容。避免了佔用過多內存。

方案缺點:如果導致傾斜的key特別多的話,比如成千上萬個key都導致數據傾斜,那麼這種方式也不適合。

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  1. // 首先從包含了少數幾個導致數據傾斜key的rdd1中,採樣10%的樣本數據。
  2. JavaPairRDD<Long, String> sampledRDD = rdd1.sample(false, 0.1);
  3.  
  4. // 對樣本數據RDD統計出每個key的出現次數,並按出現次數降序排序。
  5. // 對降序排序後的數據,取出top 1或者top 100的數據,也就是key最多的前n個數據。
  6. // 具體取出多少個數據量最多的key,由大家自己決定,我們這裏就取1個作爲示範。
  7. JavaPairRDD<Long, Long> mappedSampledRDD = sampledRDD.mapToPair(
  8. new PairFunction<Tuple2<Long,String>, Long, Long>() {
  9. private static final long serialVersionUID = 1L;
  10. @Override
  11. public Tuple2<Long, Long> call(Tuple2<Long, String> tuple)
  12. throws Exception {
  13. return new Tuple2<Long, Long>(tuple._1, 1L);
  14. }
  15. });
  16. JavaPairRDD<Long, Long> countedSampledRDD = mappedSampledRDD.reduceByKey(
  17. new Function2<Long, Long, Long>() {
  18. private static final long serialVersionUID = 1L;
  19. @Override
  20. public Long call(Long v1, Long v2) throws Exception {
  21. return v1 + v2;
  22. }
  23. });
  24. JavaPairRDD<Long, Long> reversedSampledRDD = countedSampledRDD.mapToPair(
  25. new PairFunction<Tuple2<Long,Long>, Long, Long>() {
  26. private static final long serialVersionUID = 1L;
  27. @Override
  28. public Tuple2<Long, Long> call(Tuple2<Long, Long> tuple)
  29. throws Exception {
  30. return new Tuple2<Long, Long>(tuple._2, tuple._1);
  31. }
  32. });
  33. final Long skewedUserid = reversedSampledRDD.sortByKey(false).take(1).get(0)._2;
  34.  
  35. // 從rdd1中分拆出導致數據傾斜的key,形成獨立的RDD。
  36. JavaPairRDD<Long, String> skewedRDD = rdd1.filter(
  37. new Function<Tuple2<Long,String>, Boolean>() {
  38. private static final long serialVersionUID = 1L;
  39. @Override
  40. public Boolean call(Tuple2<Long, String> tuple) throws Exception {
  41. return tuple._1.equals(skewedUserid);
  42. }
  43. });
  44. // 從rdd1中分拆出不導致數據傾斜的普通key,形成獨立的RDD。
  45. JavaPairRDD<Long, String> commonRDD = rdd1.filter(
  46. new Function<Tuple2<Long,String>, Boolean>() {
  47. private static final long serialVersionUID = 1L;
  48. @Override
  49. public Boolean call(Tuple2<Long, String> tuple) throws Exception {
  50. return !tuple._1.equals(skewedUserid);
  51. }
  52. });
  53.  
  54. // rdd2,就是那個所有key的分佈相對較爲均勻的rdd。
  55. // 這裏將rdd2中,前面獲取到的key對應的數據,過濾出來,分拆成單獨的rdd,並對rdd中的數據使用flatMap算子都擴容100倍。
  56. // 對擴容的每條數據,都打上0~100的前綴。
  57. JavaPairRDD<String, Row> skewedRdd2 = rdd2.filter(
  58. new Function<Tuple2<Long,Row>, Boolean>() {
  59. private static final long serialVersionUID = 1L;
  60. @Override
  61. public Boolean call(Tuple2<Long, Row> tuple) throws Exception {
  62. return tuple._1.equals(skewedUserid);
  63. }
  64. }).flatMapToPair(new PairFlatMapFunction<Tuple2<Long,Row>, String, Row>() {
  65. private static final long serialVersionUID = 1L;
  66. @Override
  67. public Iterable<Tuple2<String, Row>> call(
  68. Tuple2<Long, Row> tuple) throws Exception {
  69. Random random = new Random();
  70. List<Tuple2<String, Row>> list = new ArrayList<Tuple2<String, Row>>();
  71. for(int i = 0; i < 100; i++) {
  72. list.add(new Tuple2<String, Row>(i + "_" + tuple._1, tuple._2));
  73. }
  74. return list;
  75. }
  76.  
  77. });
  78.  
  79. // 將rdd1中分拆出來的導致傾斜的key的獨立rdd,每條數據都打上100以內的隨機前綴。
  80. // 然後將這個rdd1中分拆出來的獨立rdd,與上面rdd2中分拆出來的獨立rdd,進行join。
  81. JavaPairRDD<Long, Tuple2<String, Row>> joinedRDD1 = skewedRDD.mapToPair(
  82. new PairFunction<Tuple2<Long,String>, String, String>() {
  83. private static final long serialVersionUID = 1L;
  84. @Override
  85. public Tuple2<String, String> call(Tuple2<Long, String> tuple)
  86. throws Exception {
  87. Random random = new Random();
  88. int prefix = random.nextInt(100);
  89. return new Tuple2<String, String>(prefix + "_" + tuple._1, tuple._2);
  90. }
  91. })
  92. .join(skewedUserid2infoRDD)
  93. .mapToPair(new PairFunction<Tuple2<String,Tuple2<String,Row>>, Long, Tuple2<String, Row>>() {
  94. private static final long serialVersionUID = 1L;
  95. @Override
  96. public Tuple2<Long, Tuple2<String, Row>> call(
  97. Tuple2<String, Tuple2<String, Row>> tuple)
  98. throws Exception {
  99. long key = Long.valueOf(tuple._1.split("_")[1]);
  100. return new Tuple2<Long, Tuple2<String, Row>>(key, tuple._2);
  101. }
  102. });
  103.  
  104. // 將rdd1中分拆出來的包含普通key的獨立rdd,直接與rdd2進行join。
  105. JavaPairRDD<Long, Tuple2<String, Row>> joinedRDD2 = commonRDD.join(rdd2);
  106.  
  107. // 將傾斜key join後的結果與普通key join後的結果,uinon起來。
  108. // 就是最終的join結果。
  109. JavaPairRDD<Long, Tuple2<String, Row>> joinedRDD = joinedRDD1.union(joinedRDD2);

解決方案七:使用隨機前綴和擴容RDD進行join

方案適用場景:如果在進行join操作時,RDD中有大量的key導致數據傾斜,那麼進行分拆key也沒什麼意義,此時就只能使用最後一種方案來解決問題了。

方案實現思路:

  • 該方案的實現思路基本和“解決方案六”類似,首先查看RDD/Hive表中的數據分佈情況,找到那個造成數據傾斜的RDD/Hive表,比如有多個key都對應了超過1萬條數據。
  • 然後將該RDD的每條數據都打上一個n以內的隨機前綴。
  • 同時對另外一個正常的RDD進行擴容,將每條數據都擴容成n條數據,擴容出來的每條數據都依次打上一個0~n的前綴。
  • 最後將兩個處理後的RDD進行join即可。

方案實現原理:將原先一樣的key通過附加隨機前綴變成不一樣的key,然後就可以將這些處理後的“不同 key”分散到多個task中去處理,而不是讓一個task處理大量的相同key。該方案與“解決方案六”的不同之處就在於,上一種方案是儘量只對少數傾 斜key對應的數據進行特殊處理,由於處理過程需要擴容RDD,因此上一種方案擴容RDD後對內存的佔用並不大;而這一種方案是針對有大量傾斜key的情 況,沒法將部分key拆分出來進行單獨處理,因此只能對整個RDD進行數據擴容,對內存資源要求很高。

方案優點:對join類型的數據傾斜基本都可以處理,而且效果也相對比較顯著,性能提升效果非常不錯。

方案缺點:該方案更多的是緩解數據傾斜,而不是徹底避免數據傾斜。而且需要對整個RDD進行擴容,對內存資源要求很高。

方案實踐經驗:曾經開發一個數據需求的時候,發現一個join導致了數據傾斜。優化之前,作業的執行時間大約是60分鐘左右;使用該方案優化之後,執行時間縮短到10分鐘左右,性能提升了6倍。

 
  1. // 首先將其中一個key分佈相對較爲均勻的RDD膨脹100倍。
  2. JavaPairRDD<String, Row> expandedRDD = rdd1.flatMapToPair(
  3. new PairFlatMapFunction<Tuple2<Long,Row>, String, Row>() {
  4. private static final long serialVersionUID = 1L;
  5. @Override
  6. public Iterable<Tuple2<String, Row>> call(Tuple2<Long, Row> tuple)
  7. throws Exception {
  8. List<Tuple2<String, Row>> list = new ArrayList<Tuple2<String, Row>>();
  9. for(int i = 0; i < 100; i++) {
  10. list.add(new Tuple2<String, Row>(0 + "_" + tuple._1, tuple._2));
  11. }
  12. return list;
  13. }
  14. });
  15.  
  16. // 其次,將另一個有數據傾斜key的RDD,每條數據都打上100以內的隨機前綴。
  17. JavaPairRDD<String, String> mappedRDD = rdd2.mapToPair(
  18. new PairFunction<Tuple2<Long,String>, String, String>() {
  19. private static final long serialVersionUID = 1L;
  20. @Override
  21. public Tuple2<String, String> call(Tuple2<Long, String> tuple)
  22. throws Exception {
  23. Random random = new Random();
  24. int prefix = random.nextInt(100);
  25. return new Tuple2<String, String>(prefix + "_" + tuple._1, tuple._2);
  26. }
  27. });
  28.  
  29. // 將兩個處理後的RDD進行join即可。
  30. JavaPairRDD<String, Tuple2<String, Row>> joinedRDD = mappedRDD.join(expandedRDD);

解決方案八:多種方案組合使用

在實踐中發現,很多情況下,如果只是處理較爲簡單的數據傾斜場景,那麼使用上述方案中的某一種基本就可以解決。但是如果要處理一個較爲複雜的數據傾 斜場景,那麼可能需要將多種方案組合起來使用。比如說,我們針對出現了多個數據傾斜環節的Spark作業,可以先運用解決方案一和二,預處理一部分數據, 並過濾一部分數據來緩解;其次可以對某些shuffle操作提升並行度,優化其性能;最後還可以針對不同的聚合或join操作,選擇一種方案來優化其性 能。大家需要對這些方案的思路和原理都透徹理解之後,在實踐中根據各種不同的情況,靈活運用多種方案,來解決自己的數據傾斜問題。

shuffle調優

調優概述

大多數Spark作業的性能主要就是消耗在了shuffle環節,因爲該環節包含了大量的磁盤IO、序列化、網絡數據傳輸等操作。因此,如果要讓作 業的性能更上一層樓,就有必要對shuffle過程進行調優。但是也必須提醒大家的是,影響一個Spark作業性能的因素,主要還是代碼開發、資源參數以 及數據傾斜,shuffle調優只能在整個Spark的性能調優中佔到一小部分而已。因此大家務必把握住調優的基本原則,千萬不要捨本逐末。下面我們就給 大家詳細講解shuffle的原理,以及相關參數的說明,同時給出各個參數的調優建議。

ShuffleManager發展概述

在Spark的源碼中,負責shuffle過程的執行、計算和處理的組件主要就是ShuffleManager,也即shuffle管理器。而隨着Spark的版本的發展,ShuffleManager也在不斷迭代,變得越來越先進。

在Spark 1.2以前,默認的shuffle計算引擎是HashShuffleManager。該ShuffleManager而HashShuffleManager有着一個非常嚴重的弊端,就是會產生大量的中間磁盤文件,進而由大量的磁盤IO操作影響了性能。

因此在Spark 1.2以後的版本中,默認的ShuffleManager改成了SortShuffleManager。SortShuffleManager相較於 HashShuffleManager來說,有了一定的改進。主要就在於,每個Task在進行shuffle操作時,雖然也會產生較多的臨時磁盤文件,但 是最後會將所有的臨時文件合併(merge)成一個磁盤文件,因此每個Task就只有一個磁盤文件。在下一個stage的shuffle read task拉取自己的數據時,只要根據索引讀取每個磁盤文件中的部分數據即可。

下面我們詳細分析一下HashShuffleManager和SortShuffleManager的原理。

HashShuffleManager運行原理

未經優化的HashShuffleManager

下圖說明了未經優化的HashShuffleManager的原理。這裏我們先明確一個假設前提:每個Executor只有1個CPU core,也就是說,無論這個Executor上分配多少個task線程,同一時間都只能執行一個task線程。

我們先從shuffle write開始說起。shuffle write階段,主要就是在一個stage結束計算之後,爲了下一個stage可以執行shuffle類的算子(比如reduceByKey),而將每個 task處理的數據按key進行“分類”。所謂“分類”,就是對相同的key執行hash算法,從而將相同key都寫入同一個磁盤文件中,而每一個磁盤文 件都只屬於下游stage的一個task。在將數據寫入磁盤之前,會先將數據寫入內存緩衝中,當內存緩衝填滿之後,纔會溢寫到磁盤文件中去。

那麼每個執行shuffle write的task,要爲下一個stage創建多少個磁盤文件呢?很簡單,下一個stage的task有多少個,當前stage的每個task就要創建 多少份磁盤文件。比如下一個stage總共有100個task,那麼當前stage的每個task都要創建100份磁盤文件。如果當前stage有50個 task,總共有10個Executor,每個Executor執行5個Task,那麼每個Executor上總共就要創建500個磁盤文件,所有 Executor上會創建5000個磁盤文件。由此可見,未經優化的shuffle write操作所產生的磁盤文件的數量是極其驚人的。

接着我們來說說shuffle read。shuffle read,通常就是一個stage剛開始時要做的事情。此時該stage的每一個task就需要將上一個stage的計算結果中的所有相同key,從各個 節點上通過網絡都拉取到自己所在的節點上,然後進行key的聚合或連接等操作。由於shuffle write的過程中,task給下游stage的每個task都創建了一個磁盤文件,因此shuffle read的過程中,每個task只要從上游stage的所有task所在節點上,拉取屬於自己的那一個磁盤文件即可。

shuffle read的拉取過程是一邊拉取一邊進行聚合的。每個shuffle read task都會有一個自己的buffer緩衝,每次都只能拉取與buffer緩衝相同大小的數據,然後通過內存中的一個Map進行聚合等操作。聚合完一批數 據後,再拉取下一批數據,並放到buffer緩衝中進行聚合操作。以此類推,直到最後將所有數據到拉取完,並得到最終的結果。

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優化後的HashShuffleManager

下圖說明了優化後的HashShuffleManager的原理。這裏說的優化,是指我們可以設置一個參 數,spark.shuffle.consolidateFiles。該參數默認值爲false,將其設置爲true即可開啓優化機制。通常來說,如果我 們使用HashShuffleManager,那麼都建議開啓這個選項。

開啓consolidate機制之後,在shuffle write過程中,task就不是爲下游stage的每個task創建一個磁盤文件了。此時會出現shuffleFileGroup的概念,每個 shuffleFileGroup會對應一批磁盤文件,磁盤文件的數量與下游stage的task數量是相同的。一個Executor上有多少個CPU core,就可以並行執行多少個task。而第一批並行執行的每個task都會創建一個shuffleFileGroup,並將數據寫入對應的磁盤文件 內。

當Executor的CPU core執行完一批task,接着執行下一批task時,下一批task就會複用之前已有的shuffleFileGroup,包括其中的磁盤文件。也就 是說,此時task會將數據寫入已有的磁盤文件中,而不會寫入新的磁盤文件中。因此,consolidate機制允許不同的task複用同一批磁盤文件, 這樣就可以有效將多個task的磁盤文件進行一定程度上的合併,從而大幅度減少磁盤文件的數量,進而提升shuffle write的性能。

假設第二個stage有100個task,第一個stage有50個task,總共還是有10個Executor,每個Executor執行5個 task。那麼原本使用未經優化的HashShuffleManager時,每個Executor會產生500個磁盤文件,所有Executor會產生 5000個磁盤文件的。但是此時經過優化之後,每個Executor創建的磁盤文件的數量的計算公式爲:CPU core的數量 * 下一個stage的task數量。也就是說,每個Executor此時只會創建100個磁盤文件,所有Executor只會創建1000個磁盤文件。

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SortShuffleManager運行原理

SortShuffleManager的運行機制主要分成兩種,一種是普通運行機制,另一種是bypass運行機制。當shuffle read task的數量小於等於spark.shuffle.sort.bypassMergeThreshold參數的值時(默認爲200),就會啓用 bypass機制。

普通運行機制

下圖說明了普通的SortShuffleManager的原理。在該模式下,數據會先寫入一個內存數據結構中,此時根據不同的shuffle算子, 可能選用不同的數據結構。如果是reduceByKey這種聚合類的shuffle算子,那麼會選用Map數據結構,一邊通過Map進行聚合,一邊寫入內 存;如果是join這種普通的shuffle算子,那麼會選用Array數據結構,直接寫入內存。接着,每寫一條數據進入內存數據結構之後,就會判斷一 下,是否達到了某個臨界閾值。如果達到臨界閾值的話,那麼就會嘗試將內存數據結構中的數據溢寫到磁盤,然後清空內存數據結構。

在溢寫到磁盤文件之前,會先根據key對內存數據結構中已有的數據進行排序。排序過後,會分批將數據寫入磁盤文件。默認的batch數量是 10000條,也就是說,排序好的數據,會以每批1萬條數據的形式分批寫入磁盤文件。寫入磁盤文件是通過Java的 BufferedOutputStream實現的。BufferedOutputStream是Java的緩衝輸出流,首先會將數據緩衝在內存中,當內存 緩衝滿溢之後再一次寫入磁盤文件中,這樣可以減少磁盤IO次數,提升性能。

一個task將所有數據寫入內存數據結構的過程中,會發生多次磁盤溢寫操作,也就會產生多個臨時文件。最後會將之前所有的臨時磁盤文件都進行合併, 這就是merge過程,此時會將之前所有臨時磁盤文件中的數據讀取出來,然後依次寫入最終的磁盤文件之中。此外,由於一個task就只對應一個磁盤文件, 也就意味着該task爲下游stage的task準備的數據都在這一個文件中,因此還會單獨寫一份索引文件,其中標識了下游各個task的數據在文件中的 start offset與end offset。

SortShuffleManager由於有一個磁盤文件merge的過程,因此大大減少了文件數量。比如第一個stage有50個task,總共 有10個Executor,每個Executor執行5個task,而第二個stage有100個task。由於每個task最終只有一個磁盤文件,因此 此時每個Executor上只有5個磁盤文件,所有Executor只有50個磁盤文件。

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bypass運行機制

下圖說明了bypass SortShuffleManager的原理。bypass運行機制的觸發條件如下:

  • shuffle map task數量小於spark.shuffle.sort.bypassMergeThreshold參數的值。
  • 不是聚合類的shuffle算子(比如reduceByKey)。

此時task會爲每個下游task都創建一個臨時磁盤文件,並將數據按key進行hash然後根據key的hash值,將key寫入對應的磁盤文件 之中。當然,寫入磁盤文件時也是先寫入內存緩衝,緩衝寫滿之後再溢寫到磁盤文件的。最後,同樣會將所有臨時磁盤文件都合併成一個磁盤文件,並創建一個單獨 的索引文件。

該過程的磁盤寫機制其實跟未經優化的HashShuffleManager是一模一樣的,因爲都要創建數量驚人的磁盤文件,只是在最後會做一個磁盤 文件的合併而已。因此少量的最終磁盤文件,也讓該機制相對未經優化的HashShuffleManager來說,shuffle read的性能會更好。

而該機制與普通SortShuffleManager運行機制的不同在於:第一,磁盤寫機制不同;第二,不會進行排序。也就是說,啓用該機制的最大好處在於,shuffle write過程中,不需要進行數據的排序操作,也就節省掉了這部分的性能開銷。

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shuffle相關參數調優

以下是Shffule過程中的一些主要參數,這裏詳細講解了各個參數的功能、默認值以及基於實踐經驗給出的調優建議。

spark.shuffle.file.buffer

  • 默認值:32k
  • 參數說明:該參數用於設置shuffle write task的BufferedOutputStream的buffer緩衝大小。將數據寫到磁盤文件之前,會先寫入buffer緩衝中,待緩衝寫滿之後,纔會溢寫到磁盤。
  • 調優建議:如果作業可用的內存資源較爲充足的話,可以適當增加這個參數的大小(比如64k),從而減少shuffle write過程中溢寫磁盤文件的次數,也就可以減少磁盤IO次數,進而提升性能。在實踐中發現,合理調節該參數,性能會有1%~5%的提升。

spark.reducer.maxSizeInFlight

  • 默認值:48m
  • 參數說明:該參數用於設置shuffle read task的buffer緩衝大小,而這個buffer緩衝決定了每次能夠拉取多少數據。
  • 調優建議:如果作業可用的內存資源較爲充足的話,可以適當增加這個參數的大小(比如96m),從而減少拉取數據的次數,也就可以減少網絡傳輸的次數,進而提升性能。在實踐中發現,合理調節該參數,性能會有1%~5%的提升。

spark.shuffle.io.maxRetries

  • 默認值:3
  • 參數說明:shuffle read task從shuffle write task所在節點拉取屬於自己的數據時,如果因爲網絡異常導致拉取失敗,是會自動進行重試的。該參數就代表了可以重試的最大次數。如果在指定次數之內拉取 還是沒有成功,就可能會導致作業執行失敗。
  • 調優建議:對於那些包含了特別耗時的shuffle操作的作業,建議增加重試最大次數(比如60次),以避免由於JVM的full gc或者網絡不穩定等因素導致的數據拉取失敗。在實踐中發現,對於針對超大數據量(數十億~上百億)的shuffle過程,調節該參數可以大幅度提升穩定 性。

spark.shuffle.io.retryWait

  • 默認值:5s
  • 參數說明:具體解釋同上,該參數代表了每次重試拉取數據的等待間隔,默認是5s。
  • 調優建議:建議加大間隔時長(比如60s),以增加shuffle操作的穩定性。

spark.shuffle.memoryFraction

  • 默認值:0.2
  • 參數說明:該參數代表了Executor內存中,分配給shuffle read task進行聚合操作的內存比例,默認是20%。
  • 調優建議:在資源參數調優中講解過這個參數。如果內存充足,而且很少使用持久化操作,建議調高這個比例,給shuffle read的聚合操作更多內存,以避免由於內存不足導致聚合過程中頻繁讀寫磁盤。在實踐中發現,合理調節該參數可以將性能提升10%左右。

spark.shuffle.manager

  • 默認值:sort
  • 參數說明:該參數用於設置ShuffleManager的類型。Spark 1.5以後,有三個可選項:hash、sort和tungsten-sort。HashShuffleManager是Spark 1.2以前的默認選項,但是Spark 1.2以及之後的版本默認都是SortShuffleManager了。tungsten-sort與sort類似,但是使用了tungsten計劃中的 堆外內存管理機制,內存使用效率更高。
  • 調優建議:由於SortShuffleManager默認會對數據進行排序,因此如果你的業務邏輯中需要該排序機制的話,則使用默認的 SortShuffleManager就可以;而如果你的業務邏輯不需要對數據進行排序,那麼建議參考後面的幾個參數調優,通過bypass機制或優化的 HashShuffleManager來避免排序操作,同時提供較好的磁盤讀寫性能。這裏要注意的是,tungsten-sort要慎用,因爲之前發現了 一些相應的bug。

spark.shuffle.sort.bypassMergeThreshold

  • 默認值:200
  • 參數說明:當ShuffleManager爲SortShuffleManager時,如果shuffle read task的數量小於這個閾值(默認是200),則shuffle write過程中不會進行排序操作,而是直接按照未經優化的HashShuffleManager的方式去寫數據,但是最後會將每個task產生的所有臨 時磁盤文件都合併成一個文件,並會創建單獨的索引文件。
  • 調優建議:當你使用SortShuffleManager時,如果的確不需要排序操作,那麼建議將這個參數調大一些,大於shuffle read task的數量。那麼此時就會自動啓用bypass機制,map-side就不會進行排序了,減少了排序的性能開銷。但是這種方式下,依然會產生大量的磁 盤文件,因此shuffle write性能有待提高。

spark.shuffle.consolidateFiles

  • 默認值:false
  • 參數說明:如果使用HashShuffleManager,該參數有效。如果設置爲true,那麼就會開啓consolidate機制,會大幅度 合併shuffle write的輸出文件,對於shuffle read task數量特別多的情況下,這種方法可以極大地減少磁盤IO開銷,提升性能。
  • 調優建議:如果的確不需要SortShuffleManager的排序機制,那麼除了使用bypass機制,還可以嘗試將 spark.shffle.manager參數手動指定爲hash,使用HashShuffleManager,同時開啓consolidate機制。在 實踐中嘗試過,發現其性能比開啓了bypass機制的SortShuffleManager要高出10%~30%。
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